More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1922 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_1029  glycerol kinase  62.4 
 
 		 496 aa  642    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2762  glycerol kinase  65.31 
 
 		 496 aa  654    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0161395  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0437  glycerol kinase  62.6 
 
 		 520 aa  651    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000112542  decreased coverage  0.00471602 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1922  glycerol kinase  100 
 
 		 502 aa  1016    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2213  glycerol kinase  66.26 
 
 		 516 aa  678    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.256504  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1676  glycerol kinase  65.92 
 
 		 496 aa  655    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000621066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0410  glycerol kinase  64.1 
 
 		 497 aa  673    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1347  glycerol kinase  60.16 
 
 		 498 aa  641    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0455293  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2238  glycerol kinase  66.33 
 
 		 510 aa  676    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2522  glycerol kinase  64.43 
 
 		 505 aa  659    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1364  glycerol kinase  59.15 
 
 		 496 aa  641    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0809  glycerol kinase  62.47 
 
 		 497 aa  654    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.344576 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1322  glycerol kinase  59.76 
 
 		 496 aa  645    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.537601  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0252  glycerol kinase  62.42 
 
 		 497 aa  663    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0912912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2688  glycerol kinase  64.3 
 
 		 496 aa  653    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2845  glycerol kinase  59.56 
 
 		 501 aa  627  1e-178  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107322  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6006  glycerol kinase  58.8 
 
 		 505 aa  622  1e-177  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0794993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0284  glycerol kinase  58.42 
 
 		 498 aa  623  1e-177  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2150  glycerol kinase  59.76 
 
 		 496 aa  619  1e-176  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0240  glycerol kinase  58.37 
 
 		 503 aa  618  1e-176  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.329761  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0906  glycerol kinase  58.37 
 
 		 503 aa  618  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0246  glycerol kinase  57 
 
 		 501 aa  618  1e-176  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2452  glycerol kinase  58.37 
 
 		 518 aa  617  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0107802  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2731  glycerol kinase  58.95 
 
 		 500 aa  615  1e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1488  glycerol kinase  61.57 
 
 		 498 aa  615  1e-175  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.562917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2706  glycerol kinase  58.37 
 
 		 518 aa  617  1e-175  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2371  glycerol kinase  58.37 
 
 		 518 aa  617  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137405  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0725  glycerol kinase  58.37 
 
 		 518 aa  617  1e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.315112  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0739  glycerol kinase  58.37 
 
 		 518 aa  617  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1066  glycerol kinase  57.06 
 
 		 496 aa  611  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000818027  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2707  glycerol kinase  58.95 
 
 		 500 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.160178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0948  glycerol kinase  56.85 
 
 		 496 aa  611  9.999999999999999e-175  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000269449  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0599  glycerol kinase  58.55 
 
 		 500 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0055  glycerol kinase  60.73 
 
 		 501 aa  613  9.999999999999999e-175  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2067  glycerol kinase  58.95 
 
 		 500 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.469281  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0619  glycerol kinase  58.99 
 
 		 500 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2678  glycerol kinase  58.95 
 
 		 500 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2603  glycerol kinase  58.75 
 
 		 500 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.817773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4233  glycerol kinase  57.06 
 
 		 496 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000910223  decreased coverage  0.00000000961259 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0960  glycerol kinase  56.73 
 
 		 496 aa  609  1e-173  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0226948  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0947  glycerol kinase  56.73 
 
 		 496 aa  610  1e-173  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000337015  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0938  glycerol kinase  56.73 
 
 		 496 aa  609  1e-173  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000262863  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0727  glycerol kinase  58.1 
 
 		 513 aa  609  1e-173  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015647 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1106  glycerol kinase  56.73 
 
 		 496 aa  610  1e-173  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23662e-43 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1026  glycerol kinase  56.73 
 
 		 496 aa  609  1e-173  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000330334  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1465  glycerol kinase  60.53 
 
 		 505 aa  609  1e-173  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1242  glycerol kinase  62.96 
 
 		 497 aa  611  1e-173  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0753074  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1195  glycerol kinase  56.73 
 
 		 496 aa  610  1e-173  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000355688  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0470  glycerol kinase  58.87 
 
 		 499 aa  609  1e-173  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0078  glycerol kinase  60.92 
 
 		 507 aa  610  1e-173  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.503423  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0807  glycerol kinase  55.62 
 
 		 496 aa  606  9.999999999999999e-173  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000315642  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2987  glycerol kinase  58.59 
 
