More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2592 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_2592  oxidoreductase, molybdopterin binding  100 
 
 
262 aa  548  1e-155  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.938521  normal  0.743537 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1518  oxidoreductase, molybdopterin binding  85.88 
 
 
263 aa  464  9.999999999999999e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0541  oxidoreductase, molybdopterin binding  79.55 
 
 
263 aa  455  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding  79.17 
 
 
263 aa  453  1.0000000000000001e-126  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2990  oxidoreductase molybdopterin binding  76.63 
 
 
263 aa  413  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0297  oxidoreductase molybdopterin binding  76.25 
 
 
263 aa  408  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3134  oxidoreductase molybdopterin binding  78.57 
 
 
263 aa  404  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0309  oxidoreductase molybdopterin binding  75.48 
 
 
263 aa  404  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.261244  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0620  hypothetical protein  69.35 
 
 
257 aa  375  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1510  oxidoreductase molybdopterin binding  66.14 
 
 
262 aa  373  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.832441  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2177  putative oxidoreductase, molybdopterin binding  68.33 
 
 
258 aa  367  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.60597 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0744  oxidoreductase, molybdopterin binding  70 
 
 
262 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1198  oxidoreductase molybdopterin binding  69.58 
 
 
262 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0452128  normal  0.688101 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1225  oxidoreductase, molybdopterin binding  70 
 
 
262 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2666  oxidoreductase molybdopterin binding  64.5 
 
 
263 aa  367  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1108  oxidoreductase molybdopterin binding  69.17 
 
 
262 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6422  oxidoreductase molybdopterin binding  64.86 
 
 
263 aa  359  2e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.603539  normal  0.600006 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1108  oxidoreductase, molybdopterin binding  68.33 
 
 
262 aa  359  2e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906624  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2840  oxidoreductase, molybdopterin-binding  68.33 
 
 
263 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1533  oxidoreductase, molybdopterin-binding  67.5 
 
 
263 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1405  oxidoreductase, molybdopterin-binding  67.5 
 
 
263 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0486  oxidoreductase, molybdopterin-binding  67.08 
 
 
263 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1201  oxidoreductase, molybdopterin-binding  67.08 
 
 
263 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.463291  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0666  oxidoreductase, molybdopterin-binding  67.08 
 
 
263 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.540729  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1201  oxidoreductase molybdopterin binding protein  62.15 
 
 
259 aa  354  6.999999999999999e-97  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1400  oxidoreductase, molybdopterin-binding  67.08 
 
 
263 aa  354  8.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4334  oxidoreductase, molybdopterin binding  67.08 
 
 
262 aa  354  8.999999999999999e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.868418  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3085  oxidoreductase, molybdopterin-binding  67.08 
 
 
263 aa  353  1e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5020  oxidoreductase molybdopterin binding  66.93 
 
 
258 aa  347  1e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.159564 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6764  oxidoreductase molybdopterin binding  63.89 
 
 
257 aa  345  4e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4930  oxidoreductase molybdopterin binding  62.75 
 
 
258 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.73484  normal  0.226199 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1752  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  62.75 
 
 
258 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175218  normal  0.213675 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1697  oxidoreductase molybdopterin binding  64.02 
 
 
249 aa  323  1e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0333  twin-arginine translocation pathway signal  60.16 
 
 
259 aa  315  6e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0487  twin-arginine translocation pathway signal  59.52 
 
 
259 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.254321  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2751  oxidoreductase molybdopterin binding  62.34 
 
 
249 aa  312  3.9999999999999997e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0587289 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3371  oxidoreductase, molybdopterin binding  58.05 
 
 
256 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0860075  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3725  oxidoreductase molybdopterin binding  58.58 
 
 
255 aa  305  3e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1495  oxidoreductase molybdopterin binding  59.75 
 
 
255 aa  305  7e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0242  twin-arginine translocation pathway signal  55.56 
 
 
259 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.297118  normal  0.0333661 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0338  putative oxidoreductase molybdopterin binding  54.92 
 
 
260 aa  300  2e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0092485  normal  0.0273242 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3600  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  60.28 
 
 
215 aa  290  1e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0223  oxidoreductase molybdopterin binding  54.18 
 
 
259 aa  288  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.613741  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3598  oxidoreductase, molybdopterin binding  52.96 
 
 
261 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64540  hypothetical protein  59.07 
 
 
255 aa  285  5.999999999999999e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5604  hypothetical protein  59.07 
 
 
255 aa  283  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3286  oxidoreductase molybdopterin binding  55.02 
 
 
241 aa  279  4e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18954  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2994  oxidoreductase, molybdopterin binding  57.26 
 
 
239 aa  278  7e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0961  oxidoreductase molybdopterin binding  52.4 
 
