More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2910 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_2910  transcriptional regulator CysB-like protein  100 
 
 
313 aa  639  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.170902  normal  0.254391 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0127  LysR family transcriptional regulator  57.98 
 
 
311 aa  376  1e-103  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.191807  hitchhiker  0.00233416 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3810  LysR family transcriptional regulator  57.98 
 
 
312 aa  375  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.251082 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0800  transcriptional regulator CysB-like protein  57.1 
 
 
313 aa  374  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1145  transcriptional regulator CysB-like protein  57.57 
 
 
308 aa  367  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.207377  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1521  transcriptional regulator CysB-like protein  56.39 
 
 
308 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1669  transcriptional regulator CysB-like protein  54.07 
 
 
312 aa  366  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0453898  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1501  transcriptional regulator CysB-like protein  56.39 
 
 
308 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.33535  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2476  transcriptional regulator CysB-like protein  56.57 
 
 
308 aa  364  1e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1625  transcriptional regulator CysB-like protein  56.39 
 
 
308 aa  364  1e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.879627  normal  0.658708 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1865  transcriptional regulator CysB-like protein  56.23 
 
 
308 aa  363  2e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.625225  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0810  transcriptional regulator CysB-like protein  56.23 
 
 
308 aa  363  2e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.259681  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1205  transcriptional regulator CysB-like protein  56.23 
 
 
308 aa  363  2e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.215298  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2018  transcriptional regulator CysB-like protein  56.23 
 
 
308 aa  363  2e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.962244  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1694  transcriptional regulator CysB-like protein  56.23 
 
 
308 aa  363  2e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.272702  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0350  transcriptional regulator CysB-like protein  56.23 
 
 
308 aa  363  2e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0871745  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1851  transcriptional regulator CysB-like protein  56.23 
 
 
308 aa  363  2e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1632  transcriptional regulator CysB-like protein  56.23 
 
 
308 aa  362  6e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1582  transcriptional regulator CysB-like protein  56.23 
 
 
308 aa  362  6e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.610687  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1605  transcriptional regulator CysB-like protein  56.23 
 
 
308 aa  362  6e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339549  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1125  transcriptional regulator CysB-like protein  56.23 
 
 
308 aa  361  9e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4743  transcriptional regulator CysB-like protein  56.23 
 
 
308 aa  360  1e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.217696  normal  0.701162 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1777  transcriptional regulator CysB-like protein  55.22 
 
 
308 aa  358  8e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.16529  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2466  transcriptional regulator CysB-like protein  55.22 
 
 
308 aa  358  8e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.387168 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5610  LysR family transcriptional regulator  54.55 
 
 
354 aa  355  5e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.519955 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1005  transcriptional regulator CysB-like protein  51.76 
 
 
313 aa  347  2e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0813  transcriptional regulator CysB-like protein  51.76 
 
 
313 aa  346  2e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1165  transcriptional regulator CysB-like protein  51.76 
 
 
313 aa  347  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1663  transcriptional regulator CysB-like protein  51.76 
 
 
313 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2349  transcriptional regulator CysB-like protein  51.76 
 
 
313 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2936  transcriptional regulator CysB-like protein  51.76 
 
 
313 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1012  transcriptional regulator CysB-like protein  51.76 
 
 
313 aa  347  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0662  transcriptional regulator CysB-like protein  51.76 
 
 
313 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.631688  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2476  transcriptional regulator CysB-like protein  50.8 
 
 
313 aa  346  3e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14516  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2481  transcriptional regulator CysB-like protein  50.8 
 
 
313 aa  346  3e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1865  transcriptional regulator CysB-like protein  50.8 
 
 
313 aa  346  3e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2292  transcriptional regulator CysB-like protein  53.92 
 
 
306 aa  346  3e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.524252  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1697  transcriptional regulator CysB  51.6 
 
 
326 aa  344  1e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.828749 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0061  transcriptional regulator, LysR family  55.81 
 
 
314 aa  344  1e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2525  transcriptional regulator CysB-like protein  50.48 
 
 
313 aa  343  2e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2393  transcriptional regulator CysB-like protein  50.48 
 
 
313 aa  343  2e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5807  transcriptional regulator CysB-like protein  50.48 
 
 
313 aa  343  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0834641 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1624  transcriptional regulator CysB  52.4 
 
 
324 aa  343  2e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.483368  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0847  transcriptional regulator, LysR family  51.32 
 
 
320 aa  342  4e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.960379 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0699  sulfur assimilation transcriptional regulator, LysR family  51.32 
 
 
320 aa  342  4e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.735105  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0818  transcriptional regulator CysB-like protein  50.16 
 
 
313 aa  342  5e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2236  transcriptional regulator CysB-like protein  50.8 
 
 
313 aa  342  6e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0071  LysR family transcriptional regulator  53.65 
 
 
314 aa  341  1e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16172  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1296  transcriptional regulator, LysR family  50.66 
 
 
320 aa  340  3e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.842409  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1667  transcriptional regulator CysB  52.79 
 
 
324 aa  338  8e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00185974  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2077  transcriptional regulator CysB  52.46 
 
