More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3055 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_3055  rhodanese-like protein  100 
 
 
279 aa  571  1.0000000000000001e-162  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.403851  normal  0.0127336 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1239  Rhodanese domain protein  57.04 
 
 
284 aa  319  3e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.954881  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0188  Rhodanese domain protein  58.21 
 
 
285 aa  317  1e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2831  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  55.67 
 
 
289 aa  296  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6785  Rhodanese domain protein  54.96 
 
 
289 aa  295  4e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0412413  hitchhiker  0.0000256266 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4824  rhodanese domain-containing protein  56.03 
 
 
289 aa  295  4e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0196782  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0610  rhodanese domain-containing protein  54.96 
 
 
289 aa  292  4e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3952  rhodanese domain-containing protein  54.77 
 
 
290 aa  291  5e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0325  rhodanese domain-containing protein  54.61 
 
 
289 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2539  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  54.61 
 
 
289 aa  290  2e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920072  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0847  rhodanese domain-containing protein  54.61 
 
 
289 aa  290  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.641684  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2397  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  54.61 
 
 
289 aa  290  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0359  rhodanese domain-containing protein  54.61 
 
 
289 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1507  rhodanese domain-containing protein  54.61 
 
 
289 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1701  rhodanese domain-containing protein  54.61 
 
 
289 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2226  thiosulfate sulfurtransferase protein  51.58 
 
 
296 aa  288  7e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3246  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  53.9 
 
 
289 aa  286  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0068458 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2038  Rhodanese domain protein  52.82 
 
 
295 aa  285  5e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2431  Rhodanese domain protein  53.17 
 
 
295 aa  285  7e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3652  rhodanese domain-containing protein  55.32 
 
 
289 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.865325  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4490  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  55.32 
 
 
289 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3875  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  55.32 
 
 
289 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.403807 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2489  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  51.61 
 
 
282 aa  280  1e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0877  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  53.58 
 
 
287 aa  280  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3772  rhodanese domain-containing protein  53.9 
 
 
289 aa  278  7e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0206148 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3212  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  53.46 
 
 
299 aa  276  3e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.389078  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2215  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  55 
 
 
289 aa  270  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.255157  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2620  rhodanese-like protein  52.08 
 
 
285 aa  270  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1566  Rhodanese domain protein  50.17 
 
 
302 aa  263  3e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1708  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  51.52 
 
 
276 aa  259  3e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2010  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  47.64 
 
 
299 aa  258  6e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0121868  hitchhiker  0.0031153 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0593  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  47.12 
 
 
285 aa  258  1e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2636  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  50.76 
 
 
292 aa  254  7e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.488566  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3367  rhodanese domain-containing protein  48.56 
 
 
312 aa  254  9e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1426  Rhodanese domain protein  47.81 
 
 
276 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.630889  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1742  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  47.81 
 
 
300 aa  250  2e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.782779 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47500  putative 3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  49.11 
 
 
284 aa  247  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1326  Rhodanese domain protein  49.28 
 
 
283 aa  247  1e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0377463  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2880  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  49.48 
 
 
289 aa  247  2e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.518579  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4099  putative 3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  48.4 
 
 
284 aa  245  6e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32980  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase protein  49.11 
 
 
284 aa  245  6.999999999999999e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2237  rhodanese domain-containing protein  46.08 
 
 
304 aa  244  9.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.814145  normal  0.0284823 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5168  rhodanese domain-containing protein  47.46 
 
 
284 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0347  rhodanese domain-containing protein  45.74 
 
 
284 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.772652  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1496  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  45.61 
 
 
300 aa  243  3e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3278  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  47.6 
 
 
330 aa  241  9e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0951  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  47.81 
 
 
299 aa  241  1e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1033  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  47.81 
 
 
310 aa  241  1e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0667917 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5118  rhodanese domain protein  46.74 
 
 
284 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4992  rhodanese domain-containing protein  46.74 
 
 
284 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1048  Rhodanese domain protein  47.89 
 
 
281 aa  236  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0305  Rhodanese domain protein  43.26 
 
 
285 aa  237  2e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1769  rhodanese domain-containing protein  47.52 
 
