More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2712 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2712  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 405 aa  824    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.620726  hitchhiker  0.00485368 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0915  Extracellular ligand-binding receptor  55.13 
 
 		 405 aa  423  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3706  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  55.38 
 
 		 405 aa  422  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.209947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4053  extracellular ligand-binding receptor  55.91 
 
 		 406 aa  416  9.999999999999999e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1838  extracellular ligand-binding receptor  51.66 
 
 		 399 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000495341  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1164  Extracellular ligand-binding receptor  51.28 
 
 		 404 aa  396  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179963  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3521  extracellular ligand-binding receptor  53.08 
 
 		 400 aa  391  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0612  extracellular ligand-binding receptor  53.91 
 
 		 412 aa  392  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3194  Extracellular ligand-binding receptor  54.7 
 
 		 415 aa  390  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.100454  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1798  extracellular ligand-binding receptor  51.18 
 
 		 402 aa  385  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.637603  normal  0.0827017 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0299  extracellular ligand-binding receptor  49.49 
 
 		 403 aa  382  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.102439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0355  extracellular ligand-binding receptor  51.3 
 
 		 394 aa  372  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1549  extracellular ligand-binding receptor  50.13 
 
 		 392 aa  369  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.000137786  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0089  Extracellular ligand-binding receptor  46.7 
 
 		 396 aa  335  1e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3230  extracellular ligand-binding receptor  45.94 
 
 		 400 aa  332  6e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.293864  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0070  extracellular ligand-binding receptor  46.7 
 
 		 396 aa  332  7.000000000000001e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0096  extracellular ligand-binding receptor  44.91 
 
 		 416 aa  328  1.0000000000000001e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.809601 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0150  extracellular ligand-binding receptor  44.8 
 
 		 417 aa  326  4.0000000000000003e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3577  extracellular ligand-binding receptor  44.56 
 
 		 412 aa  324  1e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2179  ABC branched-chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  45.81 
 
 		 410 aa  305  7e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.138394  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1699  Extracellular ligand-binding receptor  45.81 
 
 		 410 aa  305  8.000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.574188  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1770  Extracellular ligand-binding receptor  45.55 
 
 		 410 aa  303  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.718343  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1682  extracellular ligand-binding receptor  43.03 
 
 		 410 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000183641  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0480  Extracellular ligand-binding receptor  43.25 
 
 		 407 aa  299  6e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2081  twin-arginine translocation pathway signal  30.52 
 
 		 394 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0291  extracellular ligand-binding receptor  32.78 
 
 		 401 aa  172  1e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.512826 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1966  Extracellular ligand-binding receptor  31.69 
 
 		 396 aa  169  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0542442 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4853  extracellular ligand-binding receptor  31.97 
 
 		 396 aa  166  9e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5340  Extracellular ligand-binding receptor  31.97 
 
 		 396 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.200092  normal  0.984381 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3837  extracellular ligand-binding receptor  31.28 
 
 		 395 aa  161  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3303  extracellular ligand-binding receptor  31.01 
 
 		 393 aa  157  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2165  extracellular ligand-binding receptor  30.66 
 
 		 390 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2038  Extracellular ligand-binding receptor  28.3 
 
 		 379 aa  144  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000518039 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2189  Extracellular ligand-binding receptor  28.38 
 
 		 379 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1050  extracellular ligand-binding receptor  28.53 
 
 		 381 aa  140  4.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.464924 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2130  extracellular ligand-binding receptor  28.49 
 
 		 380 aa  139  6e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.482674  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1671  extracellular ligand-binding receptor  26.33 
 
 		 379 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2019  extracellular ligand-binding receptor  30.3 
 
 		 374 aa  133  6e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2131  extracellular ligand-binding receptor  27.92 
 
 		 379 aa  133  6e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0617424  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4060  extracellular ligand-binding receptor  29.34 
 
 		 400 aa  132  9e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1823  extracellular ligand-binding receptor  26.78 
 
 		 380 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1861  Extracellular ligand-binding receptor  28.41 
 
 		 379 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.571716  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0893  extracellular ligand-binding receptor  29.04 
 
 		 396 aa  129  7.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1681  extracellular ligand-binding receptor  27.85 
 
 		 385 aa  128  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.681493  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1734  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  27.09 
 
 		 380 aa  126  8.000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.534498  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1735  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  28.97 
 
 		 378 aa  125  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.583415  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0219  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.08 
 
 		 376 aa  124  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00187981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1404  Extracellular ligand-binding receptor  25.13 
 
 		 383 aa  123  6e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0995  Extracellular ligand-binding receptor  27.44 
 
 		 379 aa  123  6e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.725983  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0680  extracellular ligand-binding receptor  26.32 
 
 		 399 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3366  extracellular ligand-binding receptor  26.33 
 
 		 397 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.453868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4549  Extracellular ligand-binding receptor  26.46 
 
