More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1847 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1847  NAD-dependent deacetylase  100 
 
 		 267 aa  546  1e-154  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.54805e-22  decreased coverage  0.00894214 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0689  NAD-dependent deacetylase  56.57 
 
 		 263 aa  289  4e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3685  NAD-dependent deacetylase  49.19 
 
 		 247 aa  234  8e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.209228  decreased coverage  0.000299877 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1704  transcriptional regulator, Sir2 family  48.98 
 
 		 248 aa  228  8e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33190  NAD-dependent deacetylase  47.39 
 
 		 254 aa  221  9.999999999999999e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48810  NAD-dependent deacetylase  46.75 
 
 		 256 aa  218  7e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.831332  hitchhiker  0.00000000423039 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4181  NAD-dependent deacetylase  46.34 
 
 		 256 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.000834887  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0202  Silent information regulator protein Sir2  37.92 
 
 		 245 aa  159  5e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000903537  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  38.04 
 
 		 251 aa  159  6e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1777  silent information regulator protein Sir2  36.29 
 
 		 242 aa  155  4e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1959  NAD-dependent deacetylase  39.59 
 
 		 269 aa  154  1e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  38.15 
 
 		 246 aa  152  5e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  35.04 
 
 		 251 aa  145  5e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0952  Silent information regulator protein Sir2  35.55 
 
 		 265 aa  145  8.000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.393847 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1593  silent information regulator protein Sir2  36.32 
 
 		 248 aa  145  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0299  silent information regulator protein Sir2  37.5 
 
 		 249 aa  143  2e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.769715 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33150  transcriptional regulator Sir2 family protein  40.94 
 
 		 243 aa  143  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419253  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05780  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  36.96 
 
 		 251 aa  142  5e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.577627 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2038  Silent information regulator protein Sir2  34.82 
 
 		 245 aa  141  9.999999999999999e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1341  silent information regulator protein Sir2  37.82 
 
 		 233 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0910  Silent information regulator protein Sir2  39.3 
 
 		 248 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.44654  hitchhiker  0.00105872 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3557  silent information regulator protein Sir2  35.08 
 
 		 244 aa  139  7e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3171  silent information regulator protein Sir2  36.73 
 
 		 249 aa  138  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1764  NAD-dependent deacetylase  35.6 
 
 		 250 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.670653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2040  silent information regulator protein Sir2  37.6 
 
 		 241 aa  135  9e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2134  NAD-dependent deacetylase  36.86 
 
 		 236 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.626555  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1881  Silent information regulator protein Sir2  39.41 
 
 		 252 aa  134  9.999999999999999e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2323  Silent information regulator protein Sir2  36.1 
 
 		 256 aa  133  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.687351  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06290  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  33.59 
 
 		 306 aa  132  6e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0975292  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0442  NAD-dependent deacetylase  35.71 
 
 		 257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.869498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4062  NAD-dependent deacetylase  37.97 
 
 		 237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4137  NAD-dependent deacetylase  37.97 
 
 		 237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4570  NAD-dependent deacetylase  36.02 
 
 		 236 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.245056 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1597  silent information regulator protein Sir2  37.13 
 
 		 244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1992  Silent information regulator protein Sir2  35.11 
 
 		 264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1145  NAD-dependent deacetylase  35.97 
 
 		 254 aa  130  3e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.350609 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1260  silent information regulator protein Sir2  35.04 
 
 		 247 aa  129  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0543594  decreased coverage  0.000122982 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1330  NAD-dependent deacetylase  33.86 
 
 		 253 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.211112  normal  0.636269 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0751  silent information regulator protein Sir2  34.27 
 
 		 248 aa  129  7.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000031386  normal  0.92086 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2090  silent information regulator protein Sir2  36.07 
 
 		 244 aa  128  9.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34038  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2495  Silent information regulator protein Sir2  34.16 
 
 		 254 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4291  NAD-dependent deacetylase  37.55 
 
 		 237 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49820  cobalamin biosynthetic protein  35.16 
 
 		 250 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0362  NAD-dependent deacetylase  34.76 
 
 		 231 aa  124  1e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2032  silent information regulator protein Sir2  32.66 
 
 		 256 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.242203  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4088  silent information regulator protein Sir2  34.38 
 
 		 244 aa  123  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000992713  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4244  cobalamin biosynthetic protein  36.07 
 
 		 250 aa  123  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11175  NAD-dependent deacetylase  35.39 
 
 		 237 aa  123  3e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0151  Silent information regulator protein Sir2  29.53 
 
