More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2364 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1068  phosphopyruvate hydratase  82.2 
 
 		 427 aa  714    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.021025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2631  phosphopyruvate hydratase  81.03 
 
 		 427 aa  707    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0997  phosphopyruvate hydratase  77.8 
 
 		 428 aa  702    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1129  phosphopyruvate hydratase  81.73 
 
 		 427 aa  713    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.488598 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1163  phosphopyruvate hydratase  81.03 
 
 		 427 aa  711    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000432295 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1689  phosphopyruvate hydratase  81.03 
 
 		 427 aa  707    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0511402  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2560  phosphopyruvate hydratase  80.56 
 
 		 427 aa  706    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178105  normal  0.251128 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2364  phosphopyruvate hydratase  100 
 
 		 427 aa  867    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.593258 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1091  phosphopyruvate hydratase  81.12 
 
 		 429 aa  707    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.953298  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0621  phosphopyruvate hydratase  76.83 
 
 		 427 aa  669    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.584957 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0897  phosphopyruvate hydratase  79.63 
 
 		 428 aa  697    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2711  phosphopyruvate hydratase  81.03 
 
 		 427 aa  707    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1174  phosphopyruvate hydratase  77.99 
 
 		 427 aa  705    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.538518 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5413  phosphopyruvate hydratase  81.26 
 
 		 427 aa  712    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.456423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1439  phosphopyruvate hydratase  80.8 
 
 		 427 aa  709    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.679392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3125  phosphopyruvate hydratase  81.03 
 
 		 427 aa  707    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.411097  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1466  phosphopyruvate hydratase  81.03 
 
 		 427 aa  707    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1183  phosphopyruvate hydratase  78.04 
 
 		 428 aa  686    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1322  phosphopyruvate hydratase  77.57 
 
 		 428 aa  700    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2650  phosphopyruvate hydratase  73.83 
 
 		 428 aa  664    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0762745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1228  phosphopyruvate hydratase  75.88 
 
 		 427 aa  678    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1894  phosphopyruvate hydratase  81.26 
 
 		 427 aa  710    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1663  phosphopyruvate hydratase  81.03 
 
 		 427 aa  704    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.29135  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2650  phosphopyruvate hydratase  77.52 
 
 		 427 aa  708    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.828693  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0912  phosphopyruvate hydratase  77.8 
 
 		 428 aa  700    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2125  phosphopyruvate hydratase  81.5 
 
 		 427 aa  714    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0881955  normal  0.0226177 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1909  phosphopyruvate hydratase  76.11 
 
 		 427 aa  691    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.48075  normal  0.540424 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3184  phosphopyruvate hydratase  77.75 
 
 		 427 aa  686    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1573  phosphopyruvate hydratase  80.8 
 
 		 427 aa  708    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224968  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1055  phosphopyruvate hydratase  80.42 
 
 		 429 aa  706    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5970  phosphopyruvate hydratase  81.5 
 
 		 427 aa  714    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3446  enolase  77.99 
 
 		 427 aa  702    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0947  phosphopyruvate hydratase  79.86 
 
 		 428 aa  700    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2017  phosphopyruvate hydratase  81.03 
 
 		 427 aa  711    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00385308 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2144  phosphopyruvate hydratase  81.03 
 
 		 427 aa  711    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2847  enolase  75.75 
 
 		 433 aa  682    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.392404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2193  phosphopyruvate hydratase  81.03 
 
 		 427 aa  707    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0564709  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2107  phosphopyruvate hydratase  81.5 
 
 		 427 aa  714    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2577  phosphopyruvate hydratase  81.03 
 
 		 427 aa  707    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0972  phosphopyruvate hydratase  82.44 
 
 		 427 aa  716    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0771581  normal  0.0192441 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5108  phosphopyruvate hydratase  78.04 
 
 		 428 aa  684    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.967957  normal  0.613587 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1230  phosphopyruvate hydratase  68.22 
 
 		 428 aa  619  1e-176  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000046481  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1310  phosphopyruvate hydratase  68.22 
 
 		 429 aa  618  1e-176  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1562  enolase  69 
 
 		 429 aa  615  1e-175  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3678  phosphopyruvate hydratase  68.53 
 
 		 430 aa  608  1e-173  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00320398  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2958  phosphopyruvate hydratase  68.53 
 
 		 430 aa  608  1e-173  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000744717  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1780  phosphopyruvate hydratase  67.29 
 
 		 429 aa  604  9.999999999999999e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000860602  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4985  phosphopyruvate hydratase  68.6 
 
 		 431 aa  606  9.999999999999999e-173  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4814  phosphopyruvate hydratase  68.6 
 
 		 431 aa  606  9.999999999999999e-173  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4824  phosphopyruvate hydratase  68.84 
 
 		 431 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.223702  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5220  phosphopyruvate hydratase  68.6 
 
 		 431 aa  606  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5364  phosphopyruvate hydratase  68.6 
 
 		 431 aa  606  9.999999999999999e-173  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0413646  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4927  phosphopyruvate hydratase  68.37 
 
