More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2030 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_2030  GTP-binding protein Era  100 
 
 
294 aa  594  1e-169  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0924182  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2311  GTP-binding protein Era  66.9 
 
 
309 aa  410  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.254696  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1754  GTP-binding protein Era  64.48 
 
 
302 aa  394  1e-109  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.141942  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2085  GTPase  63.79 
 
 
297 aa  390  1e-107  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.965881  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1008  GTP-binding protein Era  62.28 
 
 
296 aa  380  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.028746 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0864  GTP-binding protein Era  62.28 
 
 
296 aa  380  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0183856 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1086  GTP-binding protein Era  59.11 
 
 
299 aa  363  2e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1011  GTP-binding protein Era  60.14 
 
 
299 aa  362  3e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.262432  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2898  GTP-binding protein Era  59.11 
 
 
299 aa  363  3e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22233  normal  0.295103 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4247  GTP-binding protein Era  60.14 
 
 
299 aa  362  4e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0655  GTP-binding protein Era  60.48 
 
 
299 aa  362  5e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1135  GTP-binding protein Era  60.48 
 
 
299 aa  362  5e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1015  GTP-binding protein Era  60.49 
 
 
287 aa  357  9e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1093  GTP-binding protein Era  60.84 
 
 
287 aa  357  1e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.324542  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2169  GTP-binding protein Era  58.62 
 
 
299 aa  356  2e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0368513  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0597  GTP-binding protein Era  58.5 
 
 
348 aa  353  2e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00117321 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0842  GTP-binding protein Era  58.74 
 
 
287 aa  353  2e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0615921  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0994  GTP-binding protein Era  58.36 
 
 
312 aa  352  3e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.307835  normal  0.0847852 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0929  GTP-binding protein Era  58.36 
 
 
312 aa  352  3e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.163867  normal  0.15052 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2251  GTP-binding protein Era  58.31 
 
 
311 aa  352  4e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.41102  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1788  GTP-binding protein Era  57.39 
 
 
299 aa  351  9e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2894  GTP-binding protein Era  57.39 
 
 
299 aa  351  9e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2839  GTP-binding protein Era  57.39 
 
 
299 aa  351  9e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0544  GTP-binding protein Era  57.39 
 
 
299 aa  351  9e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.439886  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2816  GTP-binding protein Era  57.39 
 
 
299 aa  351  9e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.989072  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2417  GTP-binding protein Era  58.9 
 
 
312 aa  350  1e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.262207 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2778  GTP-binding protein Era  57.39 
 
 
299 aa  350  1e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1731  GTP-binding protein Era  57.73 
 
 
299 aa  350  1e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.379458  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2465  GTP-binding protein Era  57.39 
 
 
311 aa  351  1e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3060  GTP-binding protein Era  56.9 
 
 
357 aa  350  2e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.547585  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3634  GTP-binding protein Era  57.93 
 
 
314 aa  349  3e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.407522  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1064  GTP-binding protein Era  58.36 
 
 
298 aa  349  4e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0212543  normal  0.0907756 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0651  putative GTP-binding protein  56.71 
 
 
312 aa  337  2e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.181354  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1744  GTP-binding protein Era  54.73 
 
 
314 aa  334  8e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000728906  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5260  GTP-binding protein Era  52.88 
 
 
344 aa  326  2e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.678388  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1197  GTP-binding protein Era  53.9 
 
 
344 aa  326  2e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.194461  normal  0.0122322 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2457  GTP-binding protein Era  55.33 
 
 
306 aa  326  3e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3266  GTP-binding protein Era  53.56 
 
 
337 aa  325  6e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0242334 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2619  GTP-binding protein Era  53.56 
 
 
337 aa  325  6e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1403  GTP-binding protein Era  53.87 
 
 
321 aa  322  4e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0973  GTP-binding protein Era  50.34 
 
 
311 aa  321  1e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002498  GTP-binding protein Era  54.11 
 
 
320 aa  317  1e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1004  GTP-binding protein Era  50 
 
 
311 aa  317  2e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2928  GTP-binding protein Era  52.05 
 
 
334 aa  316  4e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2038  GTP-binding protein Era  53.77 
 
 
324 aa  314  1e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.655908  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1348  GTP-binding protein Era  52.4 
 
 
315 aa  314  1e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.136623  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0407  GTP-binding protein Era  50.81 
 
 
311 aa  313  2e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2765  GTP-binding protein Era  51.71 
 
 
334 aa  313  2e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00576917  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03535  GTP-binding protein Era  53.42 
 
 
320 aa  313  2e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2974  GTP-binding protein Era  54.3 
 
 
298 aa  313  2e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0899132  hitchhiker  0.00507105 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1632  GTP-binding protein Era  53.58 
 
