100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2046 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_3285  glycosyltransferase 36  51.39 
 
 
2880 aa  2897    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2188  glycosyltransferase 36  62.07 
 
 
2916 aa  3561    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4245  glycosyltransferase 36  48.97 
 
 
2860 aa  2722    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.342744 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3489  hypothetical protein  48.23 
 
 
2761 aa  1387    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.731415 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3139  glycosyltransferase 36  42.75 
 
 
2842 aa  2115    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0108  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  38.54 
 
 
2864 aa  1866    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.602283  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2737  glycosyltransferase 36  45.04 
 
 
2864 aa  2341    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2993  glycosyltransferase 36  42.66 
 
 
1303 aa  1094    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3155  glycosyltransferase 36  36.87 
 
 
2870 aa  1724    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0124  glycosyltransferase 36  38.4 
 
 
2888 aa  1892    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4026  glycosyltransferase 36  48.41 
 
 
2748 aa  1472    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.301518 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1870  glycosyltransferase 36  44.17 
 
 
2864 aa  2281    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4340  glycosyltransferase 36  42.36 
 
 
3021 aa  2114    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3706  glycosyltransferase 36  41.01 
 
 
2453 aa  1544    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4173  glycosyltransferase 36  36.42 
 
 
2839 aa  1711    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5841  putative carbohydrate binding  40.7 
 
 
2730 aa  1023    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0980  putative carbohydrate binding  39.96 
 
 
2887 aa  2269    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4370  beta (1-->2) glucan biosynthesis protein  36.97 
 
 
2833 aa  1742    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2133  glycosyltransferase 36  56.53 
 
 
2881 aa  3106    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.150749 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1711  glycosyltransferase 36  42.39 
 
 
2874 aa  2003    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122848  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3888  glycosyltransferase 36  47.17 
 
 
2875 aa  1371    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3379  putative carbohydrate binding  49.59 
 
 
2758 aa  1444    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2577  putative carbohydrate binding  37.81 
 
 
2823 aa  2029    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1517  putative cyclic beta 1-2 glucan synthetase  43.13 
 
 
2901 aa  2108    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302513  normal  0.43916 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3845  glycosyltransferase 36  36.86 
 
 
2839 aa  1723    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0111  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  38.81 
 
 
2732 aa  1833    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.888748  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2046  putative carbohydrate binding:glycosyltransferase 36:glycosyltransferase 36 associated  100 
 
 
2932 aa  5955    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1304  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  61.22 
 
 
2859 aa  1985    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3613  glycosyltransferase  46.55 
 
 
2769 aa  1390    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1183  glycosyltransferase 36  59.74 
 
 
2905 aa  3460    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3184  glycosyltransferase 36  49.51 
 
 
2748 aa  1436    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1675  glycosyltransferase 36  44.04 
 
 
2786 aa  1352    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3667  cyclic beta 1-2 glucan synthetase  39.3 
 
 
2793 aa  1028    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1221  glycosyltransferase 36  40.01 
 
 
2922 aa  2261    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1346  putative cyclic beta 1-2 glucan synthetase  42.13 
 
 
2868 aa  2030    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0623  glycosyltransferase 36  56.37 
 
 
2929 aa  3281    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5267  glycosyltransferase 36  43.01 
 
 
2868 aa  2075    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1306  cyclic beta 1-2 glucan synthase  36.54 
 
 
2884 aa  1832    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3093  glycosyltransferase 36  40.42 
 
 
2731 aa  1049    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3296  glycosyltransferase 36  48.99 
 
 
2747 aa  1464    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0791  putative carbohydrate binding  39.79 
 
 
2716 aa  1101    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5592  glycosyltransferase 36  43.25 
 
 
2831 aa  2060    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4755  putative carbohydrate binding  36.83 
 
 
2779 aa  1580    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2531  glycosyltransferase 36  43.5 
 
 
2845 aa  2147    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3648  glycosyltransferase 36 associated  49.19 
 
 
624 aa  610  9.999999999999999e-173  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0091  glycosyltransferase 36  38.37 
 
 
849 aa  561  1e-158  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00140222  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0953  glycosyltransferase 36  36.49 
 
 
786 aa  519  1.0000000000000001e-145  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.862285  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0951  glycosyltransferase 36  28.86 
 
 
813 aa  335  8e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0220582  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0968  glycosyltransferase 36  28.86 
 
 
813 aa  335  8e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.547767  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1364  glycosyltransferase 36  30.79 
 
 
785 aa  327  2e-87  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19750  glycosyltransferase 36  29.06 
 
