50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2786 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_2786  putative transmembrane protein  100 
 
 
180 aa  365  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000254813  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1668  putative transmembrane protein  32.2 
 
 
182 aa  107  9.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.177896 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3846  hypothetical protein  35.09 
 
 
183 aa  102  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0901  putative transmembrane protein  33.96 
 
 
178 aa  100  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0767133  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0937  hypothetical protein  37.93 
 
 
202 aa  100  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.650732  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0093  hypothetical protein  36.6 
 
 
188 aa  99  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000564586 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0112  putative transmembrane protein  35 
 
 
146 aa  94  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3745  putative transmembrane protein  35.48 
 
 
200 aa  90.9  8e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0394509  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2315  putative transmembrane protein  30.41 
 
 
184 aa  87.8  7e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.49097  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2951  hypothetical protein  33.33 
 
 
179 aa  86.7  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.64578  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1561  hypothetical protein  30 
 
 
215 aa  85.1  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1267  putative transmembrane protein  28.98 
 
 
177 aa  80.5  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4009  hypothetical protein  32.43 
 
 
178 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.898368  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4007  hypothetical protein  32.65 
 
 
179 aa  77.4  0.00000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2462  putative transmembrane protein  26.82 
 
 
199 aa  75.9  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.656793  normal  0.0703226 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1551  hypothetical protein  29.05 
 
 
217 aa  75.1  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3849  hypothetical protein  29.56 
 
 
171 aa  72.4  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.125049  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0665  hypothetical protein  25.32 
 
 
167 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1230  putative transmembrane protein  32.41 
 
 
185 aa  64.7  0.0000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4467  putative transmembrane protein  34.66 
 
 
190 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00546453  normal  0.335651 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4601  putative transmembrane protein  34.66 
 
 
190 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0346452  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2371  hypothetical protein  25.87 
 
 
170 aa  62.4  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.221129 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3832  hypothetical protein  28.57 
 
 
183 aa  58.5  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0768  hypothetical protein  28.22 
 
 
176 aa  58.2  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0239  hypothetical protein  26.36 
 
 
177 aa  53.9  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.469269  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1282  hypothetical protein  25.68 
 
 
186 aa  53.1  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3482  hypothetical protein  23.53 
 
 
220 aa  53.1  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0571375  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01895  putative transmembrane protein  33.33 
 
 
188 aa  50.8  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0216755  normal  0.443303 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0778  putative transmembrane protein  27.97 
 
 
199 aa  50.1  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3632  hypothetical protein  23.08 
 
 
177 aa  49.3  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0932  hypothetical protein  27.48 
 
 
184 aa  49.3  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0643  hypothetical protein  24.26 
 
 
235 aa  48.5  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.817874  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5256  hypothetical protein  24.82 
 
 
173 aa  48.5  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.631222  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3082  hypothetical protein  23.86 
 
 
203 aa  48.5  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0625328 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4669  hypothetical protein  22.63 
 
 
188 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0865446 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5028  hypothetical protein  23.19 
 
 
265 aa  48.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.966496  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3339  hypothetical protein  23.19 
 
 
174 aa  48.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4248  hypothetical protein  22.46 
 
 
192 aa  47.8  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4957  hypothetical protein  22.79 
 
 
235 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.598069 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49880  hypothetical protein  22.46 
 
 
190 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4535  hypothetical protein  21.32 
 
 
188 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.026025  normal  0.651544 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4671  hypothetical protein  21.9 
 
 
188 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.12708 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0763  hypothetical protein  20.9 
 
 
181 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.652238  normal  0.0879583 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2221  hypothetical protein  24.86 
 
 
212 aa  44.7  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5029  putative transmembrane protein  25.55 
 
 
176 aa  43.9  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.313273  normal  0.903322 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0674  hypothetical protein  19.63 
 
 
204 aa  44.3  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.371067  normal  0.849594 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4437  hypothetical protein  23.36 
 
 
235 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000924263 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2244  hypothetical protein  24.14 
 
 
216 aa  43.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.28842 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3616  hypothetical protein  21.01 
 
 
236 aa  42.7  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2866  putative periplasmic protein  22.6 
 
 
172 aa  41.2  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00540777 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>