70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2174 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2174  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  321  3e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000567459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2961  hypothetical protein  59.62 
 
 		 160 aa  187  4e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0057  hypothetical protein  59.62 
 
 		 160 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1710  hypothetical protein  59.62 
 
 		 160 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3632  hypothetical protein  59.62 
 
 		 160 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3657  hypothetical protein  59.62 
 
 		 160 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.403377  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3641  hypothetical protein  59.62 
 
 		 160 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0866939  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3143  hypothetical protein  59.62 
 
 		 160 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2927  type VI secretion system lysozyme-related protein  58.97 
 
 		 161 aa  186  9e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.132533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3562  hypothetical protein  58.33 
 
 		 161 aa  184  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.132433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0448  type VI secretion system lysozyme-related protein  58.33 
 
 		 161 aa  184  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.42159  normal  0.655562 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0470  hypothetical protein  58.33 
 
 		 161 aa  184  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000139842  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2636  hypothetical protein  58.33 
 
 		 161 aa  184  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0433868  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4916  type VI secretion system lysozyme-related protein  58.49 
 
 		 159 aa  183  6e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00677472  decreased coverage  0.00161069 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0384  hypothetical protein  57.69 
 
 		 161 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.576989  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0405  type VI secretion system lysozyme-related protein  57.69 
 
 		 161 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00895356  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01962  hypothetical protein  57.05 
 
 		 157 aa  177  8e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0416888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02048  hypothetical protein  51.59 
 
 		 162 aa  154  3e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.103916  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2624  GPW/gp25 family protein  38.81 
 
 		 160 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3098  hypothetical protein  38.81 
 
 		 160 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2766  type VI secretion system lysozyme-related protein  38.81 
 
 		 160 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0113374  normal  0.377174 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2270  hypothetical protein  35.81 
 
 		 160 aa  75.1  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2365  hypothetical protein  32.03 
 
 		 154 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2508  type VI secretion system lysozyme-related protein  36.92 
 
 		 160 aa  74.7  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0785456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1533  hypothetical protein  32.64 
 
 		 165 aa  74.3  0.0000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4955  hypothetical protein  34.81 
 
 		 160 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000024  uncharacterized protein ImpF  27.92 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.472951  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01060  hypothetical protein  39.26 
 
 		 169 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2328  GPW/gp25 family protein  36.57 
 
 		 170 aa  64.7  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570455  normal  0.0349509 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0159  hypothetical protein  38.52 
 
 		 169 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3075  GPW/gp25 family protein  33.6 
 
 		 173 aa  60.5  0.000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1210  type VI secretion system lysozyme-related protein  33.85 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00262  hypothetical protein  35.56 
 
 		 167 aa  57.4  0.00000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.885463  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3040  type VI secretion system lysozyme-related protein  33.85 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4087  type VI secretion system lysozyme-related protein  34.53 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000692593 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0307  type VI secretion system lysozyme-related protein  33.59 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0294  type VI secretion system lysozyme-related protein  35.11 
 
 		 164 aa  53.9  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.214716 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0292  hypothetical protein  35.11 
 
 		 164 aa  53.9  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.871177 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0197  type VI secretion system lysozyme-related protein  35.19 
 
 		 175 aa  53.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0299  type VI secretion system lysozyme-related protein  35.11 
 
 		 164 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.828471  normal  0.298801 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0526  type VI secretion system lysozyme-related protein  29.66 
 
 		 171 aa  51.2  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1585  hypothetical protein  33.11 
 
 		 182 aa  50.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22173  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3029  hypothetical protein  30.97 
 
 		 180 aa  47.8  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0316867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6047  hypothetical protein  26.49 
 
 		 169 aa  47.4  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.183356  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1689  type VI secretion system lysozyme-related protein  31.69 
 
 		 173 aa  47  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0261  hypothetical protein  30.59 
 
 		 186 aa  47  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4432  hypothetical protein  35.35 
 
 		 176 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1730  hypothetical protein  33.09 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0454443  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3480  hypothetical protein  30.77 
 
 		 235 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.426871  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3124  GPW/gp25 family protein  30.77 
 
 		 235 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0142629  normal  0.0780049 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50830  hypothetical protein  32.35 
 
 		 150 aa  45.8  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0626343  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3409  hypothetical protein  34.65 
 
 		 147 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1479  hypothetical protein  32.67 
 
 		 173 aa  44.7  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2832  hypothetical protein  32 
 
 		 178 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0406  hypothetical protein  32 
 
 		 182 aa  44.3  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0456  hypothetical protein  30.81 
 
 		 186 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1197  hypothetical protein  30.81 
 
 		 186 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2957  hypothetical protein  30.81 
 
 		 186 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3470  hypothetical protein  34.34 
 
 		 185 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.303478  normal  0.684408 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1786  hypothetical protein  30.81 
 
 		 186 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.325097  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1603  hypothetical protein  30.81 
 
 		 186 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2527  type VI secretion system lysozyme-related protein  27.86 
 
 		 141 aa  43.9  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3904  type VI secretion system lysozyme-related protein  34.31 
 
 		 188 aa  43.9  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.705999 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0867  hypothetical protein  31.58 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6118  type VI secretion system lysozyme-related protein  33.98 
 
 		 183 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0590599  normal  0.324873 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0976  hypothetical protein  32.32 
 
 		 190 aa  42.4  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2805  type VI secretion system lysozyme-related protein  29.68 
 
 		 143 aa  41.6  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3253  type VI secretion system lysozyme-related protein  27.34 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1072  type VI secretion system lysozyme-related protein  27.34 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0945  type VI secretion system lysozyme-related protein  33.33 
 
 		 178 aa  41.2  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>