More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2794 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2794  cytochrome B561  100 
 
 		 174 aa  339  1e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  69.59 
 
 		 178 aa  245  2e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3152  cytochrome B561  53.25 
 
 		 197 aa  179  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159258  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0459  cytochrome B561  52.33 
 
 		 189 aa  176  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  50.88 
 
 		 186 aa  173  9e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  47.98 
 
 		 186 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  48.55 
 
 		 186 aa  169  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  50 
 
 		 186 aa  169  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  49.42 
 
 		 186 aa  169  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  49.12 
 
 		 186 aa  168  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  49.12 
 
 		 186 aa  168  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  49.12 
 
 		 186 aa  168  4e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  48.54 
 
 		 186 aa  167  7e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1029  cytochrome b561  57.74 
 
 		 181 aa  165  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145738  normal  0.0105144 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  47.37 
 
 		 189 aa  166  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  49.4 
 
 		 182 aa  161  4.0000000000000004e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  47.09 
 
 		 193 aa  161  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  47.67 
 
 		 195 aa  159  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  47.37 
 
 		 184 aa  159  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  47.06 
 
 		 184 aa  158  4e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3506  putative cytochrome b-561 membrane protein  49.43 
 
 		 186 aa  158  4e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.456908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  45.93 
 
 		 193 aa  157  5e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  46.78 
 
 		 184 aa  156  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2228  cytochrome B561  47.13 
 
 		 197 aa  156  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000575966  hitchhiker  0.00851734 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  44.25 
 
 		 185 aa  154  5.0000000000000005e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563423 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2532  cytochrome B561  46.78 
 
 		 206 aa  153  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2549  cytochrome B561  47.02 
 
 		 182 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481387  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1026  cytochrome B561  43.1 
 
 		 188 aa  147  6e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3580  cytochrome B561  49.4 
 
 		 172 aa  144  7.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1554  cytochrome B561  50.6 
 
 		 183 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0471  cytochrome B561  48.02 
 
 		 209 aa  137  7e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2380  cytochrome b561, putative  49.12 
 
 		 187 aa  134  5e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3379  cytochrome B561  49.12 
 
 		 187 aa  134  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3370  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  49.12 
 
 		 187 aa  134  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3336  cytochrome B561  49.12 
 
 		 187 aa  134  5e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1157  putative cytochrome b561  49.12 
 
 		 187 aa  134  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2565  putative cytochrome b561  49.12 
 
 		 187 aa  134  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0295  putative cytochrome b561  49.12 
 
 		 187 aa  134  5e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2818  cytochrome B561  45.03 
 
 		 183 aa  131  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1271  cytochrome b561, putative  47.65 
 
 		 187 aa  130  9e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2322  cytochrome B561  42.13 
 
 		 203 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1612  hypothetical protein  44.44 
 
 		 176 aa  127  5.0000000000000004e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1617  hypothetical protein  42.35 
 
 		 176 aa  127  8.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1934  cytochrome B561  42.46 
 
 		 190 aa  125  4.0000000000000003e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.48407  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1169  cytochrome b561, putative  39.41 
 
 		 173 aa  123  1e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.840411  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  38.82 
 
 		 188 aa  123  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2179  cytochrome B561  41.34 
 
 		 203 aa  122  3e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2955  cytochrome B561  43.27 
 
 		 188 aa  120  9e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.593019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0201  putative cytochrome b-561 protein  41.76 
 
 		 222 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2358  cytochrome B561  37.65 
 
 		 178 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7083  cytochrome B561  41.21 
 
 		 199 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2745  putative cytochrome B561  34.71 
 
 		 191 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0005  cytochrome B561  37.79 
 
 		 177 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0183044 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3599  cytochrome b561 family protein  40.8 
 
 		 189 aa  110  9e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.206371  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0469  cytochrome B561  34.71 
 
 		 175 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0603  cytochrome B561  38.46 
 
 		 188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  38.37 
 
 		 175 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0296  cytochrome B561  38.37 
 
 		 174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000303628  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5081  cytochrome B561  33.53 
 
 		 175 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  38.37 
 
 		 175 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.083674  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6306  cytochrome B561  33.33 
 
 		 191 aa  108  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3478  cytochrome B561  40.83 
 
 		 180 aa  108  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  hitchhiker  0.000371098 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0073  cytochrome b561, putative  38.37 
 
 		 175 aa  108  5e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.475436  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  36.26 
 
 		 196 aa  108  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  34.88 
 
 		 182 aa  107  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2731  cytochrome B561  37.64 
 
 		 188 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.578795  normal  0.080966 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  34.88 
 
 		 182 aa  106  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2303  cytochrome B561  38.04 
 
 		 187 aa  106  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.469268  normal  0.0531302 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0508  cytochrome B561  36.05 
 
 		 191 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2465  putative cytochrome b561  38.6 
 
 		 188 aa  105  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104825 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3195  cytochrome B561  34.3 
 
 		 176 aa  105  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000038673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0014  cytochrome B561  35.47 
 
 		 176 aa  105  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  34.3 
 
 		 187 aa  105  5e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0098  putative cytochrome B561  32.94 
 
 		 191 aa  104  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0006  cytochrome B561  35.47 
 
 		 176 aa  104  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000161036  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4401  cytochrome B561  41.01 
 
 		 201 aa  104  7e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.425577 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0252  cytochrome B561  35.29 
 
 		 180 aa  104  8e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0009  cytochrome B561  34.88 
 
 		 176 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000853372  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0062  cytochrome B561  34.88 
 
 		 176 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000272347  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0030  cytochrome B561  34.88 
 
 		 177 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000693928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0686  cytochrome b561  39.05 
 
 		 188 aa  102  2e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1906  cytochrome b561 family protein  37.36 
 
 		 183 aa  102  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3044  cytochrome B561  36.05 
 
 		 190 aa  101  5e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1272  cytochrome B561  38.46 
 
 		 190 aa  101  6e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.0192884 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3202  cytochrome B561  41.57 
 
 		 197 aa  101  6e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.30143 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1738  hypothetical protein  33.33 
 
 		 186 aa  100  7e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0392514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0980  putative cytochrome b561  36.78 
 
 		 177 aa  100  7e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0418  cytochrome B561  38.79 
 
 		 196 aa  100  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134853  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01053  predicted cytochrome b561  38.37 
 
 		 188 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.580116  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2589  cytochrome B561  38.37 
 
 		 188 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.806134  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6508  cytochrome B561  38.79 
 
 		 188 aa  99.4  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0286753 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2073  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  37.79 
 
 		 213 aa  99.8  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.636056  normal  0.331643 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7129  putative cytochrome b561  35.88 
 
 		 176 aa  99.8  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01061  hypothetical protein  38.37 
 
 		 188 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0967  cytochrome B561  36.36 
 
 		 181 aa  99.8  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2036  cytochrome B561  36.26 
 
 		 193 aa  99.8  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.625854 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2543  cytochrome B561  38.37 
 
 		 188 aa  99  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.210551  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1180  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  38.37 
 
 		 188 aa  99  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1179  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  38.37 
 
 		 188 aa  99  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1538  cytochrome B561  38.24 
 
 		 191 aa  99  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.757647 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>