256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3194 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_3194  ATPase  100 
 
 
260 aa  532  1e-150  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2602  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  77.13 
 
 
266 aa  419  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0558  putative nitric oxide reductase activation protein NorQ  73.36 
 
 
271 aa  395  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.365117  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0621  regulatory protein NirQ  70.31 
 
 
260 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3121  ATPase  69.26 
 
 
260 aa  372  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.209587  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0119  ATPase  69.53 
 
 
270 aa  371  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06770  regulatory protein NirQ  70.92 
 
 
260 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2319  denitrification regulatory protein nirQ  67.7 
 
 
260 aa  364  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.101351  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1467  ATPase  70.66 
 
 
277 aa  356  2e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.232616 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2119  ATPase  67.32 
 
 
270 aa  353  1e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.976188 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1848  ATPase  65.37 
 
 
275 aa  345  4e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2090  NorD protein required for nitric oxide reductase (Nor) activity (putative chaperone, ATPase)  63.67 
 
 
269 aa  342  3e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.835685 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3185  nitric oxide reductase Q protein  65.88 
 
 
268 aa  342  3e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.540661  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4388  ATPase  63.92 
 
 
270 aa  337  8e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0269278  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1643  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  64.17 
 
 
270 aa  337  1e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0250  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  63.92 
 
 
270 aa  336  2e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.326852  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0226  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  64.31 
 
 
270 aa  336  2e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1517  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  64.06 
 
 
271 aa  336  3e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1978  ATPase  60.08 
 
 
285 aa  328  7e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6287  ATPase  62.2 
 
 
272 aa  322  3e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2482  ATPase  63.81 
 
 
270 aa  322  3e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.986613 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1977  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  58.37 
 
 
265 aa  312  4e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0869  nitric oxide reductase activation protein NorQ  58.27 
 
 
270 aa  312  4e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1967  ATPase  60.16 
 
 
265 aa  312  4e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0322  NorQ protein required for nitric oxide reductase activity  60.16 
 
 
265 aa  312  4e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0651  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  56.03 
 
 
286 aa  311  8e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.486939  normal  0.117571 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2637  rubisco activation protein CbbQ  58.43 
 
 
268 aa  309  3e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2164  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  58.2 
 
 
286 aa  309  4e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0972  ATPase  60.16 
 
 
265 aa  308  6e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.750079  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2766  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  59.45 
 
 
267 aa  307  1e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.27338  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3434  ATPase  59.45 
 
 
267 aa  306  2e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.513297  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2684  ATPase  56.98 
 
 
279 aa  306  2e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1094  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  56.76 
 
 
267 aa  306  3e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1254  ATPase  57.87 
 
 
284 aa  305  4e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4904  ATPase  56.69 
 
 
272 aa  305  4e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3640  ATPase  56.08 
 
 
285 aa  305  7e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.232524  normal  0.0364996 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2536  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  56.59 
 
 
276 aa  305  7e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.95955  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2164  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  56.59 
 
 
271 aa  304  1e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.152394  hitchhiker  2.22341e-06 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2838  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  57.87 
 
 
268 aa  301  1e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.990465  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1815  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  56.47 
 
 
272 aa  298  6e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2156  CbbQ protein  56.47 
 
 
272 aa  298  6e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3766  CbbQ/NirQ/NorQ domain-containing protein  56.37 
 
 
268 aa  295  4e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2662  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  54.72 
 
 
267 aa  294  1e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3053  CbbQ protein  54.72 
 
 
267 aa  294  1e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0871  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  53.49 
 
 
267 aa  292  4e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3190  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  53.49 
 
 
267 aa  290  2e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.209478  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1499  ATPase  52.71 
 
 
267 aa  289  3e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00779848  normal  0.0229938 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2622  rubisco activation protein CbbQ  53.88 
 
 
267 aa  289  4e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1976  ATPase  54.72 
 
 
307 aa  287  1e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.919685  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2746  cbbQ protein  56.3 
 
 
266 aa  286  2e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.728078  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0423  ATPase  54.12 
 
 
266 aa  286  2e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0131  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  55.12 
 
 
268 aa  286  3e-76  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4344  ATPase  53.49 
 
