More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2366 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010468  EcolC_0932  CTP synthetase  64.22 
 
 
545 aa  723  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000109112  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2924  CTP synthetase  64.22 
 
 
545 aa  723  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.6445e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03526  CTP synthetase  67.34 
 
 
546 aa  743  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0320  CTP synthetase  65.62 
 
 
555 aa  738  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3317  CTP synthetase  64.77 
 
 
545 aa  723  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00384789  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4318  CTP synthetase  60.89 
 
 
555 aa  664  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.13902 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4064  CTP synthetase  66.91 
 
 
542 aa  747  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  3.00969e-05 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3137  CTP synthetase  63.4 
 
 
545 aa  706  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  1.10473e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1502  CTP synthetase  65.99 
 
 
542 aa  736  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1298  CTP synthetase  67.23 
 
 
544 aa  724  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3084  CTP synthetase  64.22 
 
 
545 aa  723  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  6.46787e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1289  CTP synthetase  63.4 
 
 
545 aa  699  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.934915  hitchhiker  2.80114e-09 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0794  CTP synthetase  65.14 
 
 
545 aa  726  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0895398  normal  0.701374 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3447  CTP synthetase  64.77 
 
 
545 aa  723  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.125216  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1164  CTP synthetase  66.54 
 
 
542 aa  747  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.309398  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0980  CTP synthetase  64.77 
 
 
545 aa  723  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0184119  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1872  CTP synthetase  65.81 
 
 
555 aa  743  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1161  CTP synthetase  71.45 
 
 
553 aa  794  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00650114 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5105  CTP synthetase  63.95 
 
 
552 aa  724  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.298058 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3280  CTP synthetase  63.4 
 
 
545 aa  706  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  2.22232e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0341  CTP synthetase  63.15 
 
 
553 aa  687  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524344  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1184  CTP synthetase  64.14 
 
 
546 aa  712  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0154566  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1670  CTP synthetase  62.94 
 
 
543 aa  703  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0004808  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4167  CTP synthetase  66.73 
 
 
542 aa  748  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.675672 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2979  CTP synthetase  63.24 
 
 
534 aa  668  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.535852  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2845  CTP synthetase  65.69 
 
 
555 aa  751  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1439  CTP synthetase  64.65 
 
 
551 aa  737  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0767506  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2653  CTP synthetase  63.82 
 
 
554 aa  717  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.476334  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2195  CTP synthetase  70.36 
 
 
553 aa  786  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.136999  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1000  CTP synthetase  63.41 
 
 
552 aa  719  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1185  CTP synthetase  64.42 
 
 
566 aa  724  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.279088  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1327  CTP synthetase  64.18 
 
 
559 aa  723  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0919  CTP synthetase  67.9 
 
 
542 aa  767  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0668  CTP synthetase  62.98 
 
 
545 aa  726  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00226842  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0218  CTP synthetase  62.75 
 
 
557 aa  700  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.682216 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3123  CTP synthetase  70.18 
 
 
553 aa  784  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.839664  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3128  CTP synthetase  63.4 
 
 
545 aa  706  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  1.12535e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2026  CTP synthetase  66.06 
 
 
545 aa  730  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  4.06175e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3035  CTP synthetase  66.54 
 
 
543 aa  746  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036123 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2758  CTP synthetase  63.77 
 
 
545 aa  709  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  2.21418e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3234  CTP synthetase  65.32 
 
 
545 aa  737  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108478  normal  0.167491 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0945  CTP synthetase  70.42 
 
 
553 aa  780  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1204  CTP synthetase  64.88 
 
 
545 aa  714  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000204322  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1468  CTP synthetase  70.36 
 
 
553 aa  786  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.915674  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2633  CTP synthetase  70.36 
 
 
553 aa  786  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.267072  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2579  CTP synthetase  70.36 
 
 
570 aa  785  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1035  CTP synthetase  64.7 
 
 
545 aa  715  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.946581  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1472  CTP synthase  66.73 
 
 
555 aa  757  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38810  CTP synthetase  66.73 
 
 
543 aa  743  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0915  CTP synthetase  63.22 
 
 
552 aa  712  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1182  CTP synthetase  70.3 
 
