More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3158 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3158  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 420 aa  841    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.633544  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2238  mechanosensitive ion channel family protein  45.15 
 
 		 449 aa  322  8e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1129  mechanosensitive ion channel family protein  45.15 
 
 		 449 aa  322  8e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1029  mechanosensitive ion channel family protein  45.15 
 
 		 450 aa  322  8e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.165892  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0971  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  45.15 
 
 		 450 aa  322  8e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2654  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  45.15 
 
 		 450 aa  322  8e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0975  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  45.15 
 
 		 450 aa  322  8e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2108  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  45.15 
 
 		 450 aa  322  8e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0774  mechanosensitive ion channel family protein  44.9 
 
 		 450 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3155  MscS Mechanosensitive ion channel  44.08 
 
 		 451 aa  311  2e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00105623  normal  0.0641339 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0307  MscS mechanosensitive ion channel  40.83 
 
 		 435 aa  311  2e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.381926  normal  0.0553472 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2555  MscS mechanosensitive ion channel  42.25 
 
 		 460 aa  310  4e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2426  MscS mechanosensitive ion channel  42.18 
 
 		 460 aa  308  9e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.610338  hitchhiker  0.0000133571 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0811  small-conductance mechanosensitive channel protein  42.79 
 
 		 451 aa  300  4e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0578  MscS mechanosensitive ion channel  42.65 
 
 		 451 aa  298  1e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.605561  normal  0.183245 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2739  MscS mechanosensitive ion channel  44.31 
 
 		 457 aa  291  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2330  MscS Mechanosensitive ion channel  42.69 
 
 		 458 aa  286  7e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.194216  normal  0.152351 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2876  MscS mechanosensitive ion channel  42.65 
 
 		 456 aa  278  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2622  MscS mechanosensitive ion channel  38.4 
 
 		 412 aa  276  4e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0787  MscS mechanosensitive ion channel  42.55 
 
 		 462 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.0384222 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5840  MscS mechanosensitive ion channel  42.08 
 
 		 454 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.770857 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2719  MscS Mechanosensitive ion channel  42.22 
 
 		 457 aa  268  2e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2451  hypothetical protein  43.94 
 
 		 447 aa  266  5e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2389  MscS mechanosensitive ion channel  36.08 
 
 		 429 aa  265  8.999999999999999e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3144  MscS mechanosensitive ion channel  36.63 
 
 		 444 aa  263  4.999999999999999e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0287681 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2533  MscS mechanosensitive ion channel  41.49 
 
 		 505 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.173747 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2508  MscS mechanosensitive ion channel  40.91 
 
 		 461 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.38707  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1897  MscS mechanosensitive ion channel  40.91 
 
 		 461 aa  256  7e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1222  MscS mechanosensitive ion channel  38.92 
 
 		 451 aa  254  3e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.110808  normal  0.111103 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3066  MscS mechanosensitive ion channel  41.62 
 
 		 452 aa  247  2e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2595  hypothetical protein  40.1 
 
 		 422 aa  246  6e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0637117  normal  0.346925 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3375  MscS Mechanosensitive ion channel  38.36 
 
 		 426 aa  245  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.126679  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2527  MscS mechanosensitive ion channel  39.94 
 
 		 427 aa  236  8e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1247  transmembrane protein  37.69 
 
 		 435 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.072199  normal  0.308743 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2167  MscS mechanosensitive ion channel  42.3 
 
 		 437 aa  226  7e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.880536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2811  MscS mechanosensitive ion channel  38.88 
 
 		 427 aa  216  5.9999999999999996e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.159605  normal  0.231648 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2300  MscS Mechanosensitive ion channel  38.88 
 
 		 427 aa  216  7e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2646  MscS mechanosensitive ion channel  41.79 
 
 		 322 aa  214  2.9999999999999995e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0136  MscS mechanosensitive ion channel  36.16 
 
 		 451 aa  208  2e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.100396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1816  mscS family protein  36.93 
 
 		 448 aa  207  4e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.316092  normal  0.285124 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0156  MscS mechanosensitive ion channel  32.92 
 
 		 437 aa  200  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0421972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1699  MscS mechanosensitive ion channel  32.45 
 
 		 456 aa  197  2.0000000000000003e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.254155  normal  0.22429 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0579  MscS mechanosensitive ion channel  32.66 
 
 		 440 aa  193  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0872803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3058  MscS mechanosensitive ion channel  42.73 
 
 		 435 aa  194  4e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.914338 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0057  MscS mechanosensitive ion channel  32.92 
 
 		 437 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2555  MscS mechanosensitive ion channel  34.8 
 
 		 321 aa  190  5e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7380  mechanosensitive ion channel protein  30.49 
 
 		 439 aa  190  5e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3427  MscS mechanosensitive ion channel  37.41 
 
