More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1809 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1809  glycine cleavage H-protein  100 
 
 		 147 aa  303  7e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0431801  normal  0.183881 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5518  hypothetical protein  32.79 
 
 		 155 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2547  glycine cleavage system H protein, putative  35.65 
 
 		 145 aa  89  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2175  glycine cleavage H-protein  35.65 
 
 		 145 aa  89  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000381106 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63370  hypothetical protein  32.79 
 
 		 155 aa  89  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.117247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2208  glycine cleavage H-protein  31.03 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0665722  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1719  glycine cleavage system H protein  34.68 
 
 		 130 aa  79.3  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.891721 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13340  glycine cleavage system H protein  33.33 
 
 		 127 aa  77.8  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1073  glycine cleavage system protein H  35.54 
 
 		 148 aa  75.9  0.0000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000237871  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0640  glycine cleavage H-protein  30.56 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0818031 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1577  glycine cleavage system H protein  34.88 
 
 		 125 aa  73.9  0.0000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.731987  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2078  glycine cleavage H-protein  35.24 
 
 		 140 aa  73.2  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3755  glycine cleavage system H protein  35.94 
 
 		 128 aa  72.4  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.301262  normal  0.144879 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1698  glycine cleavage system H protein  35.71 
 
 		 126 aa  72  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1227  glycine cleavage system H protein  36.07 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0620  glycine cleavage system protein H  34.65 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1244  glycine cleavage system protein H  31.2 
 
 		 128 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1124  glycine cleavage system H protein  29.37 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3298  glycine cleavage system H protein  33.59 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123967  normal  0.480249 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0953  glycine cleavage system protein H  30.36 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3136  glycine cleavage system protein H  29.92 
 
 		 131 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323825  normal  0.0420611 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3743  glycine cleavage system H protein  33.94 
 
 		 125 aa  68.6  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2046  glycine cleavage system protein H  33.06 
 
 		 129 aa  68.2  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2018  glycine cleavage system H protein  34.92 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.333643  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2004  glycine cleavage system H protein  31.97 
 
 		 127 aa  68.2  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.829681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2715  glycine cleavage system protein H  30.4 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2621  glycine cleavage system protein H  30.4 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233728  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2523  glycine cleavage system protein H  30.4 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.85836  normal  0.122501 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5130  glycine cleavage system protein H  35.19 
 
 		 127 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365083  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5133  glycine cleavage system protein H  35.19 
 
 		 127 aa  67  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000135708  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0960  glycine cleavage system H protein  28.57 
 
 		 130 aa  66.6  0.00000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5135  glycine cleavage system protein H  35.19 
 
 		 127 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00103553  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4859  glycine cleavage system protein H  35.19 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000908449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4700  glycine cleavage system protein H  35.19 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4716  glycine cleavage system protein H  35.19 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000916909  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1417  glycine cleavage system H protein  33.86 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5228  glycine cleavage system protein H  35.19 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000143615  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0534  glycine cleavage system H protein  36.79 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0105  glycine cleavage system protein H  35.19 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000835004  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1612  glycine cleavage system protein H  33.6 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.645617  normal  0.608002 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5097  glycine cleavage system protein H  35.19 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1055  glycine cleavage system H protein  35.25 
 
 		 131 aa  66.2  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.206037  normal  0.46199 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2714  glycine cleavage system H protein  32 
 
 		 128 aa  66.6  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0651249  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0697  glycine cleavage system protein H  32.26 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3084  glycine cleavage system protein H  33.6 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1615  glycine cleavage system protein H  33.86 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.390661 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3097  glycine cleavage system H protein  32 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.215874  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2218  glycine cleavage H-protein  32.88 
 
 		 290 aa  65.1  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000131988  hitchhiker  0.0000190613 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0973  glycine cleavage H-protein  34.75 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.714694  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13860  glycine cleavage system H protein  29.6 
 
 		 128 aa  64.7  0.0000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3845  glycine cleavage system H protein  28.57 
 
 		 128 aa  64.7  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1732  glycine cleavage H-protein  33.07 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3586  glycine cleavage system protein H  32.5 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000166607  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0152  glycine cleavage system H protein  28.57 
 
 		 130 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0985  glycine cleavage system H protein  31.3 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00310181  hitchhiker  0.00751565 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0676  glycine cleavage system H protein  30 
 
 		 127 aa  63.9  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1812  glycine cleavage system protein H  31.2 
 
 		 131 aa  63.9  0.0000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1191  glycine cleavage system protein H  30.08 
 
 		 130 aa  63.5  0.0000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4814  glycine cleavage system protein H  33.33 
 
 		 127 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00016491  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1901  glycine cleavage system H protein  27.87 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.119893  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2727  glycine cleavage system H protein  32.06 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.361268  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0591  glycine cleavage system H protein  30.95 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0600985 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0225  glycine cleavage system H protein  33.06 
 
 		 123 aa  62.8  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000351635  normal  0.835809 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2933  glycine cleavage system protein H  34.4 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00141908  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0832  glycine cleavage system protein H  31.75 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00486711  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1599  glycine cleavage system H protein  32.26 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0335982  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12390  glycine cleavage system H protein  31.36 
 
 		 123 aa  62  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00556536  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0849  glycine cleavage system protein H  31.75 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000024227  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0764  glycine cleavage system protein H  31.91 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3403  glycine cleavage system protein H  29.13 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0792246  normal  0.940944 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5357  glycine cleavage system H protein  27.2 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3127  glycine cleavage system H protein  30.65 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3004  glycine cleavage system protein H  30.95 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.655553 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0907  glycine cleavage H-protein  29.6 
 
 		 130 aa  62  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2521  glycine cleavage system H protein  30.33 
 
 		 126 aa  62  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.344987  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0339  glycine cleavage system protein H  29.46 
 
 		 130 aa  62  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000111817  normal  0.10942 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1755  glycine cleavage system protein H  29.6 
 
 		 129 aa  61.6  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.311333  normal  0.186325 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2720  glycine cleavage system protein H  29.37 
 
 		 129 aa  62  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0615009  normal  0.778842 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4142  glycine cleavage system H protein  33.66 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2869  glycine cleavage system H protein, putative  32.14 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0425  glycine cleavage system H protein  31.97 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.283149  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0131  glycine cleavage system protein H  30.84 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0116  glycine cleavage system protein H  30.84 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN00460  glycine dehydrogenase (decarboxylating), putative  30.39 
 
 		 160 aa  61.2  0.000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.528435  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0046  glycine cleavage system H protein  33.87 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.517546  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2490  glycine cleavage H-protein  32.14 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4011  glycine cleavage system H protein  31.06 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.109498  normal  0.181592 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000233  glycine cleavage system H protein  26.79 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1746  glycine cleavage H-protein  30.77 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.342973  normal  0.262336 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2284  glycine cleavage system protein H  26.98 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.31012  normal  0.75932 
 
 
-
 
NC_002950  PG0950  glycine cleavage system protein H  33.87 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.131104 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4450  glycine cleavage system H protein  33.04 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3134  glycine cleavage H-protein  30.77 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0055  glycine cleavage system protein H  30.47 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1650  glycine cleavage system protein H  32.52 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0275395  normal  0.35687 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6623  glycine cleavage system H protein  29.27 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197199 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1563  glycine cleavage system H protein  32.54 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000855574  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3608  glycine cleavage system H protein  31.5 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.039586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2021  glycine cleavage system H protein  30.16 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.132774  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2653  glycine cleavage system H protein  32.54 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000387916 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>