More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1962 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_1962  phosphoserine phosphatase  100 
 
 
279 aa  554  1e-157  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.436827  normal  0.668349 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2331  phosphoserine phosphatase  62.05 
 
 
279 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124383  normal  0.106642 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2240  phosphoserine phosphatase SerB  52.16 
 
 
281 aa  268  5e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00113806  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0636  phosphoserine phosphatase SerB  50.36 
 
 
276 aa  266  4e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2264  phosphoserine phosphatase  57.83 
 
 
281 aa  266  4e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.738321  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0978  phosphoserine phosphatase SerB  60.44 
 
 
279 aa  265  7e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.485159  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1368  phosphoserine phosphatase  54.26 
 
 
284 aa  263  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127039  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1855  phosphoserine phosphatase SerB  59.38 
 
 
279 aa  261  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.247202 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2322  phosphoserine phosphatase  52.84 
 
 
454 aa  259  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2194  phosphoserine phosphatase  52.13 
 
 
281 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1073  phosphoserine phosphatase  52.13 
 
 
281 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0094  phosphoserine phosphatase  52.13 
 
 
281 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.188283  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2157  phosphoserine phosphatase  52.13 
 
 
281 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.752004  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1802  phosphoserine phosphatase  52.13 
 
 
281 aa  260  2e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1313  phosphoserine phosphatase  52.84 
 
 
568 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1357  phosphoserine phosphatase  59.91 
 
 
307 aa  257  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1577  phosphoserine phosphatase SerB  50.88 
 
 
285 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0191931 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1492  phosphoserine phosphatase SerB  59.38 
 
 
281 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.806128  normal  0.053472 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1690  phosphoserine phosphatase SerB  59.46 
 
 
281 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.656788  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1718  phosphoserine phosphatase SerB  59.46 
 
 
316 aa  251  7e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1640  putative phosphoserine phosphatase protein  58.74 
 
 
285 aa  251  9.000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  0.179226 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5077  phosphoserine phosphatase  59.01 
 
 
281 aa  250  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6301  phosphoserine phosphatase SerB  59.46 
 
 
316 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.463475  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1906  phosphoserine phosphatase SerB  50.18 
 
 
310 aa  249  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0401863  normal  0.165029 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1778  phosphoserine phosphatase SerB  59.46 
 
 
316 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.685999  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1803  phosphoserine phosphatase SerB  59.46 
 
 
281 aa  249  3e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0615896  normal  0.554721 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2007  phosphoserine phosphatase SerB  59.53 
 
 
235 aa  239  5e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00211698 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1890  phosphoserine phosphatase  45.36 
 
 
302 aa  238  5.999999999999999e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2720  phosphoserine phosphatase  57.73 
 
 
236 aa  237  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.377645  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1568  phosphoserine phosphatase  56.94 
 
 
241 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0185537  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1576  phosphoserine phosphatase  55.91 
 
 
237 aa  229  4e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.665461  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4883  phosphoserine phosphatase SerB  55.35 
 
 
264 aa  228  8e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.35019 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2554  phosphoserine phosphatase SerB  53.22 
 
 
236 aa  228  8e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.497931  normal  0.0396142 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1329  phosphoserine phosphatase SerB  55.56 
 
 
237 aa  226  3e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2577  phosphoserine phosphatase SerB  57.56 
 
 
237 aa  223  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2846  phosphoserine phosphatase SerB  54.63 
 
 
237 aa  217  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.793398  normal  0.583528 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0928  phosphoserine phosphatase SerB  53.67 
 
 
296 aa  217  1e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.215666  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0913  phosphoserine phosphatase SerB  53.21 
 
 
296 aa  213  1.9999999999999998e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.697374  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1620  phosphoserine phosphatase SerB  50.24 
 
 
275 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3159  phosphoserine phosphatase  57.41 
 
 
238 aa  212  4.9999999999999996e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2506  phosphoserine phosphatase SerB  57.41 
 
 
238 aa  212  4.9999999999999996e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.64649  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1712  phosphoserine phosphatase SerB  48.65 
 
 
410 aa  206  4e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2504  phosphoserine phosphatase SerB  50 
 
 
278 aa  203  2e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000000707909  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0341  phosphoserine phosphatase SerB  50.23 
 
 
412 aa  201  9e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1075  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer / phosphoserine phosphatase  50.23 
 
 
405 aa  201  9.999999999999999e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.314545 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4701  phosphoserine phosphatase SerB  49 
 
 
404 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0409  phosphoserine phosphatase SerB  47.41 
 
 
438 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0314  phosphoserine phosphatase SerB  49.77 
 
 
410 aa  200  1.9999999999999998e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0906615 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1948  phosphoserine phosphatase SerB  51.58 
 