 		 393 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3105  Extracellular ligand-binding receptor  24.94 
 
 		 389 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3767  Extracellular ligand-binding receptor  27.01 
 
 		 397 aa  119  7e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1860  Extracellular ligand-binding receptor  27.11 
 
 		 382 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.153544  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2020  extracellular ligand-binding receptor  28.42 
 
 		 384 aa  116  6e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168799 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0376  extracellular ligand-binding receptor  26.23 
 
 		 381 aa  116  6.9999999999999995e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000374663  hitchhiker  0.000123514 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1137  Extracellular ligand-binding receptor  29.67 
 
 		 393 aa  114  3e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0165472  normal  0.816566 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0378  extracellular ligand-binding receptor  25.06 
 
 		 396 aa  114  4.0000000000000004e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.432032 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3208  Extracellular ligand-binding receptor  30.42 
 
 		 376 aa  114  5e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0668  extracellular ligand-binding receptor  26.23 
 
 		 392 aa  112  8.000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.431771  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0612  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched chain amino acid-binding protein  28.53 
 
 		 371 aa  112  9e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03165  Extracellular ligand-binding receptor  27.48 
 
 		 364 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1934  Extracellular ligand-binding receptor  29.25 
 
 		 397 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000937878  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0932  Extracellular ligand-binding receptor  28.65 
 
 		 376 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000568006  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3822  Extracellular ligand-binding receptor  25.51 
 
 		 394 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000102798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0833  extracellular ligand-binding receptor  24.38 
 
 		 383 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000252201  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1848  extracellular ligand-binding receptor  26.88 
 
 		 389 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0671771  normal  0.122571 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2607  Extracellular ligand-binding receptor  28.53 
 
 		 372 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2086  Extracellular ligand-binding receptor  29.1 
 
 		 372 aa  110  5e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1741  Extracellular ligand-binding receptor  26.92 
 
 		 375 aa  110  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.734186  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2283  Extracellular ligand-binding receptor  28.99 
 
 		 395 aa  110  6e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000119381 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1520  extracellular ligand-binding receptor  26.56 
 
 		 381 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.657552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2254  extracellular ligand-binding receptor  26.4 
 
 		 376 aa  108  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0258  amino acid ABC transporter, periplasmic-binding protein  27.25 
 
 		 393 aa  108  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5431  extracellular ligand-binding receptor  27.01 
 
 		 372 aa  107  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.836307  normal  0.601412 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4797  extracellular ligand-binding receptor  25.91 
 
 		 381 aa  107  5e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.863571  normal  0.40666 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3823  Extracellular ligand-binding receptor  26.68 
 
 		 394 aa  106  6e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00025514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4013  extracellular ligand-binding receptor  29.46 
 
 		 391 aa  106  7e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00118971  normal  0.173861 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3401  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  26.92 
 
 		 396 aa  105  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.232513  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2502  Extracellular ligand-binding receptor  28.37 
 
 		 400 aa  105  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1650  extracellular ligand-binding receptor  27.79 
 
 		 393 aa  105  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.154413  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0523  Extracellular ligand-binding receptor  27.43 
 
 		 390 aa  105  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0215267  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2647  extracellular ligand-binding receptor  26.7 
 
 		 397 aa  105  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.154433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2553  extracellular ligand-binding receptor  28.53 
 
 		 386 aa  104  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1478  Extracellular ligand-binding receptor  24.33 
 
 		 405 aa  104  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2306  Extracellular ligand-binding receptor  28.36 
 
 		 419 aa  103  4e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.110917  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1027  extracellular ligand-binding receptor  28.09 
 
 		 384 aa  103  5e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000000299575  normal  0.161964 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3679  extracellular ligand-binding receptor  25.2 
 
 		 407 aa  103  7e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0472  Extracellular ligand-binding receptor  28.92 
 
 		 373 aa  103  8e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.538302  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0350  extracellular ligand-binding receptor  26.01 
 
 		 376 aa  102  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000281139  normal  0.291499 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2750  Extracellular ligand-binding receptor  25.68 
 
 		 375 aa  102  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1257  extracellular ligand-binding receptor  24.44 
 
 		 386 aa  102  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000744493  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3905  extracellular ligand-binding receptor  27.38 
 
 		 388 aa  101  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.504593  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1478  Extracellular ligand-binding receptor  27.01 
 
 		 376 aa  100  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3057  Extracellular ligand-binding receptor  27.27 
 
 		 398 aa  100  6e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0486  extracellular ligand-binding receptor  27.53 
 
 		 374 aa  100  6e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.853674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1214  extracellular ligand-binding receptor  27.86 
 
 		 380 aa  100  7e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0317  extracellular ligand-binding receptor  27.47 
 
 		 382 aa  99.8  8e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00438106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3994  extracellular ligand-binding receptor  28.57 
 
 		 339 aa  99.8  8e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000070067  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>