103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2012 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2012  hypothetical protein  100 
 
 		 187 aa  377  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2431  protein of unknown function DUF177  41.18 
 
 		 174 aa  103  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0999209  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1069  hypothetical protein  37.11 
 
 		 166 aa  97.4  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.429486  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0977  protein of unknown function DUF177  36.21 
 
 		 178 aa  89.4  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.105676 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1180  hypothetical protein  37.64 
 
 		 183 aa  87.8  7e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1047  hypothetical protein  34.86 
 
 		 179 aa  86.7  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.785486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1510  hypothetical protein  38.36 
 
 		 174 aa  86.3  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0199831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2636  protein of unknown function DUF177  36.42 
 
 		 183 aa  84.3  9e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3283  hypothetical protein  36.42 
 
 		 183 aa  84.3  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3653  hypothetical protein  31.74 
 
 		 168 aa  77.4  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3079  hypothetical protein  29.35 
 
 		 184 aa  72.8  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3263  hypothetical protein  31.79 
 
 		 184 aa  71.2  0.000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.986261 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0912  protein of unknown function DUF177  35.06 
 
 		 178 aa  70.9  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.802583  normal  0.107154 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1554  hypothetical protein  34.07 
 
 		 139 aa  67.4  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.576052  normal  0.0687632 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1208  hypothetical protein  36.24 
 
 		 169 aa  67  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1114  hypothetical protein  36.24 
 
 		 169 aa  67  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.510679  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1238  hypothetical protein  32.5 
 
 		 170 aa  67  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.509174  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0614  hypothetical protein  28.74 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00189465 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2128  hypothetical protein  28.9 
 
 		 173 aa  64.7  0.0000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.023042  normal  0.0264817 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1426  hypothetical protein  32.72 
 
 		 181 aa  63.2  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.120339  normal  0.649251 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0454  hypothetical protein  26.7 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.180134  normal  0.312368 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0402  protein of unknown function DUF177  29.12 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1727  hypothetical protein  30.64 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14880  hypothetical protein  31.14 
 
 		 175 aa  62.4  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.494343  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0395  hypothetical protein  30.39 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.822595  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0518  hypothetical protein  32.7 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.993145  hitchhiker  0.00918152 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2006  hypothetical protein  31.03 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2298  hypothetical protein  29.94 
 
 		 174 aa  58.5  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000985744  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0513  hypothetical protein  31.58 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.223212  hitchhiker  0.00953865 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1486  hypothetical protein  30.11 
 
 		 175 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.909701  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1386  protein of unknown function DUF177  34.21 
 
 		 185 aa  58.5  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1910  hypothetical protein  29.55 
 
 		 175 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000222818 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1624  hypothetical protein  29.34 
 
 		 175 aa  57  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.752967 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1521  hypothetical protein  29.55 
 
 		 175 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.393257 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02704  hypothetical protein  32.91 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3804  hypothetical protein  29.55 
 
 		 175 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2653  hypothetical protein  28.82 
 
 		 174 aa  55.8  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000820152  hitchhiker  0.0000366748 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2186  hypothetical protein  31.38 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.903442  normal  0.111774 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2190  hypothetical protein  29.63 
 
 		 178 aa  54.7  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1711  hypothetical protein  28.24 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000754481  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25620  hypothetical protein  29.63 
 
 		 178 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00500507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2037  hypothetical protein  28.66 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000825431  normal  0.0155007 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2781  hypothetical protein  27.65 
 
 		 174 aa  54.3  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2268  hypothetical protein  28.57 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.525425  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2563  hypothetical protein  27.65 
 
 		 174 aa  53.9  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000529312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1714  hypothetical protein  28.24 
 
 		 174 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000235289  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1598  hypothetical protein  29.3 
 
 		 174 aa  53.9  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000126789  hitchhiker  0.000998263 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1754  hypothetical protein  28.24 
 
 		 174 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000180096  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4161  hypothetical protein  28.98 
 
 		 175 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.166279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2401  hypothetical protein  27.06 
 
 		 174 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000162111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2471  hypothetical protein  27.06 
 
 		 174 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000459273  hitchhiker  0.00620906 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1604  protein of unknown function DUF177  34.88 
 