 		 498 aa  607  9.999999999999999e-173  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1020  glycerol kinase  55.78 
 
 		 497 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4230  glycerol kinase  59.1 
 
 		 494 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3399  glycerol kinase  59.76 
 
 		 497 aa  602  1.0000000000000001e-171  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.9724  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3321  glycerol kinase  57.78 
 
 		 499 aa  600  1e-170  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.24675 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0638  glycerol kinase  57.78 
 
 		 499 aa  600  1e-170  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1268  glycerol kinase  57.11 
 
 		 496 aa  600  1e-170  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000199841  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4187  glycerol kinase  58.93 
 
 		 496 aa  600  1e-170  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.324248 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0373  glycerol kinase  58.49 
 
 		 494 aa  600  1e-170  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3756  glycerol kinase  58.49 
 
 		 494 aa  599  1e-170  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0928777 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0382  glycerol kinase  60.24 
 
 		 498 aa  599  1e-170  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4681  glycerol kinase  58.94 
 
 		 494 aa  598  1e-170  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.648243  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0373  glycerol kinase  59.84 
 
 		 498 aa  595  1e-169  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.177298  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0867  glycerol kinase  55.31 
 
 		 499 aa  594  1e-169  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.111674  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0390  glycerol kinase  58.28 
 
 		 494 aa  595  1e-169  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3583  glycerol kinase  58.28 
 
 		 494 aa  597  1e-169  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0416  glycerol kinase  58.28 
 
 		 494 aa  595  1e-169  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000135699 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0419  glycerol kinase  57.26 
 
 		 499 aa  595  1e-169  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.33105 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0391  glycerol kinase  58.49 
 
 		 494 aa  595  1e-169  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2987  glycerol kinase  59.05 
 
 		 498 aa  593  1e-168  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1245  glycerol kinase  56.19 
 
 		 494 aa  592  1e-168  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4544  glycerol kinase  57.4 
 
 		 495 aa  593  1e-168  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0143138 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1063  glycerol kinase  58.47 
 
 		 503 aa  594  1e-168  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0902987  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2876  glycerol kinase  56.63 
 
 		 500 aa  593  1e-168  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2559  glycerol kinase  56.02 
 
 		 500 aa  594  1e-168  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0476  glycerol kinase  58.49 
 
 		 494 aa  593  1e-168  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0402  glycerol kinase  58.08 
 
 		 494 aa  593  1e-168  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000703202 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3334  glycerol kinase  58.85 
 
 		 498 aa  591  1e-168  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.921166  normal  0.722803 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0617  glycerol kinase  55.69 
 
 		 489 aa  590  1e-167  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3052  ATP:glycerol 3-phosphotransferase protein  59.05 
 
 		 498 aa  587  1e-166  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.155292 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2698  glycerol kinase  56.83 
 
 		 501 aa  585  1e-166  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1023  glycerol kinase  60.77 
 
 		 498 aa  585  1e-166  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2104  glycerol kinase  57.49 
 
 		 501 aa  586  1e-166  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.235028  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1315  glycerol kinase  62.55 
 
 		 495 aa  586  1e-166  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.985968 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0876  glycerol kinase  58.22 
 
 		 497 aa  585  1e-166  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0341  glycerol kinase  57.96 
 
 		 495 aa  588  1e-166  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.424974  normal  0.511119 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0328  glycerol kinase  59.23 
 
 		 497 aa  586  1e-166  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.426539  hitchhiker  0.00844444 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1075  glycerol kinase  57.29 
 
 		 499 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1125  glycerol kinase  54.79 
 
 		 510 aa  582  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000150114  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3466  glycerol kinase  57.2 
 
 		 498 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0225971  normal  0.260214 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3223  glycerol kinase  59.84 
 
 		 497 aa  584  1.0000000000000001e-165  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1116  glycerol kinase  57.29 
 
 		 499 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.151406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1359  glycerol kinase  54.9 
 
 		 498 aa  584  1.0000000000000001e-165  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00195196  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0476  glycerol kinase  58.62 
 
 		 497 aa  583  1.0000000000000001e-165  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4337  glycerol kinase  57.29 
 
 		 499 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1385  glycerol kinase  54.9 
 
 		 498 aa  584  1.0000000000000001e-165  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0514122  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3665  putative ATP:glycerol 3-phosphotransferase protein  60.61 
 
 		 499 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.10918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3525  glycerol kinase  59.84 
 
 		 499 aa  579  1e-164  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.413119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1104  glycerol kinase  56.69 
 
 		 501 aa  578  1e-164  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>