More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2196 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2196  DNA polymerase III, delta prime subunit  100 
 
 		 339 aa  686    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.71701 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1785  DNA polymerase III subunit delta'  41.94 
 
 		 336 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.193634  normal  0.229083 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1424  DNA polymerase III subunit delta'  44.11 
 
 		 336 aa  250  3e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.233005 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1465  DNA polymerase III subunit delta'  43.11 
 
 		 336 aa  250  3e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.186588  normal  0.0136368 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1940  DNA polymerase III subunit delta'  40.52 
 
 		 344 aa  241  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.990114  normal  0.368252 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1435  DNA polymerase III subunit delta'  43.15 
 
 		 337 aa  241  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1499  DNA polymerase III, delta prime subunit  39.17 
 
 		 334 aa  235  7e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.28752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1827  DNA polymerase III subunit delta'  43.28 
 
 		 337 aa  229  6e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112412  normal  0.0140286 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1829  DNA polymerase III subunit delta'  40.4 
 
 		 342 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5192  DNA polymerase III subunit delta'  41.64 
 
 		 342 aa  226  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2262  DNA polymerase III subunit delta'  40.52 
 
 		 344 aa  226  4e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.19063  normal  0.508619 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1382  DNA polymerase III subunit delta'  40.97 
 
 		 342 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6187  DNA polymerase III subunit delta'  42.52 
 
 		 342 aa  226  6e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.557746  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1892  DNA polymerase III subunit delta'  42.52 
 
 		 342 aa  226  6e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700458  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1915  DNA polymerase III subunit delta'  42.52 
 
 		 342 aa  226  6e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0504294 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1801  DNA polymerase III subunit delta'  40.11 
 
 		 342 aa  225  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.500907  normal  0.955081 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1386  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.51 
 
 		 368 aa  216  4e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.128473  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1044  DNA polymerase III subunit delta'  40.9 
 
 		 349 aa  210  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.211523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2155  DNA polymerase III subunit delta'  41.52 
 
 		 344 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3389  DNA polymerase III subunit delta'  40.29 
 
 		 344 aa  189  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.556766  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1424  DNA polymerase III subunit delta'  40.29 
 
 		 344 aa  189  4e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2442  DNA polymerase III subunit delta'  40.29 
 
 		 344 aa  189  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.278113  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1915  DNA polymerase III subunit delta'  40.29 
 
 		 344 aa  189  4e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2319  DNA polymerase III subunit delta'  40.29 
 
 		 344 aa  189  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1188  DNA polymerase III subunit delta'  40.29 
 
 		 344 aa  189  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2280  DNA polymerase III subunit delta'  40.29 
 
 		 344 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.20303  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0965  DNA-directed DNA polymerase  31.74 
 
 		 377 aa  179  4.999999999999999e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.824295  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0884  DNA-directed DNA polymerase  31.28 
 
 		 373 aa  179  7e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.772568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2502  DNA polymerase III, delta prime subunit  39.04 
 
 		 347 aa  178  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.477235  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1542  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.45 
 
 		 327 aa  171  2e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.129725  normal  0.14049 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1859  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.31 
 
 		 357 aa  162  9e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.276921 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1415  DNA polymerase III, delta prime subunit  43.91 
 
 		 337 aa  162  1e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.100204  normal  0.602163 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0007  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.31 
 
 		 351 aa  160  4e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0298207  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1879  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.77 
 
 		 360 aa  158  1e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0526572 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1652  DNA polymerase III, delta prime subunit  40.51 
 
 		 331 aa  155  7e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1531  DNA polymerase III subunit delta'  38.16 
 
 		 328 aa  152  8e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.388173 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1966  DNA polymerase III subunit delta'  37.54 
 
 		 328 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.63902  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14980  DNA polymerase III subunit delta'  36.2 
 
 		 328 aa  151  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3794  DNA polymerase III subunit delta'  37.22 
 
 		 328 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.425215  normal  0.36128 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1607  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.73 
 
 		 323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1757  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3389  DNA-directed DNA polymerase  36.14 
 
 		 349 aa  147  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.927863  normal  0.0484045 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1496  DNA polymerase III subunit delta'  43.75 
 
 		 328 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2200  DNA polymerase III subunit delta'  45.59 
 
 		 328 aa  146  6e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.825547  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1718  DNA-directed DNA polymerase  35.78 
 
 		 331 aa  146  6e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.1679 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3826  DNA polymerase III, delta prime subunit  34.9 
 
 		 328 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.070255  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25760  DNA polymerase III subunit delta'  34.93 
 
 		 328 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.644565 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1986  DNA-directed DNA polymerase  35.47 
 