 
263 aa  264  1e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4897  oxidoreductase molybdopterin binding  54.59 
 
 
241 aa  259  3e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00490947  decreased coverage  0.000741335 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2349  hypothetical protein  40.64 
 
 
256 aa  167  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.672728  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3628  oxidoreductase molybdopterin binding  41.56 
 
 
234 aa  165  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0640094 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2568  oxidoreductase molybdopterin binding  36.51 
 
 
258 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0385834  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0864  oxidoreductase molybdopterin binding  37.94 
 
 
259 aa  157  1e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1625  oxidoreductase molybdopterin binding  38.06 
 
 
256 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.464814  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4816  oxidoreductase molybdopterin binding  36.11 
 
 
258 aa  155  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.553663  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1638  oxidoreductase molybdopterin binding  39.66 
 
 
234 aa  155  8e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.934019  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0015  oxidoreductase, molybdopterin-binding  37.6 
 
 
262 aa  155  9e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.642429  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0018  oxidoreductase, molybdopterin-binding  37.25 
 
 
262 aa  154  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0958  oxidoreductase, molybdopterin binding  37.96 
 
 
240 aa  154  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2311  molybdopterin-binding oxidoreductase  39.66 
 
 
234 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1560  oxidoreductase molybdopterin binding  38.36 
 
 
234 aa  152  4e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1812  oxidoreductase, molybdopterin binding  38.68 
 
 
249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.218509  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0563  oxidoreductase, molybdopterin binding  36.8 
 
 
251 aa  146  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276964  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4106  oxidoreductase molybdopterin binding  35.69 
 
 
262 aa  146  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4164  oxidoreductase molybdopterin binding  37.71 
 
 
234 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.430302 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0491  oxidoreductase, molybdopterin binding  43.67 
 
 
256 aa  135  5e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.727181  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4346  oxidoreductase, molybdopterin binding  38.46 
 
 
233 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.315393  normal  0.221875 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3845  oxidoreductase molybdopterin binding  33.74 
 
 
247 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.624438  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4154  oxidoreductase molybdopterin binding  33.33 
 
 
247 aa  130  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177098  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1008  oxidoreductase molybdopterin binding  30.25 
 
 
319 aa  125  9e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.700197  normal  0.289957 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4302  oxidoreductase molybdopterin binding  32.11 
 
 
247 aa  124  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3632  oxidoreductase molybdopterin binding  31.92 
 
 
315 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.363586 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3309  oxidoreductase molybdopterin binding  31.92 
 
 
315 aa  117  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.62654 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3509  oxidoreductase molybdopterin binding  31.07 
 
 
318 aa  112  9e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3943  oxidoreductase, molybdopterin binding  36.36 
 
 
253 aa  107  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4244  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.03 
 
 
266 aa  106  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.978688  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0650  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.1 
 
 
237 aa  96.7  3e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0972302  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  38.62 
 
 
495 aa  94.4  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0908687  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0316  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.14 
 
 
517 aa  93.2  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0938  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.41 
 
 
199 aa  89  7e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.378305  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7397  oxidoreductase molybdopterin binding  31.96 
 
 
242 aa  89  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.71227  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2793  oxidoreductase molybdopterin binding  33.14 
 
 
206 aa  88.6  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1564  putative sulfite oxidase subunit YedY  31.25 
 
 
311 aa  88.2  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0532333  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0362  oxidoreductase, molybdopterin binding  29.88 
 
 
200 aa  87.8  2e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.659486  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5386  oxidoreductase molybdopterin binding protein  36.3 
 
 
243 aa  86.7  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.406653  normal  0.237779 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1086  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.67 
 
 
205 aa  85.1  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.214927 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3632  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.87 
 
 
221 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0663  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.77 
 
 
229 aa  84  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000387868  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2341  oxidoreductase, molybdopterin binding  27.65 
 
 
221 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0559328  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.26 
 
 
501 aa  82.4  0.000000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3066  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.29 
 
 
465 aa  82.4  0.000000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.419919  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1013  putative sulfite oxidase subunit YedY  32.72 
 
 
313 aa  82.4  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.300604 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0428  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.16 
 
 
230 aa  81.6  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0424  oxidoreductase molybdopterin binding  29.31 
 
 
233 aa  81.6  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6515  oxidoreductase molybdopterin binding  31.95 
 
 
227 aa  80.5  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.576413  normal  0.0950137 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5586  putative sulfite oxidase subunit YedY  36.5 
 
 
326 aa  80.9  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.18066  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3769  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.82 
 
 
328 aa  80.9  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0775  putative sulfite oxidase subunit YedY  32.3 
 
 
332 aa  81.3  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.746485  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3680  putative sulfite oxidase subunit YedY  29.41 
 
 
331 aa  79.7  0.00000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0844677  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>