More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2135 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2135  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 97 aa  202  1e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  2.25327e-28  decreased coverage  0.0000795687 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2022  transcriptional regulator, ArsR family  47.42 
 
 		 111 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2395  ArsR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 109 aa  101  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3286  putative transcriptional regulator, ArsR family  46.24 
 
 		 106 aa  99.8  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2002  transcriptional regulator, ArsR family  45.92 
 
 		 100 aa  99  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2369  transcriptional regulator, ArsR family  45.92 
 
 		 100 aa  99  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000230878  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1544  transcriptional regulator, ArsR family  47.78 
 
 		 109 aa  98.2  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411749  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2351  transcriptional regulator, ArsR family  46.07 
 
 		 109 aa  95.1  3e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000226954  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2535  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 100 aa  91.3  4e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0610  ArsR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 98 aa  89  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0454  ArsR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 92 aa  77.8  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0025  ArsR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 101 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1782  ArsR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 102 aa  75.9  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3775  regulatory protein ArsR  38.27 
 
 		 118 aa  75.9  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409508  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0028  regulatory protein, ArsR  42.53 
 
 		 102 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000136281  normal  0.0492639 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0018  transcriptional regulator, ArsR family protein  42.53 
 
 		 101 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.591177  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0026  ArsR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 101 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.849172  normal  0.018094 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0037  ArsR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 102 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.139091 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0020  regulatory protein, ArsR  42.53 
 
 		 101 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4659  regulatory protein ArsR  36.25 
 
 		 115 aa  72.4  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0456  ArsR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 107 aa  72  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0396  ArsR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3331  regulatory protein ArsR  32.99 
 
 		 116 aa  71.2  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277588  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0026  regulatory protein, ArsR  40.23 
 
 		 102 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000871967  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0025  transcriptional regulator, ArsR family  40.23 
 
 		 102 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.111257  hitchhiker  0.00000153005 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0025  ArsR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 102 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00398711  normal  0.0110166 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0021  regulatory protein ArsR  40.23 
 
 		 102 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00282375  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0018  regulatory protein, ArsR  40.23 
 
 		 102 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.413678  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1717  ArsR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 122 aa  71.2  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.805435  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0029  ArsR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 102 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000481298  hitchhiker  0.000000745632 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0023  ArsR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 102 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000124872  hitchhiker  0.000733869 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0021  ArsR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 102 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000364753  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0374  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 104 aa  70.5  0.000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0026  ArsR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 102 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2074  ArsR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 114 aa  69.7  0.00000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.362278  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2026  transcriptional regulator, ArsR family  36.9 
 
 		 97 aa  69.7  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.318848  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0576  transcriptional activator HlyU  36.08 
 
 		 103 aa  69.3  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000103894  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0586  ArsR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 105 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1691  transcriptional regulator, ArsR family  36.9 
 
 		 97 aa  69.7  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1996  ArsR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 114 aa  69.7  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.422542  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  47.37 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1569  transcriptional regulator ArsR family  32.97 
 
 		 114 aa  68.9  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  39.24 
 
 		 112 aa  68.2  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  39.24 
 
 		 112 aa  68.2  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05708  hypothetical protein  36.71 
 
 		 97 aa  68.2  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1287  ArsR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 98 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000165957  normal  0.329148 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3259  ArsR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364539  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00976  hypothetical protein  38.75 
 
 		 101 aa  67.4  0.00000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0024  ArsR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 101 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000555304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1108  ArsR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 127 aa  67  0.00000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1190  ArsR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 98 aa  67  0.00000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00010661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  40.51 
 
 		 111 aa  66.6  0.00000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1617  ArsR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 115 aa  67  0.00000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.755746  normal  0.662554 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000101  transcriptional regulator ArsR family  33.33 
 
 		 102 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.344497  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2570  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 116 aa  66.2  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.525775 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1095  ArsR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 98 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000620503  normal  0.070685 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1050  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1942  ArsR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 129 aa  66.2  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004423  transcriptional activator HlyU  35.11 
 
 		 100 aa  65.5  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000188739  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1079  ArsR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 104 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000795282  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3285  transcriptional regulator ArsR family  37.5 
 
 		 105 aa  66.2  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1608  ArsR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 113 aa  65.9  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.720333  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3223  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 123 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.675106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2727  regulatory protein, ArsR  35.56 
 
 		 98 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000369896  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3636  ArsR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 120 aa  64.7  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  42.31 
 
 		 106 aa  64.7  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1801  ArsR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1936  transcriptional regulator, ArsR family  32.58 
 
 		 93 aa  64.3  0.0000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3459  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3631  transcriptional regulator of ArsR family protein  37.5 
 
 		 103 aa  63.9  0.0000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1543  transcription regulator protein  37.04 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0436972 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2367  regulatory protein ArsR  34.83 
 
 		 97 aa  63.5  0.0000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.74667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0793  regulatory protein, ArsR  33.33 
 
 		 105 aa  63.5  0.0000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01281  transcriptional regulator, ArsR family protein  33.75 
 
 		 87 aa  63.5  0.0000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000457227  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3751  transcriptional regulator, ArsR family  35 
 
 		 110 aa  63.2  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2827  transcriptional regulator, ArsR family  37.97 
 
 		 105 aa  62.8  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313122  normal  0.191386 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6792  ArsR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 108 aa  63.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.439051  normal  0.0283932 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1747  regulatory protein, ArsR  45.71 
 
 		 108 aa  63.2  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000191079  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0920  transcriptional regulator HlyU  39.51 
 
 		 98 aa  62.8  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000331953  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3096  transcriptional regulator, ArsR family  37.97 
 
 		 105 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.556468  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1706  transcriptional regulator, ArsR family  37.04 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.09956  normal  0.924299 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1540  transcriptional regulator, ArsR family  34.44 
 
 		 105 aa  62.4  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.26048  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2014  transcriptional regulator, ArsR family  37.04 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.413816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0245  regulatory protein, ArsR  33.33 
 
 		 98 aa  62.8  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0866  ArsR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 111 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.799603  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1421  regulatory protein, ArsR  43.94 
 
 		 113 aa  62.4  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.116907  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4302  ArsR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 106 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4153  transcriptional regulator, ArsR family  36.25 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0623  ArsR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 129 aa  61.2  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0060  transcription regulator ArsR  36.9 
 
 		 227 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4201  regulatory protein, ArsR  37.5 
 
 		 106 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.541615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1877  ArsR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 103 aa  61.6  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.42284  hitchhiker  0.00584724 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2529  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 106 aa  60.8  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769574 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0987  ArsR family transcriptional regulator  35 
 
 		 98 aa  60.8  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.528724  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3538  transcriptional regulator HlyU  38.27 
 
 		 98 aa  60.8  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1055  regulatory protein, ArsR  38.27 
 
 		 98 aa  60.8  0.000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.584265  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1117  regulatory protein ArsR  38.27 
 
 		 98 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000362609  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3909  transcriptional regulator, ArsR family  32.18 
 
 		 99 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.305368 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3141  ArsR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 98 aa  60.8  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000177762  normal  0.988511 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1050  regulatory protein, ArsR  38.27 
 
 		 98 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000242354  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>