 
284 aa  234  8e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000405789  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5343  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  45.91 
 
 
284 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1319  Rhodanese domain protein  46.58 
 
 
300 aa  232  4.0000000000000004e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.147779  normal  0.429606 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0177  Rhodanese domain-containing protein  47.14 
 
 
278 aa  231  1e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000691288  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00777  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  46.13 
 
 
290 aa  229  3e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0224116  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4756  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  45.55 
 
 
284 aa  228  9e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0846963 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0420  rhodanese-like domain protein  44.84 
 
 
285 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0556  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  42.28 
 
 
276 aa  223  2e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.593662 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3646  Rhodanese domain protein  42.49 
 
 
276 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1779  rhodanese-like protein  42.54 
 
 
272 aa  217  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0268693  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0726  rhodanese domain-containing protein  43.62 
 
 
291 aa  218  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.893447  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2427  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  44.4 
 
 
280 aa  217  2e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.244086 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2346  rhodanese domain-containing protein  42.28 
 
 
272 aa  215  8e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1455  thiosulfate sulfurtransferase  39.27 
 
 
277 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1455  thiosulfate sulfurtransferase  39.27 
 
 
277 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1669  rhodanese-like domain protein  39.27 
 
 
277 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1483  rhodanese-like domain-containing protein  39.27 
 
 
277 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1599  rhodanese-like domain-containing protein  39.27 
 
 
277 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.317702  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0764  Rhodanese domain protein  41.13 
 
 
281 aa  212  7e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1705  rhodanese-like domain-containing protein  39.64 
 
 
277 aa  211  9e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0165982  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0321  rhodanese domain-containing protein  41.43 
 
 
288 aa  211  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.183819 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1745  rhodanese-like domain protein  39.64 
 
 
277 aa  210  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000561696  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3711  rhodanese-like domain protein  38.18 
 
 
277 aa  207  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.584837  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1846  Rhodanese domain protein  40 
 
 
274 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1872  Rhodanese domain protein  40 
 
 
274 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.494935  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1776  Rhodanese domain protein  45.79 
 
 
335 aa  207  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.305984  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0159  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  45.85 
 
 
292 aa  206  3e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1498  rhodanese domain-containing protein  38.55 
 
 
277 aa  206  4e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.125768  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1634  rhodanese-like domain protein  38.55 
 
 
277 aa  205  7e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0494002  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3485  rhodanese domain-containing protein  41.43 
 
 
278 aa  205  8e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1310  rhodanese domain-containing protein  38.38 
 
 
276 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.965267  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1892  Rhodanese domain protein  39.78 
 
 
278 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.474796  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5604  Rhodanese domain protein  45.35 
 
 
287 aa  196  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0952  Rhodanese domain protein  43.28 
 
 
284 aa  196  4.0000000000000005e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.63885  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1860  Rhodanese domain protein  42.81 
 
 
282 aa  189  5.999999999999999e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0293763  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2918  thiosulfate sulfurtransferase  42.5 
 
 
276 aa  188  7e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1631  Rhodanese domain protein  43.58 
 
 
291 aa  187  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00167409  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2395  Rhodanese domain protein  39.78 
 
 
282 aa  188  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0354  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  44.04 
 
 
285 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1417  thiosulfate sulfurtransferase  42.39 
 
 
289 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1460  rhodanese domain-containing protein  44.13 
 
 
288 aa  179  4e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.058733  normal  0.145252 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27500  rhodanese-related sulfurtransferase  42.08 
 
 
280 aa  179  4.999999999999999e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3673  Rhodanese domain protein  43.3 
 
 
279 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1421  rhodanese domain-containing protein  43.17 
 
 
288 aa  177  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.692836  decreased coverage  0.00000340615 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3608  Rhodanese domain protein  42.91 
 
 
279 aa  176  3e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0580281  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3515  thiosulfate sulfurtransferase  40.14 
 
 
278 aa  175  6e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.432298  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2381  rhodanese domain-containing protein  41.35 
 
 
275 aa  171  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.305388 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2623  rhodanese domain-containing protein  35.8 
 
 
283 aa  170  3e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>