 
299 aa  313  3e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392106  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3612  GTP-binding protein Era  52.54 
 
 
303 aa  311  6e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.387158  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1137  GTP-binding protein Era  52.54 
 
 
303 aa  311  6e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0472293  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1190  GTP-binding protein Era  52.54 
 
 
303 aa  311  6e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.442285  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1160  GTP-binding protein Era  52.4 
 
 
338 aa  311  7e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.15184  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0881  GTP-binding protein Era  52.74 
 
 
332 aa  311  8e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.427391  normal  0.11596 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2847  GTP-binding protein Era  52.05 
 
 
339 aa  311  8e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.410629  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2929  GTP-binding protein Era  52.05 
 
 
339 aa  311  8e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.275755  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3025  GTP-binding protein Era  52.05 
 
 
339 aa  311  8e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.118015  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1349  GTP-binding protein Era  51.71 
 
 
339 aa  310  2e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3111  GTP-binding protein Era  51.71 
 
 
338 aa  309  4e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00956624  hitchhiker  0.00355255 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1246  GTP-binding protein Era  51.71 
 
 
338 aa  309  4e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00162731  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1279  GTP-binding protein Era  51.71 
 
 
338 aa  309  4e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.446406  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1202  GTP-binding protein Era  51.71 
 
 
338 aa  309  4e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0677572  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3148  GTP-binding protein Era  51.03 
 
 
300 aa  306  2e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0159525  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3237  GTP-binding protein Era  50.85 
 
 
340 aa  306  3e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0752084  normal  0.147355 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02997  GTP-binding protein Era  51.69 
 
 
314 aa  306  4e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.249422  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4121  GTP-binding protein Era  53.1 
 
 
305 aa  305  5e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.383616  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3668  GTP-binding protein Era  52.38 
 
 
302 aa  305  7e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3070  GTP-binding protein Era  51.19 
 
 
301 aa  305  8e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.129104  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2784  GTP-binding protein Era  52.41 
 
 
301 aa  304  1e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.731152  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1069  GTP-binding protein Era  51.72 
 
 
301 aa  304  1e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1205  GTP-binding protein Era  50.85 
 
 
301 aa  303  2e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.745594  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1239  GTP-binding protein Era  51.38 
 
 
300 aa  302  5e-81  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.680465  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0641  GTP-binding protein Era  50.86 
 
 
300 aa  300  1e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.354328  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3053  GTP-binding protein Era  50.68 
 
 
301 aa  300  2e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.23462  normal  0.0104922 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02460  GTP-binding protein Era  51.19 
 
 
301 aa  298  6e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1111  GTP-binding protein Era  51.19 
 
 
301 aa  298  6e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2721  GTP-binding protein Era  51.19 
 
 
301 aa  298  6e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1102  GTP-binding protein Era  51.19 
 
 
301 aa  298  6e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0130588  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02424  hypothetical protein  51.19 
 
 
301 aa  298  6e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0735  GTP-binding protein Era  50 
 
 
314 aa  298  8e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.222854  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1244  GTP-binding protein Era  50.68 
 
 
329 aa  298  8e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  1.78109e-06  unclonable  1.43866e-08 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1376  GTP-binding protein Era  51.89 
 
 
298 aa  298  8e-80  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1055  GTP-binding protein Era  50.34 
 
 
331 aa  298  9e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.305359  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2852  GTP-binding protein Era  51.19 
 
 
301 aa  298  1e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0251331  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2931  GTP-binding protein Era  51.19 
 
 
301 aa  298  1e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.163008  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2719  GTP-binding protein Era  51.19 
 
 
301 aa  298  1e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0551516  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01718  GTP-binding protein Era  55.09 
 
 
285 aa  297  2e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.515078  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2958  GTP-binding protein Era  50.85 
 
 
301 aa  297  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.435183  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2742  GTP-binding protein Era  50.85 
 
 
301 aa  297  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0288239  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2823  GTP-binding protein Era  50.85 
 
 
301 aa  297  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3802  GTP-binding protein Era  50.85 
 
 
301 aa  295  4e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2846  GTP-binding protein Era  50.85 
 
 
301 aa  296  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.127784  normal  0.818064 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2783  GTP-binding protein Era  50.85 
 
 
301 aa  296  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1445  GTP-binding protein Era  51.55 
 
 
298 aa  295  4e-79  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1149  GTP-binding protein Era  49.66 
 
 
335 aa  295  6e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.28675  normal  0.946741 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0482  GTP-binding protein Era  48.81 
 
 
295 aa  294  1e-78  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2524  GTP-binding protein Era  50.68 
 
 
321 aa  294  1e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00258575  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1038  GTP-binding protein Era  50.34 
 
 
330 aa  293  2e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00137835  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>