More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3192 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3192  putative additional subunit of nitric oxide reductase (Nor) complex, membrane protein  100 
 
 		 201 aa  411  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0560  putative additional subunit of nitric oxide reductase (Nor) complex, membrane protein  57.64 
 
 		 197 aa  209  2e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0830367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2600  cytochrome c oxidase subunit III  57.14 
 
 		 204 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1918  cytochrome c oxidase subunit III family protein  43.62 
 
 		 204 aa  167  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2320  cytochrome c oxidase subunit III family protein  43.26 
 
 		 174 aa  141  8e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0210247  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1250  cytochrome c oxidase, subunit III  44.22 
 
 		 197 aa  135  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.287461  hitchhiker  0.0000975001 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0819  cytochrome c oxidase, subunit III  36.17 
 
 		 203 aa  135  4e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0272  cytochrome c oxidase subunit III family protein  39.7 
 
 		 206 aa  134  9e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2086  NorE protein involved in nitric oxide reduction  39.8 
 
 		 192 aa  134  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.289144  normal  0.597939 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4575  cytochrome c oxidase, subunit III  36.84 
 
 		 200 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.383719 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4156  cytochrome c oxidase subunit III family protein  38.59 
 
 		 205 aa  130  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.487941  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3118  cytochrome c oxidase, subunit III  42.25 
 
 		 191 aa  128  7.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1968  cytochrome c oxidase, subunit III  37.95 
 
 		 212 aa  124  6e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4376  cytochrome c oxidase, subunit III  37.17 
 
 		 193 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265005  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4757  cytochrome c oxidase, subunit III  37.17 
 
 		 193 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0954288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4463  cytochrome c oxidase, subunit III  37.17 
 
 		 193 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.327335  normal  0.0356516 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3795  cytochrome c oxidase, subunit III  36.14 
 
 		 198 aa  122  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478856  normal  0.908261 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1639  cytochrome c oxidase subunit III  36.98 
 
 		 202 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1813  cytochrome c oxidase, subunit III  35.71 
 
 		 194 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3791  cytochrome c oxidase, subunit III  34.83 
 
 		 198 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0359951  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3864  cytochrome c oxidase, subunit III  34.83 
 
 		 198 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00290565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1788  cytochrome c oxidase subunit III  33.83 
 
 		 208 aa  117  7.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4932  cytochrome c oxidase, subunit III  36.73 
 
 		 193 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.318049  normal  0.0324373 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0231  cytochrome c oxidase subunit III  35.08 
 
 		 226 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38618  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1065  putative denitrification protein NorE  34.33 
 
 		 201 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0077  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  36.11 
 
 		 209 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0129097  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0622  putative cytochrome c oxidase subunit  40.21 
 
 		 190 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.524381  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1541  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  36.11 
 
 		 209 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0445  putative denitrification protein NorE  33.51 
 
 		 199 aa  111  8.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000224014  normal  0.5524 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0998  cytochrome c oxidase, subunit III  35.56 
 
 		 209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1163  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  35.56 
 
 		 209 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.322361  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2238  cytochrome c oxidase, subunit III family protein  35.56 
 
 		 209 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.394617  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0911  cytochrome c oxidase, subunit III  35.56 
 
 		 209 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3187  nitric oxide reductase E protein  33.83 
 
 		 184 aa  109  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1678  cytochrome c oxidase subunit III  31.6 
 
 		 234 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1602  cytochrome c oxidase subunit III  31.13 
 
 		 234 aa  108  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0896497  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1970  putative denitrification protein NorE  32.67 
 
 		 201 aa  107  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2273  cytochrome c oxidase, subunit III  31.13 
 
 		 235 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.545672  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1977  cytochrome c oxidase, subunit III  35.36 
 
 		 243 aa  106  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.888389  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2224  putative denitrification protein NorE  31.4 
 
 		 202 aa  105  6e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1513  cytochrome c oxidase subunit III  39.01 
 
 		 184 aa  103  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2116  cytochrome c oxidase, subunit III  41.99 
 
 		 198 aa  102  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.479128 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0407  cytochrome c oxidase, subunit III  32.99 
 
 		 196 aa  100  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06790  putative cytochrome c oxidase subunit  38.89 
 
 		 175 aa  98.6  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2704  cytochrome c oxidase subunit III  33.16 
 
 		 224 aa  97.4  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  0.321582 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2421  cytochrome c oxidase subunit III  28.19 
 
 		 262 aa  95.9  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0162196  normal  0.448728 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0853  cytochrome c oxidase subunit III  29.67 
 
 		 209 aa  95.9  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0857  cytochrome c oxidase subunit III  29.67 
 
 		 209 aa  95.9  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0805  cytochrome c oxidase, subunit III  29.19 
 
 		 209 aa  94  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0220  cytochrome c oxidase, subunit III  35.9 
 
 		 200 aa  90.9  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2604  cytochrome c oxidase subunit III  35.78 
 
