224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2745 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_2745  oxidoreductase FAD-binding region  100 
 
 
438 aa  882    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.923892 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40020  Oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  42.48 
 
 
443 aa  303  3.0000000000000004e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1926  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  40.61 
 
 
446 aa  300  4e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.956318  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3123  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain  39.1 
 
 
445 aa  292  1e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0075  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  40.93 
 
 
446 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.704338  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2942  flavodoxin oxidoreductase precursor  38.66 
 
 
444 aa  286  4e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.636131 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3017  ferric reductase-like transmembrane component-like  40.22 
 
 
447 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.812063  hitchhiker  0.00768092 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0748  Ferric reductase domain protein transmembrane component  39.38 
 
 
447 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2715  ferric reductase domain-containing protein  40 
 
 
447 aa  283  3.0000000000000004e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.131966  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0785  ferric reductase domain-containing protein  39.38 
 
 
447 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.984376  normal  0.103131 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2474  ferric reductase domain-containing protein  41.05 
 
 
446 aa  277  2e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000153694 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2762  ferric reductase-like transmembrane component-like  40.36 
 
 
464 aa  276  4e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.632211  normal  0.210861 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0648  hypothetical protein  41.01 
 
 
434 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07070  hypothetical protein  40.43 
 
 
434 aa  267  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1923  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  40.19 
 
 
442 aa  265  8.999999999999999e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0218525  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0489  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  39.47 
 
 
445 aa  263  3e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0316  ferric reductase-like transmembrane component-like  39.05 
 
 
444 aa  262  6.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1288  ferric reductase domain-containing protein  37.84 
 
 
438 aa  256  7e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.916227  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3216  ferric reductase domain-containing protein  37.84 
 
 
438 aa  256  7e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3051  ferric reductase/oxidoreductase, FAD/NAD binding  34.3 
 
 
441 aa  243  7e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3093  ferric reductase domain-containing protein  35.18 
 
 
443 aa  240  4e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0042  Ferric reductase domain protein protein transmembrane component domain protein  35.17 
 
 
424 aa  238  1e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.346938  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4085  ferric reductase domain-containing protein  38.33 
 
 
489 aa  231  2e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.356601 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001393  putative oxidoreductase  34.32 
 
 
440 aa  230  4e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000700174  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3433  Ferric reductase domain protein transmembrane component  38.31 
 
 
460 aa  226  6e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.319127  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1127  putative oxidoreductase  36.95 
 
 
443 aa  224  2e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000164888  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4116  hypothetical protein  34.01 
 
 
445 aa  206  7e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3739  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  29.71 
 
 
419 aa  154  2.9999999999999998e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0201  oxidoreductase, putative  26.94 
 
 
419 aa  117  3.9999999999999997e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0690  oxidoreductase FAD-binding subunit  25.29 
 
 
419 aa  110  7.000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.16906  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0093  ferric reductase domain-containing protein  27.44 
 
 
419 aa  107  4e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.852722  normal  0.641862 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1362  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  30.19 
 
 
430 aa  95.5  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.274375 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4192  ferric reductase-like transmembrane component-like  29.57 
 
 
421 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.611653  normal  0.631295 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4297  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  30.41 
 
 
421 aa  82  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.65431  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1216  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain  32.72 
 
 
420 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3223  oxidoreductase FAD-binding subunit  25.74 
 
 
681 aa  73.2  0.000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.578797  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1929  ferric reductase-like transmembrane component-like  29.07 
 
 
425 aa  71.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0299  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding protein  26.16 
 
 
445 aa  69.7  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0380  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain  25.42 
 
 
447 aa  68.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.682576  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0310  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  26.29 
 
 
444 aa  68.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.109576  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2874  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  22.72 
 
 
447 aa  67  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.892761 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0321  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  25.84 
 
 
444 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.618746  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6146  ferric reductase domain protein with transmembrane component domain  30.1 
 
 
450 aa  64.3  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352697  normal  0.0480291 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3724  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain protein  24.13 
 
 
496 aa  63.9  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1381  ferric reductase-like  26.83 
 
 
307 aa  63.5  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000207165  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6975  ferredoxin  29.71 
 
 
357 aa  63.2  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0492  ferric reductase  24.61 
 
 
435 aa  61.6  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.673317  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3069  oxidoreductase FAD-binding subunit  30.83 
 
