More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1937 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_1937  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
136 aa  283  5.999999999999999e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00538677  normal  0.170289 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1657  thioesterase superfamily protein  59.26 
 
 
139 aa  172  9.999999999999999e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1151  thioesterase superfamily protein  56 
 
 
133 aa  145  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.758431  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1267  thioesterase superfamily protein  51.52 
 
 
133 aa  142  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.384152  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1565  thioesterase superfamily protein  55.2 
 
 
142 aa  141  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1364  putative thioesterase  54.4 
 
 
134 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2065  thioesterase superfamily protein  48.48 
 
 
147 aa  135  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0110405 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0815  thioesterase superfamily protein  49.61 
 
 
139 aa  134  3.0000000000000003e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.545456  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2763  thioesterase superfamily protein  53.23 
 
 
132 aa  134  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166608  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2611  thioesterase family protein  51.59 
 
 
147 aa  134  5e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4608  thioesterase superfamily protein  51.2 
 
 
143 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00844353  normal  0.865959 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1388  thioesterase superfamily protein  51.2 
 
 
143 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1348  thioesterase superfamily protein  51.2 
 
 
143 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1926  thioesterase superfamily protein  42.86 
 
 
136 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3983  thioesterase superfamily protein  44.44 
 
 
139 aa  128  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.813194  normal  0.0353277 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1441  thioesterase superfamily protein  50 
 
 
132 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0981  thioesterase superfamily protein  50.4 
 
 
146 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1463  thioesterase superfamily protein  50.4 
 
 
146 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3287  thioesterase superfamily protein  43.18 
 
 
140 aa  125  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0335707  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1590  thioesterase superfamily protein  45.83 
 
 
135 aa  124  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.359349  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1693  thioesterase family protein  50 
 
 
159 aa  124  6e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27910  hypothetical protein  41.67 
 
 
134 aa  124  6e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0217  thioesterase family protein  50 
 
 
143 aa  123  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0748592  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1114  thioesterase family protein  50 
 
 
143 aa  123  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0224064  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1871  thioesterase family protein  50 
 
 
143 aa  123  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0652374  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1556  thioesterase family protein  50 
 
 
143 aa  123  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000380649  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0944  thioesterase family protein  50 
 
 
143 aa  123  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2356  hypothetical protein  40.91 
 
 
134 aa  123  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1717  thioesterase family protein  50 
 
 
143 aa  123  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2677  thioesterase superfamily protein  41.04 
 
 
140 aa  121  4e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1898  thioesterase superfamily protein  42.54 
 
 
140 aa  120  5e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.292723 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4309  thioesterase superfamily protein  42.42 
 
 
156 aa  118  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.515868  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3014  thioesterase superfamily protein  39.85 
 
 
139 aa  115  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.80515  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2925  hypothetical protein  39.1 
 
 
130 aa  115  3e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2779  hypothetical protein  37.59 
 
 
130 aa  110  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  42.4 
 
 
139 aa  108  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1786  thioesterase superfamily protein  51.52 
 
 
213 aa  102  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1117  thioesterase superfamily protein  35.11 
 
 
135 aa  93.6  9e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235483  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04892  putative thioesterase  36.64 
 
 
134 aa  90.1  9e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0074  thioesterase superfamily protein  30.95 
 
 
141 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1624  thioesterase superfamily protein  35.38 
 
 
143 aa  81.6  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3968  thioesterase superfamily protein  31.78 
 
 
140 aa  79  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5015  thioesterase superfamily protein  30.4 
 
 
137 aa  78.6  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.168597  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0066  thioesterase superfamily protein  31.25 
 
 
146 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0080  thioesterase superfamily protein  31.25 
 
 
150 aa  77.8  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0086  thioesterase superfamily protein  31.25 
 
 
150 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0083  thioesterase superfamily protein  31.25 
 
 
142 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0084  thioesterase superfamily protein  30.47 
 
 
154 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0081  thioesterase superfamily protein  30.47 
 
 
154 aa  77  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2835  thioesterase superfamily protein  29.6 
 