 
547 aa  791  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.154303  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4327  CTP synthetase  61.17 
 
 
555 aa  674  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0433  CTP synthetase  58.07 
 
 
550 aa  637  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0589327 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0847  CTP synthetase  64.84 
 
 
545 aa  681  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.234606  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1236  CTP synthetase  63.59 
 
 
545 aa  707  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  1.61678e-07  hitchhiker  2.00253e-09 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1661  CTP synthetase  86.36 
 
 
550 aa  965  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4040  CTP synthetase  64.22 
 
 
545 aa  723  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  5.38941e-06  normal  0.515613 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3443  CTP synthetase  65.03 
 
 
559 aa  726  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3337  CTP synthetase  58.78 
 
 
531 aa  641  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1065  CTP synthetase  70.2 
 
 
553 aa  778  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.242214  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002506  CTP synthase  66.97 
 
 
546 aa  738  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  2.44608e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0662  CTP synthetase  66.61 
 
 
549 aa  747  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3546  CTP synthetase  65.14 
 
 
545 aa  719  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.319246  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3446  CTP synthetase  58.41 
 
 
531 aa  642  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2613  CTP synthetase  62.73 
 
 
533 aa  659  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3387  CTP synthetase  65.69 
 
 
545 aa  723  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0942417  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0817  CTP synthetase  66.06 
 
 
545 aa  728  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.351659  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02587  hypothetical protein  64.22 
 
 
545 aa  723  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  4.48332e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0851  CTP synthetase  65.32 
 
 
545 aa  728  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.718725  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2515  CTP synthetase  65.01 
 
 
546 aa  731  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000298041  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0973  CTP synthetase  64.84 
 
 
545 aa  681  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0924832 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3267  CTP synthetase  65.32 
 
 
545 aa  734  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0428959 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3093  CTP synthetase  64.22 
 
 
545 aa  723  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.106381  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1441  CTP synthetase  70.26 
 
 
553 aa  784  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0566  CTP synthetase  61.86 
 
 
554 aa  697  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.796665  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2019  CTP synthetase  70.91 
 
 
552 aa  793  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0440235 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0899  CTP synthetase  69.41 
 
 
558 aa  768  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.995561  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1176  CTP synthetase  63.39 
 
 
563 aa  707  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.413679 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0614  CTP synthetase  61.68 
 
 
554 aa  695  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2127  CTP synthetase  70.73 
 
 
552 aa  791  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0913295  normal  0.042023 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3351  CTP synthetase  64.7 
 
 
545 aa  702  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  1.38422e-06  hitchhiker  2.52338e-05 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2562  CTP synthetase  70.73 
 
 
557 aa  791  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.542571  normal  0.0982923 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0969  CTP synthetase  70.2 
 
 
553 aa  778  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.471871  normal  0.0231208 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00174  CTP synthetase  61.13 
 
 
554 aa  699  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.142517  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3086  CTP synthetase  65.5 
 
 
545 aa  736  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.35033  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1600  CTP synthetase  62.55 
 
 
533 aa  657  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4305  CTP synthetase  60.81 
 
 
555 aa  672  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03082  CTP synthetase  66.42 
 
 
543 aa  727  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  7.72842e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3111  CTP synthetase  65.32 
 
 
545 aa  733  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3150  CTP synthetase  65.32 
 
 
545 aa  734  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0858121  normal  0.288938 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3169  CTP synthetase  65.32 
 
 
545 aa  733  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0659472  normal  0.252968 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1448  CTP synthetase  61.68 
 
 
554 aa  681  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1727  CTP synthetase  60.55 
 
 
535 aa  651  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2918  CTP synthetase  64.22 
 
 
545 aa  723  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000134002  normal  0.938704 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1552  CTP synthase  66.24 
 
 
543 aa  741  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.873983  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1088  CTP synthetase  70 
 
 
550 aa  776  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1052  CTP synthetase  69.84 
 
 
549 aa  772  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0222  CTP synthetase  62.8 
 
 
543 aa  712  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.555048  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1945  CTP synthetase  62.48 
 
 
534 aa  698  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.98786e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4174  CTP synthetase  60.99 
 
 
555 aa  672  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>