 		 252 aa  122  7e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3017  silent information regulator protein Sir2  33.47 
 
 		 245 aa  122  8e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234408 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2070  silent information regulator protein Sir2  35.18 
 
 		 260 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0285  Silent information regulator protein Sir2  33.91 
 
 		 247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1478  Silent information regulator protein Sir2  32.41 
 
 		 246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0033  silent information regulator protein Sir2  33.87 
 
 		 262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.483046 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3172  silent information regulator protein Sir2  32.14 
 
 		 244 aa  120  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2228  NAD-dependent deacetylase  34.07 
 
 		 243 aa  120  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1166  Silent information regulator protein Sir2  37.05 
 
 		 249 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00563616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0687  silent information regulator protein Sir2  35.9 
 
 		 243 aa  120  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2267  NAD-dependent deacetylase  34.07 
 
 		 243 aa  120  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1904  silent information regulator protein Sir2  35.29 
 
 		 258 aa  119  6e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1594  silent information regulator protein Sir2  30.04 
 
 		 259 aa  119  7e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4420  silent information regulator protein Sir2  37.8 
 
 		 226 aa  118  7.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.910761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0265  silent information regulator protein Sir2  38.35 
 
 		 232 aa  118  9e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.708691  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2065  silent information regulator protein Sir2  32.74 
 
 		 248 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000505079  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4029  silent information regulator protein Sir2  31.27 
 
 		 279 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0118269  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3114  NAD-dependent deacetylase  30 
 
 		 242 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0364073  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2493  NAD-dependent deacetylase  30.92 
 
 		 247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2804  NAD-dependent deacetylase  30.86 
 
 		 245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0003  NAD-dependent deacetylase  34.65 
 
 		 239 aa  117  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1074  Silent information regulator protein Sir2  36.16 
 
 		 249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.269668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1261  silent information regulator protein Sir2  31.91 
 
 		 259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000136292 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5402  Sir2 family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 262 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282783 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3228  silent information regulator protein Sir2  31.48 
 
 		 273 aa  117  3e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.120892  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2718  Silent information regulator protein Sir2  38.3 
 
 		 251 aa  117  3e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.10578 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3115  NAD-dependent deacetylase  30 
 
 		 242 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4145  Silent information regulator protein Sir2  30.91 
 
 		 279 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0210  NAD-dependent deacetylase  29.43 
 
 		 268 aa  116  3.9999999999999997e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.994892 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1398  Silent information regulator protein Sir2  31.98 
 
 		 243 aa  116  3.9999999999999997e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00225806  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2874  NAD-dependent deacetylase  30.42 
 
 		 245 aa  115  5e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.84237  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3089  NAD-dependent deacetylase  30.42 
 
 		 245 aa  115  5e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152226  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2748  NAD-dependent deacetylase  35.75 
 
 		 233 aa  115  6e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.608759 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0362  Silent information regulator protein Sir2  38.89 
 
 		 246 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2348  silent information regulator protein Sir2  33.2 
 
 		 252 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3213  NAD-dependent deacetylase  37.45 
 
 		 230 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1627  Sir2 family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 255 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0457  silent information regulator protein Sir2  31.23 
 
 		 266 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.489877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3082  NAD-dependent deacetylase  29.55 
 
 		 242 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2055  NAD-dependent deacetylase  31.6 
 
 		 238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0387901  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2866  NAD-dependent deacetylase  29.55 
 
 		 241 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0601022  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4171  Silent information regulator protein Sir2  30.55 
 
 		 279 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0151723  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3095  NAD-dependent deacetylase  29.96 
 
 		 241 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1230  hypothetical protein  36.16 
 
 		 246 aa  113  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00965516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2870  silent information regulator protein Sir2  31.37 
 
 		 258 aa  113  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.921414  normal  0.0955445 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0674  NAD-dependent deacetylase  37.98 
 
 		 232 aa  113  3e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0243774  normal  0.233904 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2154  NAD-dependent deacetylase  29.55 
 
 		 242 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2843  NAD-dependent deacetylase  30 
 
 		 245 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0506229  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1797  NAD-dependent deacetylase  32.51 
 
 		 246 aa  112  6e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0601  silent information regulator protein Sir2  34.06 
 
 		 249 aa  112  6e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.496175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0067  NAD-dependent deacetylase  33.17 
 
 		 241 aa  112  7.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00122675  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2245  Silent information regulator protein Sir2  31.73 
 
 		 259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000801996  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>