54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1842 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1842  hypothetical protein  100 
 
 		 377 aa  759    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00351622  decreased coverage  0.00905598 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0682  protein of unknown function DUF214  73.02 
 
 		 378 aa  550  1e-155  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.58448  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1472  protein of unknown function DUF214  54.69 
 
 		 378 aa  432  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217651  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1260  ABC transporter, permease protein  58.22 
 
 		 360 aa  423  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.845677  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2814  hypothetical protein  55.17 
 
 		 377 aa  394  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3588  protein of unknown function DUF214  50.94 
 
 		 374 aa  386  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3638  protein of unknown function DUF214  51.74 
 
 		 374 aa  373  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0474  protein of unknown function DUF214  49.07 
 
 		 382 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0469  protein of unknown function DUF214  48.01 
 
 		 382 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0440  hypothetical protein  48.54 
 
 		 382 aa  354  1e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.147338  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1316  hypothetical protein  32.47 
 
 		 409 aa  218  2e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.058753  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2173  protein of unknown function DUF214  30 
 
 		 393 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000056003  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0511  hypothetical protein  26.87 
 
 		 388 aa  157  2e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0695  protein of unknown function DUF214  25.95 
 
 		 369 aa  150  2e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1880  acyl-[acyl-carrier-protein]--UDP-N- acetylglucosamine O-acyltransferase  24.73 
 
 		 369 aa  135  9.999999999999999e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0531667  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1578  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.1 
 
 		 417 aa  57.4  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0665062  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3204  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.02 
 
 		 427 aa  54.3  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.22882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1776  hypothetical protein  24.15 
 
 		 383 aa  50.4  0.00005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2056  protein of unknown function DUF214  26.34 
 
 		 398 aa  49.3  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.339925  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0421  protein of unknown function DUF214  26.21 
 
 		 422 aa  48.5  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.850184  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1384  hypothetical protein  25.88 
 
 		 405 aa  48.5  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3411  ABC transporter, inner membrane subunit  27.72 
 
 		 405 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108471  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0418  protein of unknown function DUF214  25.37 
 
 		 422 aa  47.4  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0611297 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0758  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25.21 
 
 		 420 aa  47.8  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00020569  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0065  hypothetical protein  30 
 
 		 381 aa  47.4  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0371  putative ABC transporter, integral membrane protein  25.19 
 
 		 422 aa  47.4  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.258896  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7003  protein of unknown function DUF214  30.18 
 
 		 423 aa  47.4  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00437024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3560  protein of unknown function DUF214  25.18 
 
 		 405 aa  47.4  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1691  protein of unknown function DUF214  23.13 
 
 		 295 aa  47  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.132145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2287  hypothetical protein  26.51 
 
 		 779 aa  47  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.112548  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2119  protein of unknown function DUF214  26 
 
 		 873 aa  47  0.0006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1581  hypothetical protein  27.31 
 
 		 384 aa  46.2  0.0008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000122912 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5303  protein of unknown function DUF214  23.51 
 
 		 830 aa  46.6  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0770  hypothetical protein  24.06 
 
 		 425 aa  45.8  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.534854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0410  hypothetical protein  21.88 
 
 		 397 aa  45.4  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0817  ABC transporter, permease protein  21.94 
 
 		 413 aa  45.1  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2306  ABC transporter permease  26.74 
 
 		 779 aa  44.7  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0912  hypothetical protein  21.47 
 
 		 416 aa  44.7  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2481  ABC transporter permease  26.74 
 
 		 779 aa  44.7  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00745912  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0823  ABC transporter, permease protein  21.94 
 
 		 422 aa  44.3  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.395922  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2502  ABC transporter, permease protein  28.42 
 
 		 735 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4409  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.59 
 
 		 433 aa  44.3  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.452061 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2274  ABC transporter, permease  28.42 
 
 		 779 aa  44.3  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000117587  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0767  integral membrane protein-permease component, involved in lipoprotein release  24.15 
 
 		 380 aa  43.9  0.005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.016013  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1371  protein of unknown function DUF214  21.7 
 
 		 386 aa  43.9  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.381039  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0948  protein of unknown function DUF214  31.86 
 
 		 797 aa  43.9  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0881  hypothetical protein  20.86 
 
 		 416 aa  43.5  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1787  protein of unknown function DUF214  25 
 
 		 379 aa  43.1  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2577  ABC transporter, permease protein  27.84 
 
 		 779 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000406057  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0916  hypothetical protein  25.53 
 
 		 385 aa  43.1  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1389  hypothetical protein  24.6 
 
 		 379 aa  43.1  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0322  hypothetical protein  22.16 
 
 		 393 aa  43.1  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2247  hypothetical protein  24.74 
 
 		 393 aa  43.1  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2063  protein of unknown function DUF214  25.52 
 
 		 397 aa  42.7  0.01  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>