 
368 aa  61.6  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4249  oxidoreductase FAD-binding subunit  29.47 
 
 
678 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1163  oxidoreductase, FAD-binding  27.54 
 
 
678 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.832333  normal  0.0131556 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1082  ferric reductase  23.46 
 
 
422 aa  60.5  0.00000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02772  putative Oxidoreductase  32.41 
 
 
327 aa  60.1  0.00000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0684144  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1197  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  27.73 
 
 
678 aa  60.1  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.870844  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002266  flavohemoprotein  25.44 
 
 
394 aa  59.3  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0194  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  26.51 
 
 
399 aa  58.9  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0049  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  28.49 
 
 
453 aa  58.5  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.19928  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6022  ferredoxin  28.86 
 
 
321 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0231  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  23.52 
 
 
448 aa  57.4  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.911699 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3009  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  29.15 
 
 
254 aa  57.4  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1003  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  25.87 
 
 
232 aa  57  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0767171 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2412  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  25.24 
 
 
367 aa  56.6  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0010936  hitchhiker  0.0000737899 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6656  MOSC domain containing protein  25.41 
 
 
586 aa  56.6  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.184916  normal  0.101753 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1181  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  28.04 
 
 
676 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.169829 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3574  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  27.75 
 
 
684 aa  56.2  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.323016  hitchhiker  0.00626441 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5418  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  27.27 
 
 
684 aa  56.2  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01773  predicted oxidoreductase  27.33 
 
 
321 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0325  flavohemoprotein, putative  24.05 
 
 
381 aa  55.5  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0378  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  24.4 
 
 
465 aa  55.5  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01761  hypothetical protein  27.33 
 
 
321 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1054  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  28.11 
 
 
248 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.543826  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7472  ferredoxin  28.75 
 
 
292 aa  55.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.554725 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2029  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  27.33 
 
 
321 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.435425  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6290  oxidoreductase FAD-binding region  28.7 
 
 
250 aa  54.3  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.353105  normal  0.150188 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1891  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  27.33 
 
 
321 aa  54.7  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2063  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  27.33 
 
 
321 aa  54.3  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0926  putative oxidoreductase  29.8 
 
 
691 aa  53.9  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.217257  normal  0.217739 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2219  oxidoreductase FAD-binding subunit  25.7 
 
 
363 aa  53.9  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.217987  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3922  ferric reductase domain-containing protein  23.6 
 
 
481 aa  53.1  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1840  ferredoxin  27.33 
 
 
321 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0439482  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00087  nitric oxide dioxygenase  23.04 
 
 
394 aa  52.8  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2329  flavohemoglobin  25.21 
 
 
395 aa  52.8  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.32871 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1346  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  26.36 
 
 
686 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.806534  normal  0.147049 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2660  MOSC ferredoxin--oxidoreductase  25.31 
 
 
581 aa  53.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.841081  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2529  oxidoreductase, FAD/NAD-binding/iron-sulfur cluster binding protein  27.33 
 
 
321 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00243461  normal  0.86299 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3850  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  26.79 
 
 
689 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.587017  normal  0.619403 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1830  ferredoxin  27.33 
 
 
321 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.285762 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0944  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  26.74 
 
 
399 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22410  flavodoxin reductase family protein  24.43 
 
 
350 aa  52.8  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC07160  response to stress-related protein, putative  25 
 
 
504 aa  52.4  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0916  oxidoreductase FAD-binding region  26.47 
 
 
400 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.12049  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2622  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  27.13 
 
 
358 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.367598 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3668  ferredoxin  25.68 
 
 
368 aa  52  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.650259  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0933  oxidoreductase FAD-binding subunit  26.47 
 
 
400 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3770  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  26.4 
 
 
585 aa  52  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708524  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3236  xylene monooxygenase electron transfer component  24.54 
 
 
232 aa  51.6  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.150181  normal  0.120889 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5567  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  25.33 
 
 
690 aa  51.2  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.749864  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5247  nitric oxide dioxygenase  26.19 
 
 
403 aa  51.6  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0560073  normal  0.479596 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1301  ferric reductase domain protein transmembrane component  31.96 
 
 
447 aa  51.6  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2076  oxidoreductase FAD-binding subunit  26.83 
 
 
372 aa  51.6  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.439057  normal  0.29411 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1576  2-polyprenylphenol hydroxylase and related flavodoxin oxidoreductase-like protein  24.72 
 
 
377 aa  50.8  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>