20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2054 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_2054  hypothetical protein  100 
 
 
329 aa  652    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3394  hypothetical protein  51.92 
 
 
270 aa  261  1e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.639222  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0109  hypothetical protein  46.91 
 
 
321 aa  256  5e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.419389  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3444  hypothetical protein  42.47 
 
 
313 aa  238  1e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000353163  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0293  hypothetical protein  52.38 
 
 
328 aa  228  2e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000169852  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2234  hypothetical protein  55.43 
 
 
316 aa  206  6e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.143589  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4028  hypothetical protein  48.58 
 
 
316 aa  205  7e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.145897  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1713  hypothetical protein  57.4 
 
 
319 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0219056  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1640  hypothetical protein  55.43 
 
 
319 aa  205  1e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0140573  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3436  hypothetical protein  46.91 
 
 
283 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2248  hypothetical protein  33.33 
 
 
165 aa  54.7  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000924261  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1042  hypothetical protein  26.81 
 
 
288 aa  54.3  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0835293  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1978  hypothetical protein  31.43 
 
 
165 aa  52.8  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1431  hypothetical protein  29.9 
 
 
145 aa  48.9  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000637648  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1260  hypothetical protein  25.26 
 
 
267 aa  47  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.541563  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1496  hypothetical protein  31.3 
 
 
353 aa  46.6  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0766  hypothetical protein  28.04 
 
 
255 aa  45.8  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00180926  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0384  hypothetical protein  35.71 
 
 
202 aa  43.9  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1442  hypothetical protein  29.13 
 
 
265 aa  43.5  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.658193  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0232  hypothetical protein  28.89 
 
 
189 aa  42.7  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.12225  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>