More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2838 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



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Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010682  Rpic_0958  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  59.86 
 
 
564 aa  643    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.388256  normal  0.0147257 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1115  single-stranded-DNA-specific exonuclease protein  58.35 
 
 
565 aa  644    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00151931  normal  0.274168 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2838  RecJ exonuclease  100 
 
 
566 aa  1145    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.934115  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1074  exonuclease RecJ  58.6 
 
 
565 aa  659    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0444947  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1054  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  59.68 
 
 
564 aa  643    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0497812  normal  0.288787 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1448  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  59.75 
 
 
577 aa  657    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1154  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  58.48 
 
 
565 aa  635    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0447096 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1038  exonuclease RecJ  59.37 
 
 
566 aa  665    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.329478 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1969  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  66.08 
 
 
563 aa  752    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00305659  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2153  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  58.66 
 
 
565 aa  637    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000147893  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2026  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  58.66 
 
 
565 aa  637    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.698536 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2758  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  58.99 
 
 
574 aa  634  1e-180  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1698  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  60.07 
 
 
564 aa  634  1e-180  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2721  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  60.07 
 
 
564 aa  634  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2588  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  60.07 
 
 
564 aa  633  1e-180  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3113  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  60.07 
 
 
564 aa  634  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1478  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  60.07 
 
 
564 aa  634  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2642  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  60.07 
 
 
564 aa  634  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2205  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  60.07 
 
 
564 aa  634  1e-180  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1885  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  60.07 
 
 
564 aa  631  1e-179  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214774  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1564  RecJ exonuclease  59.4 
 
 
568 aa  629  1e-179  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.373395  normal  0.277595 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2569  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  59.05 
 
 
568 aa  627  1e-178  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.217652  normal  0.0265746 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3424  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  58.99 
 
 
574 aa  619  1e-176  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1771  exonuclease RecJ  57.07 
 
 
565 aa  616  1e-175  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.495895  normal  0.722264 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5422  RecJ exonuclease  59.01 
 
 
565 aa  618  1e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1208  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  56.7 
 
 
573 aa  617  1e-175  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5961  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  58.66 
 
 
565 aa  615  1e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.987838  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2116  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  58.66 
 
 
565 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.457344  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2134  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  58.3 
 
 
565 aa  608  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0487  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  53.37 
 
 
601 aa  602  1.0000000000000001e-171  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.624528  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0640  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  52.55 
 
 
613 aa  604  1.0000000000000001e-171  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1012  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  54.18 
 
 
600 aa  602  1.0000000000000001e-171  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0694189 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3258  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  55.81 
 
 
580 aa  601  1e-170  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3234  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  56.02 
 
 
576 aa  599  1e-170  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.224513  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1470  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  53.44 
 
 
586 aa  599  1e-170  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2400  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  57.57 
 
 
579 aa  597  1e-169  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.927411 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3702  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  56.49 
 
 
571 aa  594  1e-168  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.713364 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2065  exonuclease RecJ  55.12 
 
 
564 aa  594  1e-168  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3183  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  56.67 
 
 
576 aa  590  1e-167  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.620081  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1395  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  55.7 
 
 
571 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2751  exonuclease RecJ  57.14 
 
 
581 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1298  RecJ exonuclease  54.43 
 
 
571 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.882929  normal  0.617769 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5406  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  55.05 
 
 
572 aa  575  1.0000000000000001e-162  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16220  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  55.33 
 
 
571 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3376  exonuclease RecJ  54.97 
 
 
569 aa  567  1e-160  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.593595 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4142  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  53.07 
 
 
569 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.810057 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1488  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  54.07 
 
 
569 aa  565  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1460  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  54.89 
 
 
574 aa  558  1e-158  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1477  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  52.71 
 
 
569 aa  560  1e-158  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.221142  normal  0.152861 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4244  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  52.71 
 
 
569 aa  559  1e-158  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1035  exonuclease RecJ  52.35 
 
 
569 aa  560  1e-158  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0772  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  54.76 
 
 
574 aa  555  1e-157  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.167693  hitchhiker  0.00446395 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0892  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  54.14 
 