 
278 aa  285  4e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.785303  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0905  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  52.76 
 
 
267 aa  285  4e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1044  CbbQ/NirQ/NorQ C-terminal domain-containing protein  54.26 
 
 
268 aa  285  5e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.552849  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4065  hypothetical protein  55.51 
 
 
271 aa  284  1e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.312415 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1844  ATPase AAA_5  54.02 
 
 
279 aa  284  1e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.79049  normal  0.260882 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3134  ATPase  50.38 
 
 
280 aa  283  2e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4196  ATPase  55.47 
 
 
273 aa  283  2e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.220432  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2576  ATPase  57.03 
 
 
283 aa  282  3e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0133764  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2538  ATPase  57.03 
 
 
283 aa  282  3e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1547  ATPase  53.73 
 
 
269 aa  283  3e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.591966  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2583  ATPase  57.03 
 
 
283 aa  282  3e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1376  CbbQ/NirQ/NorQ domain protein  51.56 
 
 
267 aa  281  6e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.428584  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1678  p30 protein  51.56 
 
 
267 aa  281  6e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.155235  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0601  ATPase  55.56 
 
 
265 aa  281  1e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.309548  normal  0.0418283 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0429  ATPase  56.12 
 
 
272 aa  280  2e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3615  nitric-oxide reductase NorQ protein  55.51 
 
 
280 aa  278  4e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0071998  normal  0.061838 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0824  nitric oxide reductase activation protein NorQ  54.72 
 
 
270 aa  278  6e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.569782  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1966  putative cbbQ/nirQ/norQ/gpvN family protein  51.19 
 
 
266 aa  278  6e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.947732 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2458  ATPase  53.97 
 
 
273 aa  276  2e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3738  ATPase  53.08 
 
 
282 aa  275  4e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.232377  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3799  ATPase  53.08 
 
 
282 aa  275  4e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00566869 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3726  ATPase  53.08 
 
 
282 aa  275  4e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0460635  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4155  ATPase  57.65 
 
 
282 aa  275  8e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.175272  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1772  ATPase  50.59 
 
 
266 aa  250  2e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4975  ATPase  49.8 
 
 
267 aa  244  9e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.352604  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4418  ATPase  49.8 
 
 
267 aa  241  7e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.999238  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4505  ATPase  49.8 
 
 
267 aa  241  7e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4799  ATPase  49.8 
 
 
267 aa  241  9e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.446718  normal  0.789271 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3252  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.78 
 
 
308 aa  105  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.255293  normal  0.0133684 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0979  CbbQ/NirQ/NorQ/GpvN family protein  26.67 
 
 
263 aa  97.8  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2541  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.97 
 
 
291 aa  92.8  5e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1470  ATPase  27.35 
 
 
263 aa  90.5  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.33277  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1499  ATPase  27.35 
 
 
263 aa  90.5  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1515  ATPase  32.54 
 
 
264 aa  89.7  5e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00619619 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1633  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.65 
 
 
290 aa  86.7  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  1.22684e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1683  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  33.47 
 
 
278 aa  85.1  9e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0262  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  29.03 
 
 
307 aa  85.1  1e-15  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0207  ATPase  29.03 
 
 
307 aa  84.7  1e-15  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2158  cobS protein, putative  30.51 
 
 
313 aa  84  2e-15  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0753  putative norQ protein  27.41 
 
 
297 aa  82.4  7e-15  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0693  norQ protein, putative  27.41 
 
 
297 aa  82  8e-15  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0661  putative norQ protein  27.41 
 
 
297 aa  82  9e-15  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0535  nitric-oxide reductase  27.41 
 
 
297 aa  82  9e-15  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0535  nitric-oxide reductase  27.41 
 
 
297 aa  82  9e-15  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0591  NorQ protein  27.41 
 
 
297 aa  82  9e-15  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0679  putative norQ protein  27.41 
 
 
297 aa  82  9e-15  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.58877e-09 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0624  norq protein  27.41 
 
 
297 aa  82  9e-15  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.695502  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0538  ATPase  27.41 
 
 
297 aa  81.3  1e-14  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>