242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2567 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2567  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  100 
 
 		 120 aa  244  2e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.375259 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2247  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  89.08 
 
 		 119 aa  217  5e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.616763 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2733  helix-turn-helix domain-containing protein  32.17 
 
 		 115 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000416248  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5877  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 133 aa  63.9  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00666894  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2696  transcriptional regulator, XRE family  37.04 
 
 		 117 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4456  transcriptional regulator, XRE family  51.52 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6835  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0579  transcriptional regulator, XRE family  46.27 
 
 		 70 aa  57.8  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00759938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0921  XRE family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000830973  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2402  XRE family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 152 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.314707  normal  0.620084 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4237  transcriptional regulator, XRE family  41.11 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.55821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3294  XRE family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 114 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.600359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0063  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0973127 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0677  transcriptional regulator, XRE family  43.75 
 
 		 70 aa  53.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6836  transcriptional regulator, XRE family  47.83 
 
 		 199 aa  53.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0731  transcriptional regulator, XRE family  43.28 
 
 		 70 aa  53.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.228536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2893  transcriptional regulator, XRE family  43.28 
 
 		 70 aa  53.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0147391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 83 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2822  transcriptional regulator, XRE family  45 
 
 		 80 aa  51.2  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.161107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1190  transcriptional regulator, XRE family  39.47 
 
 		 79 aa  50.4  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2174  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 99 aa  50.4  0.000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.112097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2406  hypothetical protein  36.07 
 
 		 99 aa  50.4  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1224  transcriptional regulator, XRE family  40.79 
 
 		 79 aa  50.4  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0288237  hitchhiker  0.00260767 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0931  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 99 aa  50.4  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0695  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 101 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.381064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2922  XRE family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 114 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1167  XRE family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 71 aa  48.9  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1848  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 76 aa  49.7  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0889  putative transcriptional regulator, XRE family  43.33 
 
 		 99 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6461  transcriptional regulator, XRE family  45.45 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2873  hypothetical protein  36.07 
 
 		 101 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.305653  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1135  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 99 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2097  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 361 aa  48.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.961796  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0891  XRE family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 106 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2524  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 		 76 aa  48.1  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000972778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2780  transcriptional regulator, XRE family  42.42 
 
 		 152 aa  48.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0182016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0025  putative DNA-binding protein  33.82 
 
 		 81 aa  48.1  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0532078  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1091  transcriptional regulator, XRE family  39.44 
 
 		 79 aa  48.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0570  transcriptional regulator, XRE family  42.19 
 
 		 79 aa  47.8  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.532171 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1221  XRE family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 173 aa  47.8  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000921846 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3620  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 99 aa  47.4  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494695  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1315  DNA-binding protein  32.84 
 
 		 69 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4304  transcriptional regulator, XRE family  39.33 
 
 		 131 aa  47.4  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.663644 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4384  transcriptional regulator, XRE family  46.67 
 
 		 108 aa  47.4  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  38.54 
 
 		 229 aa  47  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3371  putative phage repressor  39.36 
 
 		 229 aa  47  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000119805  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0464  helix-turn-helix domain-containing protein  42.86 
 
 		 99 aa  47  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1419  Cro/CI family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1381  DNA-binding protein  32.81 
 
 		 69 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1341  DNA-binding protein  32.81 
 
 		 69 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.4555000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1178  DNA-binding protein  32.81 
 
 		 69 aa  46.2  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.826744  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1159  transcriptional regulator  34.38 
 
 		 80 aa  46.2  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1153  transcriptional regulator  32.81 
 
 		 69 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 252 aa  46.2  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1554  XRE family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.902215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0679  transcriptional regulator, XRE family  30.77 
 
 		 105 aa  46.6  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4029  DNA-binding protein  32.81 
 
 		 69 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.131881 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1419  DNA-binding protein  32.81 
 
 		 69 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2672  transcriptional regulator, XRE family  33.01 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000679525  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0461  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2793  transcriptional regulator, XRE family  41.54 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1427  transcriptional regulator, XRE family  40.3 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16550  predicted transcriptional regulator  41.56 
 
 		 204 aa  45.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5705  transcriptional regulator, XRE family  45.31 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.712971 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2624  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 73 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.930034 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0084  XRE family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1271  DNA-binding protein  35 
 
 		 65 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2436  XRE family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.109963  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2104  helix-turn-helix domain-containing protein  38.57 
 
 		 95 aa  45.4  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0694198  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2467  transcriptional regulator, XRE family  35.87 
 
 		 122 aa  46.2  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000461389  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1481  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 97 aa  46.2  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.817787 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1444  helix-turn-helix domain-containing protein  40.91 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.557197  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02550  predicted transcriptional regulator  36.51 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.596606  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0586  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 134 aa  45.4  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1907  XRE family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4162  XRE family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0874  putative transcriptional regulator, XRE family  43.33 
 
 		 117 aa  45.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1522  transcriptional regulator, XRE family  40.3 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.379498  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0726  putative phage repressor  37.04 
 
 		 225 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.255707  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3530  transcriptional regulator, XRE family  33.82 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.606022  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0017  transcriptional regulator, XRE family  44.23 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2483  transcriptional regulator, XRE family  27.38 
 
 		 143 aa  45.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0883  XRE family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 116 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.901297 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3914  XRE family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 84 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2542  transcriptional regulator, XRE family  32.91 
 
 		 116 aa  45.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.054294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0340  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 93 aa  45.4  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3341  transcriptional regulator, XRE family  42.37 
 
 		 217 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7086  transcriptional regulator, XRE family  39.62 
 
 		 119 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.633613  normal  0.10188 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2467  transcriptional regulator, XRE family  46.67 
 
 		 109 aa  45.4  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1916  transcriptional regulator, XRE family  30.77 
 
 		 128 aa  44.7  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0812721  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1159  putative transcription regulator protein  42.62 
 
 		 182 aa  44.7  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3015  putative prophage repressor  41.77 
 
 		 227 aa  44.7  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  39.06 
 
 		 135 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1345  XRE family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 209 aa  44.7  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.200207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31160  hypothetical protein  33.82 
 
 		 107 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000126154  unclonable  8.75499e-23 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0841  XRE family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 129 aa  44.7  0.0005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000196105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0364  transcriptional regulator  35.29 
 
 		 94 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.854921  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4720  XRE family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 327 aa  44.3  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0834  XRE family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 107 aa  44.3  0.0006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.259279 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3268  transciptional regulator  33.93 
 
 		 229 aa  44.3  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000953974  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>