More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1674 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1674  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 201 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.997457 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1250  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 		 202 aa  168  5e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3835  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 		 202 aa  168  6e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3852  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 		 202 aa  168  6e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1920  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 		 202 aa  168  6e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2686  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 		 202 aa  167  7e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0616794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1059  TetR family transcriptional regulator  45.18 
 
 		 212 aa  162  4.0000000000000004e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.659814 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3704  TetR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 202 aa  157  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3622  TetR family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 236 aa  156  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.311842  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1240  TetR family transcriptional regulator  40.53 
 
 		 201 aa  155  4e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1684  transcriptional regulator, TetR family  43.62 
 
 		 202 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1833  TetR family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 202 aa  154  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.150168  normal  0.286062 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2878  TetR family transcriptional regulator  42.41 
 
 		 202 aa  153  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1915  transcriptional regulator, TetR family  41.15 
 
 		 200 aa  152  4e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1325  transcriptional regulator, TetR family  38.34 
 
 		 203 aa  151  5e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.161657  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0144  TetR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 202 aa  150  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1926  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 202 aa  148  6e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.930045  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1283  transcriptional regulator, TetR family  42.26 
 
 		 199 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.255686  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1307  transcriptional regulator, TetR family  41.09 
 
 		 202 aa  145  4.0000000000000006e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3094  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 212 aa  141  7e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3254  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 199 aa  138  6e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1022  transcriptional regulator, TetR family  42.42 
 
 		 202 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1046  TetR family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 201 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2838  hypothetical protein  38.15 
 
 		 186 aa  99.8  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00209272 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  31.74 
 
 		 199 aa  84.7  8e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  29.47 
 
 		 200 aa  84  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 213 aa  83.2  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1362  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 139 aa  82  0.000000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0520  transcriptional regulator, TetR family  23.56 
 
 		 197 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.711752  normal  0.521102 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3410  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 196 aa  78.2  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000655293  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3302  TetR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 215 aa  77.4  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.696216 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 200 aa  77  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3709  TetR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 205 aa  75.1  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0832  transcriptional regulator, TetR family  26.55 
 
 		 196 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2178  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 181 aa  73.9  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000638624  hitchhiker  0.00000363527 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0951  TetR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 196 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1045  transcriptional regulator, TetR family  27.11 
 
 		 203 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00830488  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0223  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 195 aa  68.9  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000853805  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2593  nucleoid occlusion protein  28.83 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000323733  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0620  nucleoid occlusion protein  25.79 
 
 		 197 aa  64.7  0.0000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000140669 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0194  nucleoid occlusion protein  26.95 
 
 		 196 aa  64.3  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000213488  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001824  transcriptional regulator  26.42 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000410739  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0355  transcriptional regulator, TetR family  25.71 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3674  nucleoid occlusion protein  27.27 
 
 		 199 aa  61.2  0.000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00408157  normal  0.151909 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  22.16 
 
 		 197 aa  61.2  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1117  nucleoid occlusion protein  24.71 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.862438  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00651  nucleoid occlusion protein  26.42 
 
 		 196 aa  61.2  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1903  TetR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000201758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3007  nucleoid occlusion protein  26.98 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.8305 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3687  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  25.84 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0386851 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3114  nucleoid occlusion protein  25.86 
 
 		 221 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2484  nucleoid occlusion protein  26.01 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.11022  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3098  nucleoid occlusion protein  26.01 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170288  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  24.72 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3580  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  25.28 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.344721  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3750  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  25.28 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.833551 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6449  nucleoid occlusion protein  25.9 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.695285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00047  nucleoid occlusion protein  22.94 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4533  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0169871 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0182  nucleoid occlusion protein  24.84 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847466  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0044  nucleoid occlusion protein  25.19 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00442405  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1584  transcriptional regulator, TetR family  23.75 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3632  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 207 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3705  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 207 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3581  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  24.72 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2389  nucleoid occlusion protein  24.81 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.102395  normal  0.522775 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  23.75 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3145  nucleoid occlusion protein  26.36 
 
 		 191 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.909533  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4564  nucleoid occlusion protein  24.53 
 
 		 197 aa  53.9  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000269162  unclonable  0.0000000294752 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3502  nucleoid occlusion protein  25.84 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.284468  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3637  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.262942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3653  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  24.72 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.451581 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 		 196 aa  52.8  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0970  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0104  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 198 aa  52.8  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0058  nucleoid occlusion protein  26.85 
 
 		 198 aa  53.1  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00579463  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4158  nucleoid occlusion protein  26.85 
 
 		 198 aa  53.1  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000407134  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0052  nucleoid occlusion protein  26.85 
 
 		 198 aa  53.1  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.881528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0062  nucleoid occlusion protein  26.36 
 
 		 232 aa  52.8  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.249336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3641  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 200 aa  52.4  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.798229 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  24.28 
 
 		 194 aa  52  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0155  nucleoid occlusion protein  25.48 
 
 		 198 aa  52.4  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.894699  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0989  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 199 aa  52  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 200 aa  52  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0181  nucleoid occlusion protein  23.89 
 
 		 198 aa  51.6  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0730  TetR family transcriptional regulator  24 
 
 		 192 aa  51.6  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.110462  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0142  nucleoid occlusion protein  23.57 
 
 		 216 aa  51.6  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.219358 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1745  TetR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 216 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0141  nucleoid occlusion protein  23.85 
 
 		 219 aa  51.6  0.000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.102052  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1726  TetR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 216 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.379747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1792  TetR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 216 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.651799  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  25.47 
 
 		 194 aa  51.2  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3840  nucleoid occlusion protein  23.27 
 
 		 197 aa  51.2  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00664895  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3963  nucleoid occlusion protein  25.77 
 
 		 198 aa  51.2  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000172432  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  28.27 
 
 		 222 aa  51.2  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0382  nucleoid occlusion protein  23.4 
 
 		 197 aa  50.8  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000135011  unclonable  0.0000000000636307 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2985  nucleoid occlusion protein  25.16 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.111899  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1710  transcriptional regulator, TetR family  21.43 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0324  nucleoid occlusion protein  26.19 
 
 		 197 aa  51.2  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0385  nucleoid occlusion protein  24.41 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000224895  hitchhiker  0.00861349 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>