60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2767 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2767  hemerythrin HHE cation binding region  100 
 
 		 189 aa  383  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0539302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3084  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  73.4 
 
 		 191 aa  291  3e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.664175  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1521  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  43.46 
 
 		 199 aa  162  3e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.343981  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1209  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  43.62 
 
 		 195 aa  154  9e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0219  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  44.92 
 
 		 191 aa  152  2.9999999999999998e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00618287 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2830  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  43.32 
 
 		 194 aa  147  9e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.168396  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0227  hemerythrin HHE cation binding protein  39.79 
 
 		 193 aa  143  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.172932  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0293  hemerythrin HHE cation binding protein  42.55 
 
 		 207 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1354  rhodopsin-like G-protein  40.31 
 
 		 222 aa  136  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2455  hemerythrin HHE cation binding region  35.79 
 
 		 196 aa  133  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0364  ABC transporter  40.21 
 
 		 437 aa  132  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0199162  unclonable  0.000000063148 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0042  hemerythrin HHE cation binding region  39.89 
 
 		 198 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5608  hemerythrin HHE cation binding domain protein  38.12 
 
 		 190 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0910  hemerythrin HHE cation binding region  38.1 
 
 		 194 aa  123  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7075  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  36.96 
 
 		 191 aa  122  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.729723 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6235  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  37.16 
 
 		 194 aa  120  8e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.840009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1515  hemerythrin HHE cation binding region  36.42 
 
 		 176 aa  111  6e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1479  hemerythrin HHE cation binding region  32.04 
 
 		 197 aa  93.6  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.786202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3872  hemerythrin HHE cation binding region  31.32 
 
 		 197 aa  88.6  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1855  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.44 
 
 		 196 aa  85.9  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.013511  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3819  hemerythrin HHE cation binding region  28.73 
 
 		 196 aa  84  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4024  hypothetical protein  30.59 
 
 		 193 aa  79.3  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.336316 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7704  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  32.35 
 
 		 186 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3843  hypothetical protein  29.53 
 
 		 343 aa  68.9  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1756  hemerythrin HHE cation binding region  26.82 
 
 		 177 aa  68.6  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0260  hemerythrin HHE cation binding protein  26.45 
 
 		 183 aa  62.8  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0307  hypothetical protein  29.68 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000126228  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004449  hypothetical protein  25.43 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0387473  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1086  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.9 
 
 		 180 aa  52.4  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00113012  normal  0.0726864 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0760  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  27.15 
 
 		 177 aa  51.6  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000791976  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0910  hypothetical protein  27.21 
 
 		 179 aa  50.4  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.162836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1164  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  22.95 
 
 		 184 aa  49.7  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1277  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.35 
 
 		 185 aa  50.1  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000400802  normal  0.0499569 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1196  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.4 
 
 		 182 aa  50.4  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.406056  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2737  hemerythrin HHE cation binding region  26.9 
 
 		 181 aa  49.7  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000357239  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1284  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.74 
 
 		 179 aa  48.5  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0263304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1774  hemerythrin HHE cation binding region  27.45 
 
 		 186 aa  48.1  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7174  hypothetical protein  28.92 
 
 		 307 aa  48.1  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1328  hypothetical protein  25.3 
 
 		 183 aa  47.4  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.242425  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0685  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.06 
 
 		 187 aa  46.6  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.434426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1046  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.58 
 
 		 178 aa  46.6  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.012593  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00946  hypothetical protein  23.7 
 
 		 183 aa  46.2  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3669  hypothetical protein  27.21 
 
 		 185 aa  45.8  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0292536 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3052  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  25.85 
 
 		 178 aa  46.2  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0120617  normal  0.148457 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2970  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  25.85 
 
 		 178 aa  46.2  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000182912  normal  0.370735 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2937  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  24.72 
 
 		 184 aa  45.1  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1142  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  25.17 
 
 		 178 aa  44.7  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.325116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3249  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  25.17 
 
 		 178 aa  45.1  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.890516  hitchhiker  0.00150235 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1108  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  25.17 
 
 		 178 aa  45.1  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.210963  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1041  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  25.17 
 
 		 178 aa  44.7  0.0009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00219982  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3549  hypothetical protein  27.03 
 
 		 178 aa  44.7  0.0009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3150  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.57 
 
 		 178 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.024365  normal  0.772285 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2550  putative hemerythrin  22.84 
 
 		 176 aa  44.3  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1071  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.97 
 
 		 183 aa  43.1  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0736  hypothetical protein  24.84 
 
 		 213 aa  42.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.388253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1937  hypothetical protein  23.56 
 
 		 213 aa  42.7  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000015412  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1597  hemerythrin HHE cation binding region  27.74 
 
 		 177 aa  42.4  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.768096  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0359  hypothetical protein  30.77 
 
 		 191 aa  42  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7884  hypothetical protein  28.7 
 
 		 212 aa  42  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.765433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1182  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  22.07 
 
 		 181 aa  41.6  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0279735  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>