 
584 aa  555  1e-157  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.488933  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39440  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  54.69 
 
 
569 aa  556  1e-157  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.31407  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3760  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  52.9 
 
 
610 aa  557  1e-157  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.671236 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1082  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  52.53 
 
 
569 aa  557  1e-157  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3447  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  54.32 
 
 
574 aa  552  1e-156  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0897  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  53.44 
 
 
574 aa  554  1e-156  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3226  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  53.96 
 
 
574 aa  552  1e-156  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0952  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  53.78 
 
 
574 aa  549  1e-155  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0845  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  53.96 
 
 
577 aa  549  1e-155  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3522  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  54.14 
 
 
577 aa  550  1e-155  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3641  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  53.96 
 
 
577 aa  549  1e-155  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0797  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  53.96 
 
 
574 aa  550  1e-155  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3329  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  53.96 
 
 
574 aa  550  1e-155  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2737  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  53.96 
 
 
574 aa  545  1e-154  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1213  exonuclease RecJ  50.87 
 
 
581 aa  545  1e-153  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0807  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  53.06 
 
 
574 aa  541  1e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3890  ssDNA exonuclease RecJ  52.61 
 
 
577 aa  541  9.999999999999999e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.874306  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3712  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  50.54 
 
 
572 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3302  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  51.91 
 
 
572 aa  535  1e-151  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0912686  normal  0.117483 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0922  ssDNA exonuclease RecJ  52.79 
 
 
577 aa  538  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3849  ssDNA exonuclease RecJ  52.79 
 
 
577 aa  537  1e-151  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.333614 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0881  ssDNA exonuclease RecJ  52.79 
 
 
577 aa  537  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.796775  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004439  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  49.55 
 
 
579 aa  534  1e-150  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3424  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  52.61 
 
 
576 aa  530  1e-149  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.297966  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4094  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  49.2 
 
 
584 aa  530  1e-149  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03407  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  50.45 
 
 
573 aa  529  1e-149  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1474  single-strand DNA-specific exonuclease  50.45 
 
 
573 aa  530  1e-149  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1819  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  53.06 
 
 
577 aa  528  1e-149  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0649366  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0665  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  52.78 
 
 
574 aa  531  1e-149  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0729862  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1417  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  50.54 
 
 
579 aa  525  1e-148  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00958  ssDNA exonuclease RecJ  49.28 
 
 
579 aa  526  1e-148  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3198  ssDNA exonuclease RecJ  50.09 
 
 
577 aa  522  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.697919  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0749  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  51.8 
 
 
574 aa  522  1e-147  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0015193  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1993  ssDNA exonuclease RecJ  49.38 
 
 
584 aa  522  1e-147  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02724  ssDNA exonuclease, 5' -> 3'-specific  49.91 
 
 
577 aa  520  1e-146  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0329903  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0895  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  52.88 
 
 
574 aa  520  1e-146  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00647081 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3298  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  51.08 
 
 
580 aa  518  1e-146  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.746333  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3025  ssDNA exonuclease RecJ  49.91 
 
 
577 aa  518  1e-146  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3051  ssDNA exonuclease RecJ  49.91 
 
 
577 aa  519  1e-146  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1567  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  50.18 
 
 
579 aa  520  1e-146  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02687  hypothetical protein  49.91 
 
 
577 aa  520  1e-146  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0479122  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1189  RecJ exonuclease  52.99 
 
 
574 aa  519  1e-146  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3378  ssDNA exonuclease RecJ  49.91 
 
 
577 aa  520  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3276  ssDNA exonuclease RecJ  49.91 
 
 
577 aa  521  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4183  ssDNA exonuclease RecJ  49.91 
 
 
577 aa  519  1e-146  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3210  ssDNA exonuclease RecJ  49.91 
 
 
577 aa  521  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.398907 
 
 
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NC_009801  EcE24377A_3218  ssDNA exonuclease RecJ  49.91 
 
 
577 aa  520  1e-146  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011083  SeHA_C3273  ssDNA exonuclease RecJ  49.91 
 
 
577 aa  520  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
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