 		 431 aa  605  9.999999999999999e-173  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3133  phosphopyruvate hydratase  68.07 
 
 		 430 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2372  phosphopyruvate hydratase  69.16 
 
 		 429 aa  599  1e-170  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0900103  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2286  phosphopyruvate hydratase  68.22 
 
 		 428 aa  594  1e-169  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0930  phosphopyruvate hydratase  68.1 
 
 		 425 aa  597  1e-169  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1159  phosphopyruvate hydratase  67.86 
 
 		 425 aa  594  1e-169  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.582835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2491  phosphopyruvate hydratase  67.86 
 
 		 425 aa  594  1e-169  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1260  enolase  67.45 
 
 		 426 aa  596  1e-169  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3264  phosphopyruvate hydratase  68.93 
 
 		 429 aa  596  1e-169  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0996  phosphopyruvate hydratase  68.93 
 
 		 429 aa  596  1e-169  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0889818  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1654  phosphopyruvate hydratase  67.76 
 
 		 429 aa  595  1e-169  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000730285  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2019  phosphopyruvate hydratase  68.37 
 
 		 431 aa  592  1e-168  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00033595  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0931  phosphopyruvate hydratase  67.62 
 
 		 425 aa  594  1e-168  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0406521  normal  0.0209015 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3266  phosphopyruvate hydratase  68 
 
 		 430 aa  592  1e-168  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.399871  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1505  phosphopyruvate hydratase  65.96 
 
 		 431 aa  591  1e-168  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.246827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1295  phosphopyruvate hydratase  65.96 
 
 		 431 aa  591  1e-168  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000258447  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2987  phosphopyruvate hydratase  66.74 
 
 		 428 aa  593  1e-168  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000287207  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1184  Phosphopyruvate hydratase  68.54 
 
 		 426 aa  589  1e-167  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1305  phosphopyruvate hydratase  65.73 
 
 		 432 aa  589  1e-167  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5238  phosphopyruvate hydratase  68.37 
 
 		 431 aa  587  1e-166  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0256572  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5249  phosphopyruvate hydratase  68.37 
 
 		 431 aa  587  1e-166  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.33817  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0849  phosphopyruvate hydratase  65.73 
 
 		 426 aa  586  1e-166  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.283201  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5703  phosphopyruvate hydratase  68.37 
 
 		 431 aa  586  1e-166  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000699269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0975  phosphopyruvate hydratase  65.73 
 
 		 426 aa  586  1e-166  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0568792 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5284  phosphopyruvate hydratase  68.37 
 
 		 431 aa  587  1e-166  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000135484  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1810  phosphopyruvate hydratase  67.06 
 
 		 434 aa  585  1e-166  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3933  enolase  67.53 
 
 		 426 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000019797  normal  0.771462 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1237  phosphopyruvate hydratase  69.98 
 
 		 431 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00127737  hitchhiker  0.00000000142924 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0295  phosphopyruvate hydratase  67.78 
 
 		 431 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3136  phosphopyruvate hydratase  69.98 
 
 		 431 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00228262  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3222  phosphopyruvate hydratase  67.06 
 
 		 430 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3279  phosphopyruvate hydratase  69.98 
 
 		 431 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.293287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3127  phosphopyruvate hydratase  69.98 
 
 		 431 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0172758  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02624  phosphopyruvate hydratase  68.31 
 
 		 432 aa  579  1e-164  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000285005  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0909  Phosphopyruvate hydratase  68.31 
 
 		 432 aa  579  1e-164  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000107152  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2923  phosphopyruvate hydratase  68.31 
 
 		 432 aa  579  1e-164  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000182866  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0933  phosphopyruvate hydratase  68.31 
 
 		 432 aa  579  1e-164  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000829724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2917  phosphopyruvate hydratase  68.31 
 
 		 432 aa  579  1e-164  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0019531  normal  0.702822 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3094  phosphopyruvate hydratase  68.31 
 
 		 432 aa  579  1e-164  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.269583  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3012  phosphopyruvate hydratase  67.37 
 
 		 429 aa  578  1e-164  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.172983 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1797  phosphopyruvate hydratase  66.67 
 
 		 425 aa  580  1e-164  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.20275  normal  0.528488 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3083  phosphopyruvate hydratase  68.31 
 
 		 432 aa  579  1e-164  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215953  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1115  phosphopyruvate hydratase  69.27 
 
 		 431 aa  579  1e-164  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00458035  normal  0.795235 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1186  phosphopyruvate hydratase  69.27 
 
 		 431 aa  579  1e-164  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0854743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4039  phosphopyruvate hydratase  68.31 
 
 		 432 aa  579  1e-164  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000102498  normal  0.767485 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02586  hypothetical protein  68.31 
 
 		 432 aa  579  1e-164  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000255384  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1116  phosphopyruvate hydratase  69.5 
 
 		 431 aa  581  1e-164  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.283596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0619  enolase  67.85 
 
 		 431 aa  577  1.0000000000000001e-163  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>