More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2953 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2953  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 700 aa  1444    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.191776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1994  TonB-dependent receptor  40.08 
 
 		 698 aa  534  1e-150  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1372  TonB-dependent receptor plug  37.8 
 
 		 701 aa  471  1.0000000000000001e-131  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000623394  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1044  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  25.9 
 
 		 726 aa  159  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  23.94 
 
 		 700 aa  140  8.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  23.94 
 
 		 700 aa  140  8.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  24.33 
 
 		 700 aa  140  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0909  putative TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 711 aa  139  1e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.622893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  23.01 
 
 		 675 aa  140  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2195  TonB-dependent receptor  24.12 
 
 		 700 aa  139  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0192314  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1632  TonB-dependent receptor  23.69 
 
 		 700 aa  138  4e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1720  TonB-dependent receptor  23.69 
 
 		 700 aa  136  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201404 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1723  TonB-dependent receptor  23.55 
 
 		 700 aa  136  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01408  predicted iron outer membrane transporter  24.05 
 
 		 700 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01419  hypothetical protein  24.05 
 
 		 700 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  24.67 
 
 		 728 aa  135  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2728  TonB-dependent receptor  23.97 
 
 		 688 aa  135  3.9999999999999996e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.811385  normal  0.575129 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2993  TonB-dependent receptor  23.68 
 
 		 705 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.162079  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2926  TonB-dependent receptor  23.59 
 
 		 715 aa  132  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000198793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1061  TonB-dependent receptor, plug  24.06 
 
 		 691 aa  129  2.0000000000000002e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2570  TonB-dependent receptor  24.65 
 
 		 694 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00469469  hitchhiker  0.000000281684 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4674  TonB-dependent receptor  24.48 
 
 		 692 aa  121  4.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.396726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3519  TonB-dependent siderophore receptor  24.21 
 
 		 681 aa  121  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302801  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4090  TonB-dependent receptor  25.18 
 
 		 705 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0901  TonB-dependent receptor  23.33 
 
 		 735 aa  119  3e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1076  iron transporter  23.82 
 
 		 743 aa  117  6e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.337763 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1826  TonB-dependent receptor  24.82 
 
 		 723 aa  110  9.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0185611 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0628  TonB-dependent receptor  23.56 
 
 		 688 aa  110  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1125  TonB-dependent receptor  29.52 
 
 		 709 aa  109  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1763  TonB-dependent receptor plug  23.65 
 
 		 703 aa  106  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0187171  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0485  TonB-dependent receptor  21.26 
 
 		 702 aa  105  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.517963  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2514  TonB-dependent siderophore receptor  24.68 
 
 		 726 aa  100  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1468  TonB-dependent receptor  22.94 
 
 		 682 aa  97.8  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2477  TonB-dependent receptor  23.72 
 
 		 681 aa  97.8  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5609  putative TonB-dependent receptor protein  23.6 
 
 		 727 aa  97.4  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232583  normal  0.195075 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1868  TonB-dependent receptor  23.1 
 
 		 734 aa  97.4  9e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.155376  normal  0.191225 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1657  TonB-dependent receptor  23 
 
 		 715 aa  95.9  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.818594 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1377  TonB-dependent receptor  23.22 
 
 		 713 aa  95.9  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632054  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22830  TonB-dependent receptor  21.23 
 
 		 678 aa  93.6  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0688062  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1382  TonB-dependent receptor  22.8 
 
 		 717 aa  93.6  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.530841  hitchhiker  0.000808374 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2019  TonB-dependent receptor  23.7 
 
 		 742 aa  92.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.850916  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0094  TonB-dependent receptor  30.05 
 
 		 678 aa  92.4  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0917922  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34990  putative TonB-dependent receptor  29.35 
 
 		 706 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.275223  normal  0.836539 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2952  putative lipoprotein  29.85 
 
 		 710 aa  92.4  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.130559  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3709  TonB-dependent receptor  21.7 
 
 		 681 aa  91.7  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0021  TonB-dependent receptor  24.86 
 
 		 705 aa  90.9  8e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2420  TonB-dependent siderophore receptor  22.27 
 
 		 728 aa  90.1  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03467  TonB-dependent outer membrane Receptor  22.7 
 
 		 712 aa  89  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2308  TonB-dependent siderophore receptor  23.03 
 
 		 693 aa  88.6  4e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00270239  normal  0.034674 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3267  putative outer membrane receptor for iron transport  22.09 
 