 
142 aa  76.6  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0085  thioesterase superfamily protein  29.69 
 
 
154 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0080  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.69 
 
 
142 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1527  hypothetical protein  30.33 
 
 
149 aa  75.5  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1769  thioesterase superfamily protein  29.6 
 
 
147 aa  75.9  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201031  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0073  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.78 
 
 
144 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0036  thioesterase superfamily protein  35.88 
 
 
139 aa  75.9  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2836  thioesterase superfamily protein  36.09 
 
 
146 aa  75.1  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1391  thioesterase superfamily protein  32.28 
 
 
145 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.243667 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4557  thioesterase superfamily protein  31.5 
 
 
145 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.215777  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01695  Predicted thioesterase  31.75 
 
 
137 aa  73.9  0.0000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.431774  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1882  thioesterase superfamily protein  30.08 
 
 
144 aa  73.6  0.0000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2550  thioesterase superfamily protein  32.8 
 
 
149 aa  73.2  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3772  thioesterase superfamily protein  28.35 
 
 
142 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.478707  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4456  thioesterase superfamily protein  31.03 
 
 
144 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4269  thioesterase superfamily protein  29.92 
 
 
150 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2347  thioesterase superfamily protein  32.03 
 
 
132 aa  72.4  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.754827  normal  0.0192186 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1293  thioesterase superfamily protein  29.92 
 
 
145 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263092  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001138  predicted thioesterase  29.23 
 
 
150 aa  72  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04031  thioesterase family protein domain protein  30.65 
 
 
145 aa  72  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4857  thioesterase superfamily protein  29.2 
 
 
143 aa  72  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3691  thioesterase superfamily protein  27.41 
 
 
150 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1678  thioesterase superfamily protein  31.34 
 
 
145 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.71411 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4183  thioesterase superfamily protein  28.8 
 
 
142 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06649  thioesterase  28.46 
 
 
150 aa  71.6  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0382  thioesterase superfamily protein  29.13 
 
 
143 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1332  thioesterase superfamily protein  29.92 
 
 
145 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0269982  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2141  thioesterase superfamily protein  31.67 
 
 
164 aa  70.9  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000226869  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2819  thioesterase superfamily protein  30.71 
 
 
149 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.453856  normal  0.118463 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0931  thioesterase superfamily protein  30.71 
 
 
145 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1413  thioesterase superfamily protein  30.71 
 
 
145 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236272  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3106  thioesterase superfamily protein  31.78 
 
 
156 aa  70.9  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346336  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0277  thioesterase superfamily protein  28.37 
 
 
143 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0872113 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68490  hypothetical protein  26.56 
 
 
147 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.222508 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2050  hypothetical protein  26.67 
 
 
150 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00110893  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2654  thioesterase family protein  29.37 
 
 
203 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7358  thioesterase superfamily protein  35.96 
 
 
167 aa  69.3  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0966  thioesterase superfamily protein  32.77 
 
 
145 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4741  thioesterase superfamily protein  29.84 
 
 
153 aa  68.6  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0117203  normal  0.418796 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1317  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.92 
 
 
149 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0719  thioesterase family protein  28.46 
 
 
149 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0443  thioesterase family protein  28.46 
 
 
149 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1648  thioesterase family protein  28.46 
 
 
149 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129475  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37230  predicted thioesterase  28.23 
 
 
136 aa  67.8  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0929724 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1611  thioesterase superfamily protein  30.47 
 
 
147 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525726  normal  0.904244 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1202  thioesterase superfamily protein  27.41 
 
 
175 aa  67.4  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000375293  normal  0.571615 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1670  thioesterase family protein  28.46 
 
 
149 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.895942  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1824  thioesterase family protein  28.46 
 
 
181 aa  67  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.814646  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1437  thioesterase family protein  28.46 
 
 
181 aa  67  0.00000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0191  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
140 aa  66.2  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2066  thioesterase superfamily protein  29.75 
 
 
160 aa  66.6  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  hitchhiker  0.00365834 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>