More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2630 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2630  peptidase A8, signal peptidase II  100 
 
 		 166 aa  328  2e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.946096 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2624  signal peptidase II  96.25 
 
 		 111 aa  154  6e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.362535 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  50.33 
 
 		 170 aa  152  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3391  lipoprotein signal peptidase  48.77 
 
 		 166 aa  150  5.9999999999999996e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.137503 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2304  signal peptidase II  48.77 
 
 		 166 aa  150  5.9999999999999996e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000504038  hitchhiker  0.000155189 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3463  lipoprotein signal peptidase  53.69 
 
 		 359 aa  147  8e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4320  signal peptidase II  53.69 
 
 		 359 aa  147  8e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  47.74 
 
 		 171 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1243  signal peptidase II  57.64 
 
 		 364 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3587  lipoprotein signal peptidase  45.81 
 
 		 169 aa  142  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0789  lipoprotein signal peptidase  45.81 
 
 		 169 aa  142  3e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.56712 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  45.1 
 
 		 170 aa  141  5e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  45.1 
 
 		 170 aa  141  5e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  45.1 
 
 		 170 aa  141  5e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3459  lipoprotein signal peptidase  45.81 
 
 		 169 aa  140  9e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0475821  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5948  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase /lipoprotein signal peptidase involved in Pb(II) resistance PbrB/C  49.39 
 
 		 358 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.418988 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  47.92 
 
 		 166 aa  138  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3274  lipoprotein signal peptidase  51.75 
 
 		 171 aa  137  6e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00894133  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  47.3 
 
 		 171 aa  137  6e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2146  lipoprotein signal peptidase  53.19 
 
 		 167 aa  137  6e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.669133  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  48.03 
 
 		 154 aa  137  7.999999999999999e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3652  lipoprotein signal peptidase  47.1 
 
 		 170 aa  137  8.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  46.62 
 
 		 171 aa  136  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  46.62 
 
 		 171 aa  136  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  46.62 
 
 		 171 aa  136  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3531  lipoprotein signal peptidase  45.1 
 
 		 170 aa  136  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  47.92 
 
 		 166 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3845  lipoprotein signal peptidase  45.81 
 
 		 170 aa  136  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  47.92 
 
 		 166 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  47.92 
 
 		 166 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  47.92 
 
 		 166 aa  136  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  47.92 
 
 		 166 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  47.92 
 
 		 166 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  47.92 
 
 		 166 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  47.92 
 
 		 166 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0472  lipoprotein signal peptidase  49.33 
 
 		 170 aa  135  4e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1105  lipoprotein signal peptidase  49.33 
 
 		 170 aa  135  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2904  lipoprotein signal peptidase  49.33 
 
 		 170 aa  135  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.353036  normal  0.916389 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1606  lipoprotein signal peptidase  49.33 
 
 		 170 aa  135  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2910  lipoprotein signal peptidase  49.33 
 
 		 170 aa  135  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0390  lipoprotein signal peptidase  49.33 
 
 		 170 aa  135  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0884  lipoprotein signal peptidase  49.33 
 
 		 170 aa  135  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.978547 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  45.95 
 
 		 163 aa  134  4e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  42.86 
 
 		 168 aa  134  5e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  46.53 
 
 		 166 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1119  lipoprotein signal peptidase  48.63 
 
 		 173 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1814  lipoprotein signal peptidase  50 
 
 		 358 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.344803 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  41.67 
 
 		 176 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  47.22 
 
 		 166 aa  132  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0925  lipoprotein signal peptidase  45.86 
 
 		 168 aa  132  3e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  45.16 
 
 		 157 aa  132  3e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0889  lipoprotein signal peptidase  50.71 
 
 		 170 aa  132  3e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2327  lipoprotein signal peptidase  50.71 
 
 		 170 aa  132  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  42.86 
 
 		 180 aa  131  3.9999999999999996e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004418  lipoprotein signal peptidase  43.59 
 
 		 169 aa  131  3.9999999999999996e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00031  signal peptidase II  48.05 
 
 		 164 aa  131  5e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00165346  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00030  hypothetical protein  48.05 
 
 		 164 aa  131  5e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0011292  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  46.53 
 
 		 166 aa  131  5e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00981  lipoprotein signal peptidase  50 
 
 		 168 aa  130  6.999999999999999e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  46.53 
 
 		 166 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  43.14 
 
 		 173 aa  130  9e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  42.58 
 
 		 170 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  47.86 
 
 		 176 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0029  lipoprotein signal peptidase  47.4 
 
 		 164 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0223845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  46.53 
 
 		 172 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  44.37 
 
 		 170 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  41.56 
 
 		 176 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  43.05 
 
 		 170 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3572  lipoprotein signal peptidase  47.4 
 
 		 164 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.262738  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0031  lipoprotein signal peptidase  47.4 
 
 		 164 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112205  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  45.03 
 
 		 172 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0027  lipoprotein signal peptidase  47.4 
 
 		 164 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.102784  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0025  lipoprotein signal peptidase  47.4 
 
 		 164 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.258735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  46.53 
 
 		 166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  49.29 
 
 		 164 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0029  lipoprotein signal peptidase  47.4 
 
 		 164 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0677738  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  46.53 
 
 		 166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3628  lipoprotein signal peptidase  47.4 
 
 		 164 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.73283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  46.53 
 
 		 166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1741  lipoprotein signal peptidase  46.31 
 
 		 162 aa  128  4.0000000000000003e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  44.52 
 
 		 182 aa  127  6e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0699  lipoprotein signal peptidase  44.06 
 
 		 169 aa  127  7.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.390058  normal  0.0603607 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3451  lipoprotein signal peptidase  46.9 
 
 		 169 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.10093  normal  0.187541 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0215  lipoprotein signal peptidase  45.83 
 
 		 171 aa  125  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0133386  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3473  lipoprotein signal peptidase  51.15 
 
 		 170 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.911066  normal  0.126226 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0585  lipoprotein signal peptidase  46.1 
 
 		 166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00142013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3400  lipoprotein signal peptidase  47.59 
 
 		 165 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.256213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  45.14 
 
 		 178 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1431  lipoprotein signal peptidase  47.06 
 
 		 169 aa  125  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2736  lipoprotein signal peptidase  46 
 
 		 165 aa  125  3e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.396586  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  47.14 
 
 		 173 aa  124  7e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  44.14 
 
 		 178 aa  123  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  42.86 
 
 		 163 aa  123  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5353  lipoprotein signal peptidase  50.71 
 
 		 357 aa  123  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00779044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1409  lipoprotein signal peptidase  45 
 
 		 170 aa  122  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1267  lipoprotein signal peptidase  44.29 
 
 		 170 aa  122  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131578  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0480  lipoprotein signal peptidase  48.91 
 
 		 159 aa  122  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0050  lipoprotein signal peptidase  46.94 
 
 		 166 aa  122  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.612919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0222  lipoprotein signal peptidase  50.38 
 
 		 170 aa  122  3e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0051  lipoprotein signal peptidase  46.94 
 
 		 166 aa  122  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.322975 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>