 		 173 aa  52.8  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.141183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1076  hypothetical protein  31.38 
 
 		 211 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.824913 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2433  hypothetical protein  28.27 
 
 		 205 aa  52.4  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1577  hypothetical protein  27.06 
 
 		 174 aa  52.4  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000216707  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2629  hypothetical protein  28.03 
 
 		 174 aa  52  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000283088  hitchhiker  0.00000164508 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0527  hypothetical protein  29.73 
 
 		 210 aa  52  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2910  hypothetical protein  29.73 
 
 		 210 aa  52  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.25557  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0638  hypothetical protein  31.91 
 
 		 211 aa  52  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0469855  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1118  hypothetical protein  31.91 
 
 		 211 aa  52  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2483  hypothetical protein  29.73 
 
 		 210 aa  52  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.168161  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2799  hypothetical protein  29.73 
 
 		 210 aa  52  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.268577  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2795  hypothetical protein  29.73 
 
 		 210 aa  52  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.553189  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2856  hypothetical protein  29.73 
 
 		 210 aa  52  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1806  hypothetical protein  29.73 
 
 		 210 aa  52  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4230  hypothetical protein  31.38 
 
 		 211 aa  51.6  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00879956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1985  hypothetical protein  29.11 
 
 		 174 aa  51.2  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000046877  decreased coverage  0.000655562 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1597  hypothetical protein  26.44 
 
 		 175 aa  50.1  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.16577  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0994  hypothetical protein  30.81 
 
 		 211 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0998  hypothetical protein  30.81 
 
 		 211 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2915  protein of unknown function DUF177  29.17 
 
 		 214 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.209121  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3836  hypothetical protein  27.84 
 
 		 175 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1494  hypothetical protein  26.63 
 
 		 174 aa  48.9  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000969755  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0867  protein of unknown function DUF177  25.88 
 
 		 169 aa  48.1  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1643  hypothetical protein  27.27 
 
 		 175 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.17907  normal  0.271742 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1069  hypothetical protein  30.1 
 
 		 217 aa  47.8  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.959716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0825  hypothetical protein  31.51 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5275  hypothetical protein  31.95 
 
 		 185 aa  45.4  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1625  hypothetical protein  31.86 
 
 		 173 aa  45.1  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0707  hypothetical protein  24.29 
 
 		 180 aa  45.1  0.0007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.041241  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2499  hypothetical protein  27.06 
 
 		 174 aa  44.7  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000206501  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1714  hypothetical protein  29.73 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2127  hypothetical protein  24.71 
 
 		 175 aa  43.9  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1289  hypothetical protein  32.76 
 
 		 173 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0001847  hitchhiker  0.000000000000230682 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1304  hypothetical protein  32.76 
 
 		 173 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0170278  hitchhiker  0.00000000052483 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1260  hypothetical protein  32.76 
 
 		 173 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00000296903  normal  0.293656 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02336  hypothetical protein  25.79 
 
 		 220 aa  44.3  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000124233  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1996  hypothetical protein  32.76 
 
 		 173 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000000850849  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2179  hypothetical protein  32.76 
 
 		 173 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000145299  hitchhiker  0.00000000000156783 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01084  hypothetical protein  31.9 
 
 		 173 aa  43.5  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000218944  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1210  hypothetical protein  31.9 
 
 		 173 aa  43.5  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000784281  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2039  hypothetical protein  31.9 
 
 		 173 aa  43.5  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000123338  hitchhiker  0.0000303245 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01092  hypothetical protein  31.9 
 
 		 173 aa  43.5  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000203492  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2508  hypothetical protein  33.33 
 
 		 173 aa  43.5  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000257627  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2813  hypothetical protein  34.17 
 
 		 173 aa  42.4  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000146224  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1210  hypothetical protein  31.9 
 
 		 173 aa  42.4  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  3.98054e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1901  hypothetical protein  33.63 
 
 		 173 aa  42.4  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000844005  hitchhiker  0.00000603572 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2513  hypothetical protein  31.9 
 
 		 173 aa  42.4  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000000985112  hitchhiker  0.0000661717 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2236  hypothetical protein  31.9 
 
 		 173 aa  42.4  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  3.70485e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1618  hypothetical protein  32.46 
 
 		 173 aa  42.4  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000831476  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>