 		 332 aa  144  3e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1006  DNA-directed DNA polymerase  34.55 
 
 		 351 aa  143  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1653  DNA polymerase III subunit delta'  34.31 
 
 		 328 aa  143  4e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0730579  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1634  DNA polymerase III subunit delta'  43 
 
 		 330 aa  143  4e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4151  DNA polymerase III subunit delta'  41.26 
 
 		 327 aa  142  9e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.640705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1828  DNA-directed DNA polymerase  43 
 
 		 321 aa  141  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2857  DNA-directed DNA polymerase  34.94 
 
 		 340 aa  139  6e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003002  DNA polymerase III delta prime subunit  38.86 
 
 		 320 aa  138  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3411  DNA-directed DNA polymerase  33.14 
 
 		 333 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2256  DNA-directed DNA polymerase  33.13 
 
 		 336 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2042  DNA-directed DNA polymerase  38.35 
 
 		 304 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1995  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.23 
 
 		 335 aa  136  7.000000000000001e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1917  DNA-directed DNA polymerase  34.69 
 
 		 361 aa  135  9.999999999999999e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02902  DNA polymerase III subunit delta'  37.74 
 
 		 320 aa  133  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0609  DNA polymerase III subunit delta'  44.23 
 
 		 319 aa  133  5e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0255867  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1576  DNA polymerase III subunit delta'  44.23 
 
 		 319 aa  133  5e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.133264  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1391  DNA-directed DNA polymerase  32.73 
 
 		 374 aa  129  5.0000000000000004e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000825197 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1601  DNA polymerase III subunit delta'  32.72 
 
 		 324 aa  130  5.0000000000000004e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.482029  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2518  DNA-directed DNA polymerase  33.82 
 
 		 379 aa  129  6e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.129447  hitchhiker  0.00407989 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1574  DNA-directed DNA polymerase  36.61 
 
 		 343 aa  127  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2246  putative DNA polymerase III, delta' subunit  33.97 
 
 		 323 aa  126  4.0000000000000003e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.214803  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2571  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.24 
 
 		 318 aa  126  5e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.196352  normal  0.086607 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1893  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.78 
 
 		 318 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0485573 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1252  DNA-directed DNA polymerase  40.76 
 
 		 324 aa  124  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.83429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0060  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.06 
 
 		 335 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0492451  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2451  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.78 
 
 		 318 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.135157  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2458  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.32 
 
 		 318 aa  122  7e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.022565  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2644  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.14 
 
 		 363 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1065  DNA-directed DNA polymerase  33.61 
 
 		 372 aa  120  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.910858  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2612  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.44 
 
 		 318 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2548  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.14 
 
 		 363 aa  119  9e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.017144  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1313  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.74 
 
 		 366 aa  118  9.999999999999999e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1662  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.12 
 
 		 318 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0101  DNA polymerase III, delta prime subunit  31.18 
 
 		 358 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.307739  unclonable  0.000000000342072 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1692  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  28.93 
 
 		 321 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2116  DNA-directed DNA polymerase  32.23 
 
 		 300 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.113627  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1767  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.12 
 
 		 318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.358719  normal  0.672365 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2213  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.12 
 
 		 318 aa  117  3e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1737  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.12 
 
 		 318 aa  117  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.595933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2266  DNA polymerase III, delta prime subunit  39.02 
 
 		 312 aa  116  6.9999999999999995e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.727593  normal  0.54059 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1949  DNA-directed DNA polymerase  42.14 
 
 		 373 aa  115  7.999999999999999e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.832044 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1580  DNA polymerase III, delta prime subunit  37.43 
 
 		 304 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.989268  normal  0.574364 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1659  DNA polymerase III subunit delta'  35.68 
 
 		 337 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0356982  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0515  DNA-directed DNA polymerase  36.13 
 
 		 320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0983279  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0156  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.78 
 
 		 335 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02329  DNA polymerase III subunit delta  31.66 
 
 		 295 aa  110  3e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0040  DNA polymerase III subunit delta'  36.56 
 
 		 327 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0026  DNA polymerase III subunit delta'  37.63 
 
 		 327 aa  110  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0036  DNA polymerase III subunit delta'  29.87 
 
 		 327 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0029  DNA polymerase III subunit delta'  36.02 
 
 		 327 aa  109  6e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0030  DNA polymerase III subunit delta'  35.68 
 
 		 327 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.454552  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0028  DNA polymerase III subunit delta'  35.68 
 
 		 327 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1312  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.04 
 
 		 370 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5280  DNA polymerase III subunit delta'  29.56 
 
 		 327 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>