42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1811 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_1811  MOSC  100 
 
 
158 aa  318  1.9999999999999998e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.98215  normal  0.190966 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1442  MOSC domain-containing protein  50.81 
 
 
158 aa  138  3.9999999999999997e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4639  MOSC domain containing protein  34.36 
 
 
163 aa  87.8  6e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3206  MOSC domain containing protein  35.67 
 
 
200 aa  85.1  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0881785  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3073  MOSC domain containing protein  34.67 
 
 
153 aa  84.3  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2516  MOSC  37.76 
 
 
165 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.406281  normal  0.326487 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1741  MOSC domain-containing protein  41.46 
 
 
153 aa  77.4  0.00000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.296315  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1758  MOSC domain containing protein  38.1 
 
 
143 aa  76.3  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.175574  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3575  hypothetical protein  37.84 
 
 
190 aa  76.3  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1526  MOSC domain containing protein  37.91 
 
 
178 aa  74.7  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1008  MOSC  35.57 
 
 
181 aa  74.3  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7200  MOSC domain-containing protein  33.8 
 
 
167 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.313237 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1460  hypothetical protein  39.1 
 
 
160 aa  70.5  0.000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4111  putative sulferase  33.33 
 
 
174 aa  69.7  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.641133  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00774  mosc  35.81 
 
 
151 aa  69.3  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00950006  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2927  hypothetical protein  37.59 
 
 
165 aa  68.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0113815  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0106  hypothetical protein  34.93 
 
 
190 aa  68.6  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2412  MOSC domain-containing protein  29.68 
 
 
162 aa  66.2  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.255229  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2906  MOSC domain containing protein  29.94 
 
 
167 aa  65.1  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4294  hypothetical protein  32.12 
 
 
197 aa  64.3  0.0000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.17157  normal  0.269993 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1459  MOSC domain-containing protein  31.94 
 
 
181 aa  62.4  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550389  normal  0.126815 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0530  alpha amylase domain-containing protein  30.2 
 
 
144 aa  60.5  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0767  MOSC domain-containing protein  32.21 
 
 
182 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4829  MOSC  33.09 
 
 
175 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142865  normal  0.399285 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0265  MOSC domain containing protein  28.48 
 
 
184 aa  57.8  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.798311  normal  0.0276593 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0791  MOSC  34.68 
 
 
177 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5926  hypothetical protein  27.56 
 
 
189 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0229267  normal  0.231206 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4831  hypothetical protein  27.74 
 
 
189 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.000000085919  hitchhiker  0.00670464 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0919  MOSC domain protein  32.26 
 
 
174 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5172  hypothetical protein  31.82 
 
 
146 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.634719  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58850  hypothetical protein  31.58 
 
 
149 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.111042 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1294  hypothetical protein  30.53 
 
 
176 aa  52  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.247549  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0082  MOSC domain-containing protein  26.44 
 
 
164 aa  52  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0358  MOSC  33.07 
 
 
155 aa  51.2  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0007  MOSC domain-containing protein  33.96 
 
 
206 aa  50.4  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.278634  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3499  hypothetical protein  30.97 
 
 
178 aa  49.3  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.70844  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0302  MOSC  30.92 
 
 
146 aa  47  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3145  MOSC domain-containing protein  31.54 
 
 
144 aa  44.3  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1160  MOSC domain containing protein  29.41 
 
 
262 aa  43.9  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.242094  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0326  MOSC domain containing protein  27.61 
 
 
149 aa  42.7  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2447  hypothetical protein  35.59 
 
 
187 aa  42.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.537217  decreased coverage  0.0000000310841 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1340  MOSC domain containing protein  27.66 
 
 
146 aa  41.2  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>