204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2107 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_2107  activation/secretion signal peptide protein  100 
 
 
548 aa  1114    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.385271  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3061  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  38.27 
 
 
578 aa  353  5.9999999999999994e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0377809  decreased coverage  0.00167141 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37880  hypothetical protein  35.93 
 
 
550 aa  309  8e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.335494  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12270  hypothetical protein  36.5 
 
 
553 aa  300  4e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0300367  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3704  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  34.17 
 
 
554 aa  286  8e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.509582 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1782  putative heme-hemopexin utilization protein B  33.83 
 
 
554 aa  264  3e-69  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2861  hemolysin activation/secretion protein-like  33.97 
 
 
607 aa  260  6e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0503  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  32.19 
 
 
572 aa  258  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.376385  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1288  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  33.9 
 
 
583 aa  249  9e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0488096  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3283  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  33.21 
 
 
585 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.86575 
 
 
-
 
NC_003296  RS03098  activation/secretion signal peptide protein  33.47 
 
 
556 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.604865  normal  0.89886 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4107  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  34.07 
 
 
554 aa  242  1e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.416704  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5176  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  33.52 
 
 
586 aa  240  5e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.058555  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58890  putative hemolysin activation/secretion protein  32.73 
 
 
545 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0280329 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2395  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  31.22 
 
 
569 aa  223  4.9999999999999996e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0690  Hemolysin activator HlyB domain protein  33.41 
 
 
442 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1007  hemolysin activation/secretion protein-like  29.76 
 
 
567 aa  196  1e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2696  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  31.12 
 
 
592 aa  194  3e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.763446 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0011  hemolysin activation/secretion protein-like  29.56 
 
 
567 aa  193  8e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.811976  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0746  hemolysin activation/secretion protein-like  29.56 
 
 
567 aa  193  8e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.63759  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3431  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.28 
 
 
567 aa  191  4e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00052486 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0939  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  29.36 
 
 
561 aa  189  9e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.247088  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1054  activation/secretion signal peptide protein  29.76 
 
 
576 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000217377  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1056  hemolysin activation/secretion protein-like  29.27 
 
 
576 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000536803  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4094  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.49 
 
 
545 aa  179  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000416346 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2281  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  32.39 
 
 
595 aa  172  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127506  normal  0.282599 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1094  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.95 
 
 
571 aa  165  2.0000000000000002e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3060  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.63 
 
 
590 aa  159  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2173  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.31 
 
 
692 aa  154  2.9999999999999998e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0036053  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0727  hemolysin activation/secretion protein-like  28.51 
 
 
575 aa  152  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.494827  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0087  hypothetical protein  27.98 
 
 
581 aa  145  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00223104  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3175  putative lipoprotein  26.43 
 
 
596 aa  143  7e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.849554  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2665  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  27.6 
 
 
574 aa  143  7e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3313  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.43 
 
 
596 aa  143  7e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3325  putative lipoprotein  26.43 
 
 
596 aa  141  3.9999999999999997e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.112603  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61190  hypothetical protein  26.73 
 
 
568 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.324339  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5270  hypothetical protein  26.37 
 
 
568 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3763  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.24 
 
 
567 aa  117  5e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0779  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.94 
 
 
747 aa  109  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000230796  normal  0.181114 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6061  hypothetical protein  26.86 
 
 
599 aa  107  8e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5402  activation/secretion signal peptide protein  25.63 
 
 
555 aa  104  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3502  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.5 
 
 
553 aa  103  8e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.898931  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4351  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.5 
 
 
581 aa  101  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.891663 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4241  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.5 
 
 
581 aa  101  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.398994  normal  0.613369 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3648  putative activation/secretion signal peptide protein  24.62 
 
 
558 aa  101  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1048  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.22 
 
 
561 aa  100  5e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0850333 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0068  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.41 
 
 
559 aa  99  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.503427 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0771  polypeptide-transport-associated domain protein, ShlB-type  31.43 
 
 
310 aa  97.4  5e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.891277 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1153  OMP85 family outer membrane protein  26.73 
 