 
324 aa  337  1e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0047105 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01945  transcriptional regulator CysB  52.63 
 
 
324 aa  337  2e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00567188  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2279  Cys regulon transcriptional activator  52.46 
 
 
324 aa  336  4e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0003435  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3665  transcriptional regulator CysB-like protein  49.84 
 
 
313 aa  335  6e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.891363 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2469  transcriptional regulator CysB  52.63 
 
 
324 aa  335  6e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0969  transcriptional regulator CysB-like protein  49.84 
 
 
313 aa  335  7e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2341  transcriptional regulator CysB  51.3 
 
 
335 aa  335  7e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00664929 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2327  transcriptional regulator CysB  52.13 
 
 
324 aa  334  1e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.184075  hitchhiker  4.6762e-05 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1928  transcriptional regulator CysB  52.13 
 
 
324 aa  334  1e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0221409  hitchhiker  1.99307e-11 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3443  transcriptional regulator CysB  52.13 
 
 
324 aa  334  1e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0457028  hitchhiker  0.00255719 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2698  transcriptional regulator CysB-like protein  50.16 
 
 
313 aa  334  1e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4003  transcriptional regulator CysB  52.13 
 
 
324 aa  333  2e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.260583  normal  0.45598 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1768  transcriptional regulator CysB  51.8 
 
 
324 aa  333  3e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  1.42013e-07 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1583  transcriptional regulator CysB  51.27 
 
 
325 aa  332  5e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3039  LysR family transcriptional regulator  53.57 
 
 
309 aa  332  7e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.275315  normal  0.0769631 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2818  transcriptional regulator CysB-like protein  49.52 
 
 
313 aa  331  1e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3553  transcriptional regulator CysB  52.46 
 
 
324 aa  330  2e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23140  transcriptional regulator CysB  51.8 
 
 
324 aa  330  2e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2428  transcriptional regulator CysB  51.79 
 
 
323 aa  330  2e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1587  transcriptional regulator CysB  51.64 
 
 
324 aa  329  3e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.296126  normal  0.104148 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003883  regulatory protein CysB  50.99 
 
 
324 aa  330  3e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.803514  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41870  transcriptional regulator CysB  52.46 
 
 
324 aa  330  3e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1967  transcriptional regulator CysB-like protein  52.88 
 
 
315 aa  329  3e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1497  transcriptional regulator CysB  50.66 
 
 
324 aa  330  3e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.66035e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1731  transcriptional regulator CysB  51.64 
 
 
324 aa  329  3e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00171097  normal  0.293254 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1662  transcriptional regulator CysB  51.64 
 
 
324 aa  329  3e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0319237  unclonable  1.81404e-05 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2649  transcriptional regulator CysB  51.64 
 
 
324 aa  329  3e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1287  transcriptional regulator CysB-like protein  51.64 
 
 
319 aa  329  4e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.767639  normal  0.313196 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01793  transcriptional regulator CysB  51.32 
 
 
324 aa  329  4e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1224  transcriptional regulator CysB-like protein  51.64 
 
 
319 aa  328  5e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.178615  normal  0.191747 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2231  transcriptional regulator CysB-like protein  49.2 
 
 
313 aa  327  1e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1348  transcriptional regulator CysB-like protein  51.64 
 
 
327 aa  327  1e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2016  transcriptional regulator CysB  52.3 
 
 
324 aa  327  2e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.251178  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2546  transcriptional regulator CysB  51.8 
 
 
324 aa  327  2e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  8.91923e-06 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2317  transcriptional regulator CysB  52.3 
 
 
324 aa  326  3e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2129  transcriptional regulator CysB-like protein  49.84 
 
 
311 aa  326  3e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.74673e-16  decreased coverage  1.24662e-06 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2248  transcriptional regulator CysB  51.15 
 
 
325 aa  326  4e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.841929  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2691  transcriptional regulator CysB-like protein  48.88 
 
 
313 aa  326  4e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.644017  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0620  transcriptional regulator CysB-like protein  49.52 
 
 
313 aa  325  5e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0418657  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1689  transcriptional regulator CysB  49.83 
 
 
324 aa  325  6e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.372652  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2494  transcriptional regulator CysB  50.81 
 
 
327 aa  325  8e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1857  transcriptional regulator CysB  50.81 
 
 
327 aa  325  8e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00369362  decreased coverage  2.17707e-09 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1979  transcriptional regulator CysB  50.82 
 
 
323 aa  325  8e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2607  transcriptional regulator CysB  50.81 
 
 
327 aa  325  8e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00558949  decreased coverage  0.000632462 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2487  transcriptional regulator CysB  50.81 
 
 
327 aa  325  8e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.343529  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1923  transcriptional regulator, LysR family  51.61 
 
 
324 aa  325  8e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1379  transcriptional regulator CysB-like protein  51.64 
 
 
316 aa  324  9e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2096  transcriptional regulator CysB  51.97 
 
 
324 aa  323  3e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00807982  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2161  transcriptional regulator, LysR family  50.97 
 
 
324 aa  323  3e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.281423  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2032  transcriptional regulator CysB  51.97 
 
 
324 aa  323  3e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.30659  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>