More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3097 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3097  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 602 aa  1236    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1958  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.95 
 
 		 598 aa  652    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57626  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2241  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  40.07 
 
 		 598 aa  427  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.130389  normal  0.394001 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2475  methyl-accepting chemotaxis protein  39.6 
 
 		 598 aa  424  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0390427  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0041  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.91 
 
 		 573 aa  385  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0561  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.86 
 
 		 505 aa  379  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1985  methyl-accepting chemotaxis protein (MCP)  37.07 
 
 		 715 aa  381  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0582  methyl-accepting chemotaxis protein  37.55 
 
 		 696 aa  314  2.9999999999999996e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4401  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.12 
 
 		 695 aa  301  2e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.896591  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0467  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.13 
 
 		 693 aa  284  4.0000000000000003e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.285916  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.82 
 
 		 696 aa  281  2e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000015868 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0484  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.34 
 
 		 693 aa  276  6e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000150879 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0385  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.94 
 
 		 698 aa  276  1.0000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0817491  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0932  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.79 
 
 		 707 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1893  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0009  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.48 
 
 		 511 aa  238  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2723  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.68 
 
 		 522 aa  224  3e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.471128  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1290  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.9 
 
 		 522 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1324  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.9 
 
 		 522 aa  219  1e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0159359 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1246  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.63 
 
 		 522 aa  219  2e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3064  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.63 
 
 		 522 aa  219  2e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000699577 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4367  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.57 
 
 		 524 aa  217  4e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1155  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.11 
 
 		 523 aa  217  4e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1808  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.73 
 
 		 514 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3326  chemotaxis sensory transducer  32.83 
 
 		 534 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03575  methyl-accepting chemotaxis protein  34.76 
 
 		 525 aa  213  7e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1460  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.29 
 
 		 534 aa  213  7.999999999999999e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.695651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1226  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.1 
 
 		 523 aa  212  2e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1156  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.1 
 
 		 523 aa  212  2e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4961  methyl-accepting chemotaxis protein  36.18 
 
 		 527 aa  206  1e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3042  methyl-accepting chemotaxis protein  30.47 
 
 		 527 aa  205  2e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3261  chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 534 aa  201  3e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3399  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.6 
 
 		 526 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55750  putative chemotaxis transducer  32.55 
 
 		 538 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3480  methyl-accepting chemotaxis protein  33.25 
 
 		 533 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0820031  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4857  methyl-accepting chemotaxis protein  33.05 
 
 		 535 aa  196  9e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2839  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.01 
 
 		 546 aa  186  7e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1030  methyl-accepting chemotaxis protein  34.44 
 
 		 549 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3311  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.28 
 
 		 547 aa  184  5.0000000000000004e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.691655  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0935  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  34.68 
 
 		 528 aa  181  4e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.220244  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0450  chemotaxis sensory transducer  33.68 
 
 		 645 aa  178  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2825  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.24 
 
 		 570 aa  173  7.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443347 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2845  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.15 
 
 		 549 aa  170  8e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000597879  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3063  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.96 
 
 		 533 aa  170  9e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.378908  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1041  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.46 
 
 		 661 aa  168  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3345  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.15 
 
 		 542 aa  169  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0226154 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0461  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.47 
 
 		 569 aa  169  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1033  methyl-accepting chemotaxis protein  33.53 
 
 		 533 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0750  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  32.49 
 
 		 539 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0889  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.88 
 
 		 540 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  34.33 
 
 		 632 aa  164  5.0000000000000005e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0400  methyl-accepting chemotaxis protein  34.85 
 
 		 549 aa  164  6e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 550 aa  163  8.000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014913 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1884  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.89 
 
 		 547 aa  162  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114501  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0383  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.7 
 
 		 700 aa  162  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.424843  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3236  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.09 
 
 		 476 aa  162  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.315544  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5132  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.09 
 
 		 468 aa  162  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.202601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.24 
 
 		 533 aa  161  3e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.88 
 
 		 468 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.853292  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2326  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.89 
 
 		 547 aa  160  6e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0821  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.98 
 
 		 545 aa  160  6e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000877148  hitchhiker  0.00000558474 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1152  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.69 
 
 		 484 aa  159  1e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.26629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1275  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.87 
 
 		 470 aa  157  6e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.233006 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3600  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.44 
 
 		 546 aa  157  6e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0612  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.87 
 
 		 543 aa  156  8e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4580  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.14 
 
 		 648 aa  156  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0108713 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0339  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.49 
 
 		 558 aa  155  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3709  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  33.53 
 
 		 546 aa  155  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.43 
 
 		 544 aa  155  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.67 
 
 		 538 aa  154  4e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.06 
 
 		 700 aa  154  5e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0784998 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0142  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.77 
 
 		 540 aa  154  5e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0808523  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.73 
 
 		 637 aa  154  5e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0629  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  34.53 
 
 		 647 aa  154  5e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.624074  hitchhiker  0.000681907 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3312  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.37 
 
 		 533 aa  154  5.9999999999999996e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0771  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.05 
 
 		 822 aa  154  5.9999999999999996e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3147  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.97 
 
 		 540 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0302394  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0584  methyl-accepting chemotaxis transducer  33.24 
 
 		 647 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.77697  normal  0.644217 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3557  methyl-accepting chemotaxis transducer  31.05 
 
 		 714 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.386044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0535  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.51 
 
 		 487 aa  152  2e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3107  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.23 
 
 		 542 aa  152  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0623  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.24 
 
 		 647 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.494937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2217  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.36 
 
 		 714 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.36 
 
 		 645 aa  151  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.675969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1954  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.6 
 
 		 511 aa  150  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.249155  normal  0.44726 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0320  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.25 
 
 		 645 aa  150  5e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000409011 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0342  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.25 
 
 		 645 aa  150  5e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.860801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4887  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.55 
 
 		 645 aa  150  6e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.658451 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0734  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.93 
 
 		 643 aa  150  8e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.770301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3768  chemotaxis sensory transducer  33.23 
 
 		 560 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0712  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.64 
 
 		 550 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0071  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.33 
 
 		 525 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.603344  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.58 
 
 		 541 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1391  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.69 
 
 		 557 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2448  methyl-accepting chemotaxis protein  32.87 
 
 		 646 aa  148  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.718596  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2857  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.13 
 
 		 392 aa  148  3e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0205381  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3379  methyl-accepting chemotaxis protein  30.92 
 
 		 559 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0529  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.91 
 
 		 544 aa  147  5e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2650  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.3 
 
 		 568 aa  147  5e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0401  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  31.56 
 
 		 539 aa  147  7.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.395676  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29800  putative chemotaxis transducer  32.76 
 
 		 561 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00431462  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>