37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2951 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2951  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  369  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.64578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3849  hypothetical protein  42.94 
 
 		 171 aa  137  6e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.125049  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2786  putative transmembrane protein  33.33 
 
 		 180 aa  86.7  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000254813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1267  putative transmembrane protein  31.33 
 
 		 177 aa  79.3  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1668  putative transmembrane protein  27.59 
 
 		 182 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.177896 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3846  hypothetical protein  28.07 
 
 		 183 aa  75.9  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0937  hypothetical protein  32.37 
 
 		 202 aa  75.1  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.650732  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2462  putative transmembrane protein  30 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.656793  normal  0.0703226 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4007  hypothetical protein  25.99 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2315  putative transmembrane protein  26.54 
 
 		 184 aa  62.4  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.49097  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0901  putative transmembrane protein  29.25 
 
 		 178 aa  62  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0767133  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1551  hypothetical protein  29.07 
 
 		 217 aa  62  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3745  putative transmembrane protein  28.05 
 
 		 200 aa  61.2  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0394509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2371  hypothetical protein  24.84 
 
 		 170 aa  61.2  0.000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221129 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4009  hypothetical protein  25.79 
 
 		 178 aa  58.9  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.898368  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4957  hypothetical protein  25.6 
 
 		 235 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.598069 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1561  hypothetical protein  29.88 
 
 		 215 aa  57  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49880  hypothetical protein  27.66 
 
 		 190 aa  57  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4248  hypothetical protein  28.06 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3482  hypothetical protein  27.34 
 
 		 220 aa  52.4  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0571375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5256  hypothetical protein  24 
 
 		 173 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.631222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0643  hypothetical protein  26.4 
 
 		 235 aa  51.6  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.817874  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4437  hypothetical protein  21.48 
 
 		 235 aa  51.6  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000924263 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0093  hypothetical protein  23.03 
 
 		 188 aa  49.7  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000564586 
 
 
-
 
NC_003296  RS01895  putative transmembrane protein  30.49 
 
 		 188 aa  50.1  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0216755  normal  0.443303 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1230  putative transmembrane protein  27.06 
 
 		 185 aa  49.3  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4467  putative transmembrane protein  29.24 
 
 		 190 aa  48.1  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00546453  normal  0.335651 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4601  putative transmembrane protein  29.24 
 
 		 190 aa  48.1  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0346452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0112  putative transmembrane protein  24.82 
 
 		 146 aa  47.8  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0665  hypothetical protein  25 
 
 		 167 aa  45.8  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5028  hypothetical protein  26.4 
 
 		 265 aa  45.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.966496  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3339  hypothetical protein  26.4 
 
 		 174 aa  45.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3616  hypothetical protein  22.4 
 
 		 236 aa  45.1  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1282  hypothetical protein  25 
 
 		 186 aa  43.5  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0239  hypothetical protein  25.32 
 
 		 177 aa  42  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.469269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4535  hypothetical protein  26.32 
 
 		 188 aa  41.6  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.026025  normal  0.651544 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4671  hypothetical protein  26.32 
 
 		 188 aa  41.6  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.12708 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>