More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1750 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  49.87 
 
 		 765 aa  775    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1330  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  51.11 
 
 		 770 aa  790    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1599  surface antigen family outer membrane protein  42.44 
 
 		 786 aa  648    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3373  surface antigen family protein  42.64 
 
 		 787 aa  636    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.241276 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1443  surface antigen (D15)  46.01 
 
 		 758 aa  717    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.380953  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2447  OMP85 family outer membrane protein  46.74 
 
 		 796 aa  689    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.019137  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1412  putative outer membrane signal peptide protein  51.12 
 
 		 765 aa  801    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.272317 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0515  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  45.45 
 
 		 781 aa  706    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.404864 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1542  outer membrane protein  42.21 
 
 		 795 aa  655    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2047  OMP85 family outer membrane protein  52.13 
 
 		 768 aa  792    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.912739  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1547  OMP85 family outer membrane protein  52.13 
 
 		 769 aa  791    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1351  surface antigen (D15):surface antigen variable number  42.42 
 
 		 791 aa  655    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1750  surface antigen (D15):surface antigen variable number  100 
 
 		 761 aa  1551    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.330816  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4254  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  45.49 
 
 		 800 aa  724    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1873  surface antigen (D15):surface antigen variable number  51.23 
 
 		 784 aa  806    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.836752  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1167  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  44.13 
 
 		 758 aa  667    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.190139  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0793  surface antigen (D15)  56.39 
 
 		 770 aa  910    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.27416 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2385  surface antigen (D15)  42.89 
 
 		 787 aa  639    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2574  OMP85 family outer membrane protein  52.13 
 
 		 769 aa  794    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.131452  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0816  Outer membrane protein  48.43 
 
 		 766 aa  729    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.468447  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1109  surface antigen (D15)  42.01 
 
 		 796 aa  639    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2447  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  49.74 
 
 		 770 aa  768    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158511  hitchhiker  0.00286506 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2842  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  48.62 
 
 		 770 aa  749    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5321  surface antigen (D15)  50.93 
 
 		 769 aa  787    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.202175 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2577  surface antigen (D15)  49.87 
 
 		 765 aa  775    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.489897  normal  0.089041 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1319  OMP85 family outer membrane protein  52.13 
 
 		 768 aa  792    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0665  surface antigen (D15)  58.51 
 
 		 760 aa  899    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381453  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1446  surface antigen (D15)  47.49 
 
 		 765 aa  744    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.332057 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2035  OMP85 family outer membrane protein  52.13 
 
 		 768 aa  793    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139503  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3264  OMP85 family outer membrane protein  52.13 
 
 		 768 aa  792    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.337401  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2170  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  58.25 
 
 		 784 aa  914    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4178  surface antigen (D15)  42.44 
 
 		 786 aa  649    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.39317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2031  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  50.93 
 
 		 769 aa  785    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.675693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1996  surface antigen (D15)  50.93 
 
 		 779 aa  758    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.685861  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1522  surface antigen (D15)  52.79 
 
 		 790 aa  868    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0389707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2687  surface antigen (D15)  50 
 
 		 784 aa  774    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.379638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1690  putative outer membrane antigen  50.72 
 
 		 767 aa  780    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0520611  normal  0.149871 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2607  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  46.23 
 
 		 811 aa  682    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.745531  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1913  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  50.93 
 
 		 768 aa  784    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.426313 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1286  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  50.92 
 
 		 765 aa  796    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368496  normal  0.747084 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1443  surface antigen (D15)  51.43 
 
 		 791 aa  806    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680805  decreased coverage  0.000148941 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3485  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  48.63 
 
 		 769 aa  755    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935009  normal  0.0697984 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1971  putative outer membrane signal peptide protein  50.07 
 
 		 781 aa  715    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.208049  normal  0.130084 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4940  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  48.92 
 
 		 765 aa  759    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.269346  normal  0.0745121 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1265  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  51.47 
 
 		 769 aa  788    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1831  surface antigen (D15)  49.14 
 
 		 765 aa  762    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6066  surface antigen (D15)  50.8 
 
 		 769 aa  785    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298817  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2428  OMP85 family outer membrane protein  52.13 
 
 		 769 aa  794    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2118  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  50.65 
 
 		 769 aa  785    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4074  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  42.75 
 
 		 784 aa  660    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.184474 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2044  surface antigen (D15)  50.8 
 
 		 768 aa  784    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17150  putative outer membrane antigen  41.89 
 
 		 794 aa  644    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2011  surface antigen (D15)  50.8 
 
 		 769 aa  785    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1766  surface antigen (D15)  50.39 
 
 		 766 aa  773    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0726033  normal  0.0207518 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2484  OMP85 family outer membrane protein  52.13 
 
