More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2002 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2439  aromatic amino acid aminotransferase  81.05 
 
 
402 aa  654    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.559226  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2002  aromatic amino acid aminotransferase  100 
 
 
402 aa  825    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.166981  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1395  aromatic amino acid aminotransferase  74.87 
 
 
399 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.268417  hitchhiker  0.0082547 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1959  aromatic amino acid aminotransferase  74.94 
 
 
399 aa  584  1e-166  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3154  aromatic amino acid aminotransferase  74.62 
 
 
399 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.4038 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1050  aromatic amino acid aminotransferase  72.73 
 
 
398 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1018  aromatic amino acid aminotransferase  71.97 
 
 
398 aa  572  1.0000000000000001e-162  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.039027  normal  0.341676 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1066  aromatic amino acid aminotransferase  71.83 
 
 
399 aa  565  1e-160  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0961353  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1010  aromatic amino acid aminotransferase  70.71 
 
 
398 aa  564  1.0000000000000001e-159  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.126314  normal  0.122057 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0879  aromatic amino acid aminotransferase  71.86 
 
 
399 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0603  aromatic amino acid aminotransferase  71.86 
 
 
399 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.48132  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1919  aromatic amino acid aminotransferase  71.86 
 
 
399 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0916  aromatic amino acid aminotransferase  71.86 
 
 
399 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.106367  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2037  aromatic amino acid aminotransferase  71.61 
 
 
399 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0506  aromatic amino acid aminotransferase  71.86 
 
 
399 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1738  aromatic amino acid aminotransferase  71.86 
 
 
399 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.661692  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0016  aromatic amino acid aminotransferase  71.86 
 
 
399 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.815383  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2235  aromatic amino acid aminotransferase  72.61 
 
 
399 aa  555  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5866  aromatic amino acid aminotransferase  72.61 
 
 
399 aa  555  1e-157  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.601772  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2211  aromatic amino acid aminotransferase  72.61 
 
 
399 aa  555  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5539  aromatic amino acid aminotransferase  72.09 
 
 
399 aa  553  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2128  aromatic amino acid aminotransferase  72.35 
 
 
399 aa  554  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.455577  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2249  aromatic amino acid aminotransferase  72.35 
 
 
399 aa  554  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0875  aromatic amino acid aminotransferase  70.71 
 
 
398 aa  553  1e-156  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.359532 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0940  aromatic amino acid aminotransferase  69.95 
 
 
398 aa  548  1e-155  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.131474 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2738  aromatic amino acid aminotransferase  68.94 
 
 
398 aa  542  1e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.187643  normal  0.404838 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20090  aromatic amino acid aminotransferase  68.18 
 
 
398 aa  541  1e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1051  aromatic amino acid aminotransferase  62.88 
 
 
398 aa  536  1e-151  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2139  aromatic amino acid aminotransferase  63.38 
 
 
398 aa  531  1e-150  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.177387  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1989  aromatic amino acid aminotransferase  66.67 
 
 
398 aa  532  1e-150  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.447695  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2174  aromatic amino acid aminotransferase  62.88 
 
 
398 aa  531  1e-150  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00875667  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2175  aromatic amino acid aminotransferase  62.63 
 
 
398 aa  531  1e-150  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.646508  normal  0.216619 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2440  aromatic amino acid aminotransferase  62.63 
 
 
398 aa  533  1e-150  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.168892  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1496  aromatic amino acid aminotransferase  64.65 
 
 
399 aa  528  1e-149  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0466  aromatic amino acid aminotransferase  64.9 
 
 
399 aa  526  1e-148  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00128744  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1562  aromatic amino acid aminotransferase  62.37 
 
 
398 aa  525  1e-148  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.031141  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2293  aromatic amino acid aminotransferase  63.82 
 
 
396 aa  522  1e-147  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.673394  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23500  aromatic amino acid aminotransferase  66.41 
 
 
398 aa  520  1e-146  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.283341  hitchhiker  0.00416688 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2163  aspartate aminotransferase  66.92 
 
 
398 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.424258  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1874  aromatic amino acid aminotransferase  66.67 
 
 
398 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460088  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4002  aromatic amino acid aminotransferase  61.21 
 
 
398 aa  515  1.0000000000000001e-145  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0358212 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1973  aromatic amino acid aminotransferase  66.41 
 
 
398 aa  513  1e-144  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.275867 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1972  aromatic amino acid aminotransferase  65.66 
 
 
398 aa  508  1e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  hitchhiker  0.0035626 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1635  aromatic amino acid aminotransferase  61.11 
 
 
398 aa  509  1e-143  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3787  aromatic amino acid aminotransferase  65.66 
 
 
398 aa  508  1e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0972413  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2151  aromatic amino acid aminotransferase  61.11 
 
 
398 aa  510  1e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00266369 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2370  aromatic amino acid aminotransferase  59.55 
 
 
401 aa  502  1e-141  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1538  aromatic amino acid aminotransferase  64.39 
 
 
398 aa  498  1e-140  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.38064 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1504  aromatic amino acid aminotransferase  64.39 
 