 		 712 aa  87.4  8e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.598995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4484  TonB-dependent receptor  22.49 
 
 		 726 aa  85.1  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.429644  normal  0.265878 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0102  TonB-dependent siderophore receptor  20.93 
 
 		 755 aa  84.7  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.058066  normal  0.995779 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0805  TonB-dependent siderophore receptor  23.25 
 
 		 731 aa  84.3  0.000000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2795  TonB-dependent receptor  32.33 
 
 		 701 aa  84.3  0.000000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13430  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  22.24 
 
 		 784 aa  84.3  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2118  TonB-dependent siderophore receptor  22.52 
 
 		 704 aa  84  0.000000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4646  TonB-dependent siderophore receptor  22.54 
 
 		 708 aa  83.6  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1204  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  22.53 
 
 		 784 aa  83.6  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.814963  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0049  TonB-dependent siderophore receptor  22.07 
 
 		 703 aa  83.2  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.627674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3552  TonB-dependent receptor  22.21 
 
 		 737 aa  82.8  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0127436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4534  TonB-dependent receptor  22.12 
 
 		 779 aa  82.8  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.732299 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  23.65 
 
 		 721 aa  82.4  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03830  putative TonB-dependent receptor protein  21.28 
 
 		 670 aa  81.6  0.00000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3258  TonB-dependent siderophore receptor  21.98 
 
 		 736 aa  81.3  0.00000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.875335  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6944  TonB-dependent receptor  23.33 
 
 		 757 aa  79.7  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5774  TonB-dependent receptor plug  24.79 
 
 		 690 aa  80.1  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.872771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2754  TonB-dependent siderophore receptor  21.41 
 
 		 747 aa  79.3  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2301  TonB-dependent receptor  25.76 
 
 		 706 aa  79.3  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2239  TonB-dependent receptor plug  25 
 
 		 582 aa  79.7  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.500104 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2924  TonB-dependent receptor  32.21 
 
 		 776 aa  79.3  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.753718  normal  0.115907 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  22.18 
 
 		 860 aa  78.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5169  TonB-dependent siderophore receptor  22.22 
 
 		 723 aa  79  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  26.72 
 
 		 706 aa  78.6  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2201  TonB-dependent receptor  21.85 
 
 		 736 aa  79  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.407628  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58570  putative outer membrane ferric siderophore receptor  22.32 
 
 		 753 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.21459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0411  TonB-dependent siderophore receptor  22.64 
 
 		 758 aa  79  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  26.72 
 
 		 706 aa  78.6  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3149  TonB-dependent receptor  31.69 
 
 		 776 aa  78.6  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0958639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0722  TonB-dependent siderophore receptor  22.4 
 
 		 675 aa  78.2  0.0000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.534189 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  26.72 
 
 		 706 aa  78.6  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3979  ferrichrome outer membrane transporter  21.43 
 
 		 729 aa  78.6  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2736  TonB-dependent siderophore receptor  22.06 
 
 		 705 aa  78.6  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111092 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  26.72 
 
 		 706 aa  78.2  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3048  TonB-dependent receptor  31.69 
 
 		 774 aa  78.2  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.20503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  26.72 
 
 		 721 aa  78.2  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1486  TonB-dependent receptor  26.82 
 
 		 693 aa  78.2  0.0000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.643669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1775  TonB-dependent siderophore receptor  21.85 
 
 		 721 aa  77.8  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.441598 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1426  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 		 720 aa  77.4  0.0000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.51849  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2498  TonB-dependent receptor  33.87 
 
 		 770 aa  77.4  0.0000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.111731 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44130  FpvA-like outer membrane ferropyoverdine receptor  23.31 
 
 		 812 aa  77.4  0.0000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.2045  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1025  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 		 791 aa  76.6  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0963  TonB-dependent receptor  29.89 
 
 		 614 aa  76.6  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1407  TonB-dependent siderophore receptor  27.17 
 
 		 705 aa  76.3  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0423  TonB-dependent receptor  23.73 
 
 		 696 aa  75.5  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2902  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 791 aa  75.5  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.119413 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0651  tonB-dependent receptor  21.2 
 
 		 656 aa  75.9  0.000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0646495  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  33.73 
 
 		 646 aa  75.1  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2188  TonB-dependent receptor  29.02 
 
 		 680 aa  75.1  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0607  TonB-dependent siderophore receptor  23.31 
 
 		 706 aa  75.1  0.000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1863  TonB-dependent receptor  20.93 
 
 		 781 aa  74.7  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.150075  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>