 		 768 aa  793    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1350  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  51.2 
 
 		 750 aa  793    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0760351  normal  0.942125 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1491  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  41.3 
 
 		 797 aa  640    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1154  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  42.01 
 
 		 787 aa  645    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3045  surface antigen (D15)  41.3 
 
 		 786 aa  633  1e-180  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01121  outer membrane antigen  41.54 
 
 		 788 aa  633  1e-180  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.385807  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2571  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  42.52 
 
 		 799 aa  634  1e-180  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.227309 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1257  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  41.23 
 
 		 787 aa  633  1e-180  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0901212  normal  0.632332 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1168  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  41.14 
 
 		 781 aa  629  1e-179  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1452  outer membrane protein, OMP85 family  41.14 
 
 		 781 aa  629  1e-179  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3794  surface antigen (D15):surface antigen variable number  40.7 
 
 		 790 aa  627  1e-178  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173749 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0322  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  41.39 
 
 		 784 aa  623  1e-177  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0357  outer membrane antigen  41.39 
 
 		 784 aa  624  1e-177  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.433119  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2540  surface antigen (D15)  42.36 
 
 		 772 aa  622  1e-176  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38910  surface antigen  40.4 
 
 		 792 aa  622  1e-176  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0571  surface antigen (D15)  40 
 
 		 790 aa  613  9.999999999999999e-175  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1489  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  38.41 
 
 		 780 aa  608  9.999999999999999e-173  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1458  surface antigen (D15)  39.97 
 
 		 780 aa  600  1e-170  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1855  surface antigen (D15)  41.82 
 
 		 799 aa  591  1e-167  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.8894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1280  surface antigen (D15)  39.76 
 
 		 781 aa  555  1e-156  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.359483  normal  0.823842 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1446  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  37.42 
 
 		 800 aa  544  1e-153  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0569  hypothetical protein  38.91 
 
 		 770 aa  538  1e-151  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0545  hypothetical protein  38.65 
 
 		 770 aa  538  1e-151  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2633  surface antigen (D15)  36.84 
 
 		 826 aa  532  1e-150  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000445373  normal  0.203506 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2700  surface antigen (D15)  36.84 
 
 		 826 aa  532  1e-150  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000360043  hitchhiker  0.00504138 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2589  dihydrodipicolinate synthase subfamily protein  35.5 
 
 		 896 aa  531  1e-149  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0085313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2807  surface antigen (D15)  36.71 
 
 		 826 aa  530  1e-149  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000285002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1278  surface antigen (D15)  36.96 
 
 		 763 aa  526  1e-148  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2894  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  37.05 
 
 		 826 aa  527  1e-148  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0172199  normal  0.36533 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1453  surface antigen (D15)  37.05 
 
 		 826 aa  527  1e-148  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000244779  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1489  surface antigen (D15)  37.05 
 
 		 826 aa  527  1e-148  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00390259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1356  surface antigen (D15)  36.8 
 
 		 826 aa  526  1e-148  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000205975  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1458  surface antigen (D15)  36.28 
 
 		 827 aa  525  1e-147  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000234879  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1637  surface antigen  36.68 
 
 		 826 aa  525  1e-147  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2627  surface antigen (D15)  35.51 
 
 		 827 aa  519  1e-146  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0218715  normal  0.613387 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3153  surface antigen (D15)  36.26 
 
 		 827 aa  521  1e-146  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000352533  normal  0.0112151 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3273  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  36.63 
 
 		 827 aa  521  1e-146  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000281786  hitchhiker  0.00225371 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0949  outer membrane protein assembly factor YaeT  37.64 
 
 		 809 aa  521  1e-146  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00135315  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2972  outer membrane protein assembly factor YaeT  37.56 
 
 		 807 aa  519  1e-146  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0353111  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1278  surface antigen (D15)  37 
 
 		 827 aa  521  1e-146  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00357264  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0246  outer membrane protein assembly factor YaeT  35.63 
 
 		 810 aa  516  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.24449  normal  0.197895 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1074  outer membrane protein assembly factor YaeT  35.96 
 
 		 795 aa  517  1.0000000000000001e-145  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000979052  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1843  outer membrane protein assembly factor YaeT  35.69 
 
 		 803 aa  516  1.0000000000000001e-145  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000194278  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1021  outer membrane protein assembly factor YaeT  35.96 
 
 		 795 aa  517  1.0000000000000001e-145  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000998639  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2877  surface antigen (D15)  35.54 
 
 		 827 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000948  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3427  outer membrane protein assembly factor YaeT  35.96 
 
 		 795 aa  517  1.0000000000000001e-145  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000902719  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>