 
819 aa  324  9.999999999999999e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0459  glycosyltransferase 36  27.75 
 
 
790 aa  323  3e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03431  hypothetical protein  28.08 
 
 
802 aa  320  2e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1363  glycosyltransferase 36  29.71 
 
 
815 aa  319  4e-85  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0141  cellulose degradation product phosphorylase  28.43 
 
 
801 aa  317  2.9999999999999996e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0460  glycosyltransferase 36  29.03 
 
 
811 aa  316  3.9999999999999997e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002578  chitobiose phosphorylase  27.58 
 
 
802 aa  315  5.999999999999999e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3274  glycosyltransferase 36  28.76 
 
 
822 aa  315  6.999999999999999e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0649  glycosyl transferase 36  28.35 
 
 
811 aa  309  6e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0225062  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1439  glycosyltransferase 36  27.2 
 
 
784 aa  308  1.0000000000000001e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2584  chitobiose phosphorylase (glycosyl transferase)  28.01 
 
 
762 aa  307  2.0000000000000002e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1318  cellobiose phosphorylase  28.57 
 
 
811 aa  305  1e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0462617  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19760  glycosyltransferase 36  28.37 
 
 
784 aa  303  3e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0275  cellobiose phosphorylase  27.58 
 
 
811 aa  300  4e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0148  glycosyltransferase 36  28.42 
 
 
822 aa  297  3e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0233043 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1745  glycosyltransferase 36  28.22 
 
 
815 aa  296  5e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.414629  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2109  glycosyltransferase 36  27.82 
 
 
811 aa  293  3e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2312  glycosyltransferase 36  28.81 
 
 
797 aa  291  2e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.26995 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0648  glycosyl transferase 36  27.91 
 
 
809 aa  286  6.000000000000001e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000072507  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2310  glycosyltransferase 36  28.82 
 
 
794 aa  284  2e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.587423  normal  0.417099 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1053  glycosyltransferase 36  27.14 
 
 
829 aa  282  8e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.753195  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0430  glycosyltransferase 36  26.7 
 
 
831 aa  281  2e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.948087  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1929  glycosyltransferase 36  26.18 
 
 
797 aa  278  8e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2354  glycosyltransferase 36  26.72 
 
 
796 aa  274  2e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2616  glycosyltransferase 36  28.54 
 
 
827 aa  274  2e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.294292  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3412  glycosyltransferase 36  26.3 
 
 
824 aa  269  7e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3854  glycosyltransferase 36  26.14 
 
 
797 aa  268  8e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1744  glycosyltransferase 36  28.45 
 
 
823 aa  264  1e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0737514  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0906  NdvB protein  25.51 
 
 
788 aa  213  3e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000016442 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02749  NdvB protein  27.21 
 
 
801 aa  192  8e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3696  cyclic beta 1-2 glucan synthetase domain-containing protein  23.48 
 
 
802 aa  179  9e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2989  glycosyltransferase 36  24.02 
 
 
984 aa  104  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.684465  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5665  hypothetical protein  23.51 
 
 
1100 aa  88.6  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.24035  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6606  hypothetical protein  23.67 
 
 
1094 aa  83.2  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00814353 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4220  hypothetical protein  24.32 
 
 
1169 aa  76.6  0.000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.117681  normal  0.559819 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0694  hypothetical protein  24.02 
 
 
1113 aa  75.9  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.514428  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30460  hypothetical protein  24.56 
 
 
754 aa  64.3  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0534112  normal  0.427386 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0857  cellobiose phosphorylase-like protein  24.08 
 
 
900 aa  64.7  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2456  hypothetical protein  29.72 
 
 
1076 aa  62.8  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3575  hypothetical protein  25.09 
 
 
536 aa  61.2  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.196145  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1586  hypothetical protein  23.94 
 
 
1136 aa  57.4  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.707632  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3150  hypothetical protein  22.62 
 
 
541 aa  57  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1872  hypothetical protein  26.03 
 
 
461 aa  54.7  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04170  Cellobiose phosphorylase  24.6 
 
 
904 aa  50.8  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0524  hypothetical protein  27.13 
 
 
459 aa  50.1  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00628478  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0585  hypothetical protein  27.13 
 
 
459 aa  50.1  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0392402  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2118  Glycogen debranching protein-like protein  23.45 
 
 
810 aa  49.7  0.0009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1072  hypothetical protein  27.13 
 
 
459 aa  49.3  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06430  cellobiose phosphorylase  24.12 
 
 
1145 aa  48.5  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0510  hypothetical protein  32.84 
 
 
536 aa  47.4  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>