 		 195 aa  90.9  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.204507 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1900  Cytochrome-c oxidase  30.89 
 
 		 208 aa  90.1  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.910491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0044  cytochrome c oxidase subunit III  32.45 
 
 		 199 aa  89.4  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.388042  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0850  cytochrome c oxidase subunit III  28.14 
 
 		 211 aa  89.4  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4437  cytochrome c oxidase, subunit III  30.29 
 
 		 209 aa  88.6  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.424494  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1540  cytochrome c oxidase subunit III  35.05 
 
 		 199 aa  88.6  6e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1586  cytochrome c oxidase subunit III  32.45 
 
 		 234 aa  88.6  6e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0535  cytochrome c oxidase subunit III  34.22 
 
 		 198 aa  86.7  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177568 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2480  cytochrome c oxidase, subunit III  34.88 
 
 		 178 aa  85.5  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6884  cytochrome c oxidase subunit III  30.81 
 
 		 215 aa  85.1  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3679  hypothetical protein  33.15 
 
 		 202 aa  84.7  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.668184 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4384  cytochrome c oxidase subunit III  30.98 
 
 		 187 aa  84.7  9e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0246  cytochrome c oxidase, subunit III  29.94 
 
 		 189 aa  84  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1824  cytochrome c oxidase, subunit III  31.79 
 
 		 199 aa  84  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.240701  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3105  cytochrome c oxidase subunit I  30.61 
 
 		 819 aa  81.6  0.000000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1346  cytochrome c oxidase, subunit III  30.43 
 
 		 209 aa  81.3  0.000000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0703851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0222  cytochrome c oxidase, subunit III  30.36 
 
 		 234 aa  80.1  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04411  cytochrome c oxidase, subunit III  30.69 
 
 		 206 aa  80.1  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.738181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1775  cytochrome c oxidase, subunit III  31.31 
 
 		 201 aa  79.7  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.556435  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06401  cytochrome c oxidase, subunit III  32.76 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0898782 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1756  cytochrome c oxidase subunit III  33.14 
 
 		 209 aa  79.3  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0786  cytochrome c oxidase subunit I  29.51 
 
 		 832 aa  79  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0454101  normal  0.689784 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5815  cytochrome c oxidase subunit III  27.5 
 
 		 225 aa  79  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.186525  hitchhiker  0.0033512 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1036  cytochrome c oxidase subunit III  28.36 
 
 		 219 aa  78.6  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0806413 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1246  cytochrome/quinol oxidase subunit 3  28.19 
 
 		 214 aa  78.2  0.00000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04981  cytochrome c oxidase, subunit III  31.43 
 
 		 201 aa  78.2  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.174019 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1777  cytochrome c oxidase, subunit III  32.22 
 
 		 211 aa  77.8  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.723591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2248  cytochrome c oxidase subunit I  32.31 
 
 		 825 aa  77  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1213  cytochrome c oxidase subunit III  30.81 
 
 		 208 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.84888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0448  cytochrome c oxidase subunit III  30.96 
 
 		 197 aa  75.9  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0588906 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4073  cytochrome c oxidase subunit III  29.48 
 
 		 214 aa  76.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3556  cytochrome c oxidase subunit III  30.17 
 
 		 203 aa  75.9  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2994  cytochrome c oxidase, subunit III  26.34 
 
 		 229 aa  75.1  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0443  cytochrome c oxidase, subunit III  30.43 
 
 		 200 aa  75.1  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.547798  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0263  cytochrome c oxidase subunit I  29.94 
 
 		 827 aa  75.1  0.0000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0374509  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0120  cytochrome c oxidase, subunit III  27.54 
 
 		 295 aa  74.7  0.0000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.532779  normal  0.0155575 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0043  cytochrome c oxidase subunit III  33.33 
 
 		 199 aa  74.7  0.0000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000712999 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0314  cytochrome c oxidase subunit III  35.71 
 
 		 291 aa  74.7  0.0000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0965369 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0606  cytochrome c oxidase subunit III  32 
 
 		 201 aa  74.7  0.0000000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.184913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0530  cytochrome c oxidase subunit III  32.49 
 
 		 207 aa  74.3  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0106  cytochrome c oxidase, subunit III  26.95 
 
 		 295 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.753759  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2265  cytochrome c oxidase, subunit III  29.05 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  26.95 
 
 		 295 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05061  cytochrome c oxidase, subunit III  31.4 
 
 		 200 aa  72.8  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.581628  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3575  cytochrome c oxidase  32.49 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0125  cytochrome c oxidase subunit III  28.93 
 
 		 295 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4120  Cytochrome-c oxidase  28.24 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2070  cytochrome c oxidase subunit III  26.84 
 
 		 204 aa  72.4  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.515134 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2714  cytochrome c oxidase, subunit III  34.29 
 
 		 295 aa  72.4  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.183769 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0569  cytochrome c oxidase subunit III  30.98 
 
 		 205 aa  72  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>