 		 428 aa  182  7e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.259375  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2507  MscS mechanosensitive ion channel  35.15 
 
 		 475 aa  182  1e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6436  MscS Mechanosensitive ion channel  36.27 
 
 		 432 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.227593 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0757  MscS mechanosensitive ion channel  34.39 
 
 		 479 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2581  MscS mechanosensitive ion channel  35.21 
 
 		 298 aa  167  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4436  MscS mechanosensitive ion channel  34.92 
 
 		 432 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.506103  normal  0.992693 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2316  mechanosensitive ion channel family protein  34.44 
 
 		 291 aa  161  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  31.42 
 
 		 299 aa  161  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  33.83 
 
 		 806 aa  162  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01467  mechanosensitive ion channel family protein  31.91 
 
 		 441 aa  155  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.619169  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0209  MscS mechanosensitive ion channel  29.55 
 
 		 685 aa  153  7e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5091  MscS Mechanosensitive ion channel  37.75 
 
 		 637 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148956  normal  0.0183068 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2010  MscS Mechanosensitive ion channel  26.86 
 
 		 447 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2035  MscS Mechanosensitive ion channel  26.38 
 
 		 447 aa  149  8e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.200455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3826  MscS Mechanosensitive ion channel  27.23 
 
 		 444 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1311  MscS Mechanosensitive ion channel  38.22 
 
 		 636 aa  146  6e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1339  MscS Mechanosensitive ion channel  38.22 
 
 		 636 aa  146  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323872 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2983  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  33.47 
 
 		 1144 aa  145  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2608  mechanosensitive ion channel family protein  30.36 
 
 		 825 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.349131  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1453  MscS mechanosensitive ion channel  33.18 
 
 		 1105 aa  141  1.9999999999999998e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0559  potassium efflux protein KefA  35.14 
 
 		 1111 aa  140  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000200237 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1934  mechanosensitive ion channel family protein  32.52 
 
 		 287 aa  140  3.9999999999999997e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.117079  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0533  MscS Mechanosensitive ion channel  31.77 
 
 		 472 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3172  MscS Mechanosensitive ion channel  32.76 
 
 		 784 aa  137  4e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1800  MscS mechanosensitive ion channel  32.95 
 
 		 859 aa  137  5e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000387595 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3804  MscS Mechanosensitive ion channel  30.26 
 
 		 495 aa  136  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3013  MscS mechanosensitive ion channel  36.59 
 
 		 843 aa  136  7.000000000000001e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3012  MscS mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 		 297 aa  135  9e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2094  MscS mechanosensitive ion channel  31.6 
 
 		 860 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.183403  normal  0.195823 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2215  small-conductance mechanosensitive channel-like  32.71 
 
 		 431 aa  135  9.999999999999999e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0212215  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2560  small-conductance mechanosensitive channel-like  31.95 
 
 		 440 aa  135  9.999999999999999e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3407  MscS mechanosensitive ion channel  31.62 
 
 		 832 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.121329  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0445  potassium efflux protein KefA  30.54 
 
 		 1117 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.953711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0945  potassium efflux protein KefA  37.31 
 
 		 1115 aa  133  5e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.612496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66400  potassium efflux protein KefA  32.44 
 
 		 1118 aa  133  5e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0538  potassium efflux protein KefA  36.45 
 
 		 1118 aa  133  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0522  potassium efflux protein KefA  36.45 
 
 		 1118 aa  133  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.97346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0581  potassium efflux protein KefA  36.45 
 
 		 1118 aa  133  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.467495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5759  potassium efflux protein KefA  32.44 
 
 		 1118 aa  133  6e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.738971  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0500  potassium efflux protein KefA  36.27 
 
 		 1120 aa  133  6.999999999999999e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.527944  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0519  potassium efflux protein KefA  36.45 
 
 		 1120 aa  133  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0528  potassium efflux protein KefA  36.45 
 
 		 1120 aa  133  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00416  fused conserved protein  36.27 
 
 		 1120 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3145  MscS Mechanosensitive ion channel  36.27 
 
 		 1120 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.178032  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00421  hypothetical protein  36.27 
 
 		 1120 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0508  potassium efflux protein KefA  36.27 
 
 		 1120 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000540502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0397  potassium efflux protein KefA  36.27 
 
 		 1120 aa  132  7.999999999999999e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0541  potassium efflux protein KefA  36.27 
 
 		 1120 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0555  potassium efflux protein KefA  36.27 
 
 		 1118 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.364262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3151  potassium efflux protein KefA  36.27 
 
 		 1120 aa  132  7.999999999999999e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.800258  normal  0.703774 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2529  MscS Mechanosensitive ion channel  30.38 
 
 		 864 aa  133  7.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1903  MscS Mechanosensitive ion channel  32.82 
 
 		 303 aa  132  9e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0399  potassium efflux protein KefA  29.87 
 
 		 1102 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>