 
398 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0021  aromatic amino acid aminotransferase  59.65 
 
 
400 aa  496  1e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000117324 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03468  aromatic amino acid aminotransferase  58.9 
 
 
400 aa  493  9.999999999999999e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0026  aromatic amino acid aminotransferase  55.78 
 
 
400 aa  465  9.999999999999999e-131  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0030  aromatic amino acid aminotransferase  55.78 
 
 
400 aa  465  9.999999999999999e-131  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3404  aromatic amino acid aminotransferase  53.88 
 
 
401 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00297741 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3600  aromatic amino acid aminotransferase  54.89 
 
 
407 aa  445  1.0000000000000001e-124  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.232699  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1593  aromatic amino acid aminotransferase  52.15 
 
 
400 aa  435  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0667  aromatic amino acid aminotransferase  51.9 
 
 
400 aa  433  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.588804  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4503  aromatic amino acid aminotransferase  50.89 
 
 
399 aa  433  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.382986  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0798  aromatic amino acid aminotransferase  51.9 
 
 
400 aa  433  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2395  aromatic amino acid aminotransferase  51.9 
 
 
400 aa  433  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.441327  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1762  aromatic amino acid aminotransferase  51.9 
 
 
400 aa  433  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1111  aromatic amino acid aminotransferase  51.9 
 
 
400 aa  433  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.698434  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1222  aromatic amino acid aminotransferase  52.72 
 
 
399 aa  432  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.309647 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3682  aromatic amino acid aminotransferase  52.15 
 
 
398 aa  432  1e-120  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5384  aromatic amino acid aminotransferase  51.98 
 
 
399 aa  433  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.261503  normal  0.0944664 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1187  aromatic amino acid aminotransferase  51.9 
 
 
400 aa  433  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1668  aromatic amino acid aminotransferase  49.62 
 
 
397 aa  426  1e-118  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0301688  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2024  aromatic amino acid aminotransferase  49.62 
 
 
397 aa  428  1e-118  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2171  aromatic amino acid aminotransferase  50 
 
 
401 aa  424  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.611147  normal  0.836675 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5444  aromatic amino acid aminotransferase  50.25 
 
 
402 aa  424  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.299774  normal  0.0293497 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4927  aromatic amino acid aminotransferase  50.38 
 
 
398 aa  423  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.177363  normal  0.577317 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3590  aromatic amino acid aminotransferase  51 
 
 
398 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.511002  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2182  aromatic amino acid aminotransferase  51 
 
 
398 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.882504  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4233  aromatic amino acid aminotransferase  50.13 
 
 
400 aa  418  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.103531  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2326  aromatic amino acid aminotransferase  50.87 
 
 
398 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.88203  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2805  aromatic amino acid aminotransferase  50.12 
 
 
398 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.475258  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1945  aromatic amino acid aminotransferase  48.61 
 
 
397 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1670  aromatic amino acid aminotransferase  49.37 
 
 
400 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0668347  normal  0.555031 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6004  aromatic amino acid aminotransferase  49.12 
 
 
400 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.443783  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4017  aromatic amino acid aminotransferase  49.37 
 
 
400 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4268  aromatic amino acid aminotransferase  49.87 
 
 
400 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0463663  normal  0.625536 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2020  aromatic amino acid aminotransferase  48.61 
 
 
397 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00317803  hitchhiker  0.00000201349 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3759  aromatic amino acid aminotransferase  49.62 
 
 
400 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.113714 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4350  aromatic amino acid aminotransferase  49.37 
 
 
400 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.461114  normal  0.792139 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2121  aromatic amino acid aminotransferase  48.35 
 
 
397 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0183717  normal  0.0291877 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2228  aromatic amino acid aminotransferase  48.1 
 
 
397 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000156913  normal  0.0325247 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2350  aromatic amino acid aminotransferase  47.85 
 
 
397 aa  413  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2156  aromatic amino acid aminotransferase  48.35 
 
 
397 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0020376  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2280  aromatic amino acid aminotransferase  49.12 
 
 
405 aa  411  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1955  aromatic amino acid aminotransferase  48.61 
 
 
397 aa  414  1e-114  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00227805 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2206  aromatic amino acid aminotransferase  48.35 
 
 
397 aa  411  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000624444  normal  0.252342 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4445  aromatic amino acid aminotransferase  49.12 
 
 
397 aa  408  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.451024 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0924  aromatic amino acid aminotransferase  49.62 
 
 
398 aa  409  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4606  aromatic amino acid aminotransferase  50.75 
 
 
397 aa  410  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5556  aromatic amino acid aminotransferase  50.5 
 
 
411 aa  409  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.187921  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2215  aromatic amino acid aminotransferase  48.35 
 
 
397 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00106889  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4501  aromatic amino acid aminotransferase  48.35 
 
 
397 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03926  tyrosine aminotransferase, tyrosine-repressible, PLP-dependent  50.5 
 
 
397 aa  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0286494  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2228  aromatic amino acid aminotransferase  46.33 
 
 
397 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.207544  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4294  aromatic amino acid aminotransferase  50.5 
 
 
397 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.820451  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>