More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1943 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1943  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 952 aa  1894    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.102548 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0376  tetratricopeptide TPR_4  30.04 
 
 		 929 aa  335  2e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0195  TPR repeat-containing protein  28.65 
 
 		 931 aa  281  3e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0196  TPR repeat-containing protein  28.34 
 
 		 927 aa  253  1e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.935444 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  26.55 
 
 		 934 aa  249  2e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0705  tetratricopeptide TPR_2  26.96 
 
 		 924 aa  219  1e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2439  TPR repeat-containing protein  26.23 
 
 		 923 aa  214  7e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.427579  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0781  TPR domain-containing protein  23.82 
 
 		 924 aa  197  6e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.55707  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2499  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  24.81 
 
 		 935 aa  181  4e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00842249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0156  TPR repeat-containing protein  25.05 
 
 		 955 aa  163  1e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01444  TPR repeat protein  26.24 
 
 		 937 aa  163  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0688079  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1201  tetratricopeptide TPR_2  23.94 
 
 		 918 aa  132  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.173975  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1338  tetratricopeptide TPR_2  23.8 
 
 		 931 aa  128  6e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0691  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  24.89 
 
 		 883 aa  122  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.953113 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3073  TPR repeat-containing protein  25.16 
 
 		 886 aa  119  3e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1620  TPR repeat-containing protein  22.72 
 
 		 900 aa  110  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1582  TPR repeat-containing protein  23.19 
 
 		 767 aa  109  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189935  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  22.28 
 
 		 883 aa  109  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1628  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  24.68 
 
 		 924 aa  107  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.57702  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2224  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  22.98 
 
 		 884 aa  106  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2838  tetratricopeptide TPR_2  22.3 
 
 		 940 aa  103  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3097  hypothetical protein  23.93 
 
 		 933 aa  99  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.681672  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2393  TPR repeat-containing protein  25.58 
 
 		 944 aa  92.8  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0423  TPR repeat-containing protein  24.71 
 
 		 880 aa  91.7  6e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0262641 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2579  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.25 
 
 		 786 aa  91.7  6e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0309  TPR domain-containing protein  21.97 
 
 		 914 aa  91.3  8e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0419  TPR repeat-containing protein  24.48 
 
 		 917 aa  90.1  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2583  TPR repeat-containing protein  23.37 
 
 		 729 aa  89.7  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  22.88 
 
 		 729 aa  85.1  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2478  TPR repeat-containing protein  21.78 
 
 		 884 aa  85.1  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1530  TPR repeat-containing protein  23.9 
 
 		 873 aa  85.1  0.000000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0304158  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1987  TPR domain-containing protein  22.47 
 
 		 864 aa  83.6  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  20.37 
 
 		 1067 aa  82.4  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0828  TPR repeat-containing protein  22.27 
 
 		 886 aa  80.5  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2367  TPR repeat-containing protein  21.12 
 
 		 860 aa  79.7  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2959  tetratricopeptide TPR_4  24.16 
 
 		 939 aa  79  0.0000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.83474  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2480  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  22.93 
 
 		 882 aa  77.8  0.0000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0951  tetratricopeptide TPR_2  26.58 
 
 		 613 aa  77  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.101575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1011  TPR repeat-containing protein  24.13 
 
 		 800 aa  75.5  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.926102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  22.04 
 
 		 1069 aa  74.7  0.000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1767  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  23.06 
 
 		 882 aa  74.7  0.000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1499  TPR repeat-containing protein  23.67 
 
 		 620 aa  73.9  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0511559 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0310  TPR domain-containing protein  22.26 
 
 		 892 aa  73.2  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  22.66 
 
 		 4079 aa  73.2  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03692  TPR domain protein  23.88 
 
 		 924 aa  72.8  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  21.49 
 
 		 927 aa  72.4  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0528  TPR domain-containing protein  23 
 
 		 917 aa  72  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668736  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.05 
 
 		 2240 aa  72  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0523  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.83 
 
 		 582 aa  71.6  0.00000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4236  tetratricopeptide TPR_2  24.25 
 
 		 824 aa  71.2  0.00000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.707034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  25.21 
 
 		 265 aa  70.9  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3385  tetratricopeptide  22.74 
 
 		 811 aa  70.1  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  22.67 
 
 		 573 aa  69.3  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2475  peptidoglycan-binding LysM  22.7 
 
 		 632 aa  68.6  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00625277  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1127  TPR domain-containing protein  23.06 
 
 		 725 aa  67.8  0.0000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.36 
 
 		 818 aa  67.8  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3194  O-GlcNAc transferase, p110 subunit  24.64 
 
 		 349 aa  67.4  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.756541  hitchhiker  0.0088423 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0617  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.88 
 
 		 579 aa  67.4  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 2262 aa  67.4  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.04 
 
 		 557 aa  67.8  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0588  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.39 
 
 		 571 aa  66.6  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.795395  normal  0.0835537 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 543 aa  65.9  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3735  TPR repeat-containing protein  27.75 
 
 		 707 aa  66.2  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2231  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 265 aa  65.5  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000660918  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  27.12 
 
 		 1276 aa  65.5  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0912  TPR repeat-containing protein  21.69 
 
 		 748 aa  65.1  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.795031  hitchhiker  0.00626987 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  22.72 
 
 		 1676 aa  64.7  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1527  tetratricopeptide TPR_4  27.62 
 
 		 619 aa  64.7  0.000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.80343  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2762  TPR domain protein  24.37 
 
 		 603 aa  63.9  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2382  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.37 
 
 		 553 aa  63.9  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.407653 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  25.88 
 
 		 792 aa  64.3  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1773  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.66 
 
 		 466 aa  64.3  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0681  tetratricopeptide TPR_2  26.67 
 
 		 562 aa  63.9  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1284  TPR repeat-containing protein  27.94 
 
 		 612 aa  63.9  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0911  TPR repeat-containing protein  23.69 
 
 		 515 aa  63.9  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.19098  hitchhiker  0.00518464 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1875  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 201 aa  64.3  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  22.61 
 
 		 1979 aa  63.2  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  28.07 
 
 		 827 aa  63.2  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.65 
 
 		 810 aa  63.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1755  TPR repeat-containing protein  26.94 
 
 		 265 aa  63.2  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000044478  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  22.73 
 
 		 567 aa  63.2  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1186  TPR repeat-containing protein  29.54 
 
 		 1197 aa  62.8  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  26.02 
 
 		 1421 aa  63.2  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.05 
 
 		 265 aa  62.4  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  23.79 
 
 		 462 aa  62.4  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3605  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.11 
 
 		 248 aa  62.4  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0586  hypothetical protein  31.39 
 
 		 573 aa  62  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0276  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.96 
 
 		 624 aa  62  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0626  tetratricopeptide TPR_2  18.91 
 
 		 2059 aa  62  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00762464 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5316  hypothetical protein  24.67 
 
 		 575 aa  61.6  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.348635  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  23.4 
 
 		 1297 aa  61.6  0.00000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  30.99 
 
 		 626 aa  61.6  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  22.02 
 
 		 3172 aa  61.6  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  21.57 
 
 		 565 aa  61.6  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0280  tetratricopeptide TPR_4  32.64 
 
 		 584 aa  61.2  0.00000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1609  TPR repeat-containing protein  27.36 
 
 		 194 aa  61.2  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.994867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61720  hypothetical protein  24.4 
 
 		 590 aa  61.2  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.541036  decreased coverage  0.00206868 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  26.1 
 
 		 649 aa  61.2  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.25 
 
 		 707 aa  60.8  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  27.8 
 
 		 635 aa  60.1  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.750671 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>