 
406 aa  199  3e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.656763 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4962  phosphoserine phosphatase SerB  51.1 
 
 
404 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.414119 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002634  phosphoserine phosphatase  45.64 
 
 
326 aa  200  3e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03372  phosphoserine phosphatase  45.23 
 
 
326 aa  199  3.9999999999999996e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0225  phosphoserine phosphatase SerB  50.45 
 
 
406 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0624  phosphoserine phosphatase  49.53 
 
 
322 aa  197  1.0000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.184048  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1598  phosphoserine phosphatase SerB  49.77 
 
 
408 aa  195  7e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2786  phosphoserine phosphatase SerB  49.1 
 
 
410 aa  194  9e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4909  phosphoserine phosphatase SerB  50.22 
 
 
415 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0136  phosphoserine phosphatase  51.71 
 
 
432 aa  194  1e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.357065  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4785  phosphoserine phosphatase SerB  50.22 
 
 
404 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2041  phosphoserine phosphatase  50.23 
 
 
404 aa  194  1e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143406  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1267  phosphoserine phosphatase  48.31 
 
 
280 aa  194  2e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.10221  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3622  phosphoserine phosphatase  49.19 
 
 
326 aa  193  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0506  phosphoserine phosphatase  50.9 
 
 
404 aa  193  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138167  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1924  phosphoserine phosphatase  47.73 
 
 
328 aa  192  5e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0826  phosphoserine phosphatase  49.19 
 
 
326 aa  192  5e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3493  phosphoserine phosphatase  49.19 
 
 
326 aa  192  5e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2664  phosphoserine phosphatase SerB  47.84 
 
 
405 aa  191  1e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00356785  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0557  phosphoserine phosphatase SerB  46.61 
 
 
418 aa  190  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3017  phosphoserine phosphatase SerB  49.12 
 
 
411 aa  190  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5689  phosphoserine phosphatase SerB  50.45 
 
 
404 aa  190  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0216  phosphoserine phosphatase SerB  47.84 
 
 
405 aa  190  2e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2803  phosphoserine phosphatase SerB  42.24 
 
 
398 aa  191  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.749544  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0264  phosphoserine phosphatase SerB  48.86 
 
 
404 aa  190  2e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0500  Phosphoserine phosphatase  48.44 
 
 
407 aa  190  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0250  phosphoserine phosphatase  47.84 
 
 
405 aa  189  5e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4957  ACT domain protein/phosphoserine phosphatase SerB  50 
 
 
418 aa  188  9e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0618  phosphoserine phosphatase  52.68 
 
 
429 aa  187  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3469  phosphoserine phosphatase  45.93 
 
 
325 aa  187  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5336  phosphoserine phosphatase SerB  51.74 
 
 
419 aa  186  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414905  normal  0.119609 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1688  phosphoserine phosphatase SerB  50.99 
 
 
380 aa  187  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0594827 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2542  phosphoserine phosphatase  52.2 
 
 
411 aa  187  2e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29300  phosphoserine phosphatase  49.76 
 
 
409 aa  187  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.78907  normal  0.19351 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3588  phosphoserine phosphatase  42.2 
 
 
325 aa  186  3e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.606019  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0538  phosphoserine phosphatase SerB  49.78 
 
 
372 aa  186  3e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000000117789  unclonable  0.0000000000304475 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1278  phosphoserine phosphatase SerB  49.52 
 
 
357 aa  186  3e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.285507  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0368  phosphoserine phosphatase  49.78 
 
 
327 aa  186  4e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00427946  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65560  phosphoserine phosphatase  50 
 
 
429 aa  186  4e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0666  phosphoserine phosphatase  47.95 
 
 
325 aa  185  6e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1350  phosphoserine phosphatase SerB  49.27 
 
 
419 aa  185  7e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07410  Phosphoserine phosphatase  52.68 
 
 
404 aa  185  7e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403165  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0653  phosphoserine phosphatase  49.01 
 
 
413 aa  184  1.0000000000000001e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184974 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1107  phosphoserine phosphatase  47.3 
 
 
306 aa  184  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2283  3-phosphoserine phosphatase  47.32 
 
 
398 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000752134  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1874  phosphoserine phosphatase SerB  47.06 
 
 
297 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.058047 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02993  SerB  40.8 
 
 
327 aa  184  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5902  phosphoserine phosphatase  46.31 
 
 
322 aa  183  3e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0687  phosphoserine phosphatase  46.58 
 
 
317 aa  183  3e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.189531  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3668  phosphoserine phosphatase  46.31 
 
 
322 aa  183  3e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.610208 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4987  phosphoserine phosphatase  46.31 
 
 
322 aa  183  3e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4935  phosphoserine phosphatase  46.31 
 
 
322 aa  183  3e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.801469  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>