 
558 aa  96.7  9e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0530  putative outer-membrane protein  27.73 
 
 
551 aa  96.7  9e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1744  hypothetical protein  27.73 
 
 
551 aa  96.7  9e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.222058  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0764  putative outer-membrane protein  24.75 
 
 
508 aa  96.3  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.408754  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2383  hemolysin activation/secretion protein-like  26.98 
 
 
624 aa  94  6e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.418836  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1457  surface antigen (D15)  24.31 
 
 
555 aa  89.4  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1646  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.96 
 
 
569 aa  88.6  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4522  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  26.02 
 
 
582 aa  86.3  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2406  hemolysin activation/secretion protein  23.17 
 
 
547 aa  85.9  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0042  hypothetical protein  24.89 
 
 
562 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1044  hypothetical protein  22.16 
 
 
559 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0938674  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1491  hypothetical protein  22.16 
 
 
551 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0159  hypothetical protein  22.16 
 
 
551 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1759  hypothetical protein  22.16 
 
 
551 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.301432  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1007  hypothetical protein  22.16 
 
 
551 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6356  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.16 
 
 
563 aa  84.7  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0654  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.05 
 
 
546 aa  84.3  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.745868  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1780  hypothetical protein  22.16 
 
 
551 aa  84.3  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2776  hypothetical protein  24.66 
 
 
562 aa  84  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816054  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32780  hypothetical protein  24.7 
 
 
565 aa  84.3  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.917181  hitchhiker  0.00000323092 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1931  putative exported heme utilisation related protein  22.16 
 
 
559 aa  84  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.560959  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1531  hypothetical protein  24.94 
 
 
597 aa  84  0.000000000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00490  putative hemolysin activation/secretion protein  24.7 
 
 
562 aa  83.6  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.612794 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0571  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.98 
 
 
562 aa  83.6  0.000000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1518  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  24.63 
 
 
562 aa  82.8  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2806  putative hemolysin activation/secretion signal peptide protein, FhaC/HxuB  22.92 
 
 
569 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.142644 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1621  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.63 
 
 
562 aa  82.8  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1084  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  23.49 
 
 
562 aa  82.8  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3190  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.73 
 
 
589 aa  82.8  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.376319  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0509  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  23.3 
 
 
562 aa  82.8  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1533  polypeptide-transport-associated, ShlB-type  22.3 
 
 
692 aa  82.4  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0363151  normal  0.0767157 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2611  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.39 
 
 
543 aa  82  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1989  hemolysin activation/secretion protein-like  25.47 
 
 
587 aa  81.6  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0548358  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0482  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.44 
 
 
579 aa  81.3  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0164401  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1739  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.08 
 
 
561 aa  80.1  0.00000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.484199  hitchhiker  0.0000499827 
 
 
-
 
NC_003296  RS02601  activation/secretion signal peptide protein  26.01 
 
 
557 aa  79.7  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.591465  normal  0.415625 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1490  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.38 
 
 
561 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00938115  hitchhiker  0.0000615286 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2550  hypothetical protein  21.36 
 
 
597 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0719761  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0351  hemolysin activation/secretion protein-like protein  25.71 
 
 
607 aa  79.3  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.410508  normal  0.212759 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1421  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.62 
 
 
565 aa  79  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161335  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2104  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.2 
 
 
538 aa  79  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.770543 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1086  surface antigen (D15)  23.4 
 
 
550 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0945143  normal  0.205962 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5729  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.57 
 
 
594 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.503116  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0432  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.99 
 
 
592 aa  79.3  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.975087  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2460  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.61 
 
 
587 aa  79  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.118018  normal  0.349655 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7312  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.25 
 
 
595 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.027625  normal  0.0739719 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2120  outer membrane hemolysin activator protein  24.38 
 
 
581 aa  78.6  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2993  hemolysin activation/secretion protein  23.16 
 
 
590 aa  78.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00815358 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4292  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.93 
 
 
593 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.185481  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5860  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.89 
 
 
576 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.680877  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0652  hypothetical protein  24.31 
 
 
558 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1912  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.6 
 
 
558 aa  76.3  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>