More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1659 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1659  histone-like DNA-binding protein  100 
 
 		 94 aa  190  5e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1281  integration host factor subunit beta  64.44 
 
 		 94 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.218086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3034  integration host factor subunit beta  63.33 
 
 		 95 aa  119  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0949718  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0926  integration host factor, beta subunit  61.11 
 
 		 95 aa  115  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00174707  normal  0.404226 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1070  integration host factor, beta subunit  61.11 
 
 		 95 aa  115  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00234309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0780  integration host factor subunit beta  60.87 
 
 		 142 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.034129 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2563  histone-like DNA-binding protein  64.84 
 
 		 126 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.160302 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0910  integration host factor subunit beta  60.87 
 
 		 138 aa  113  6.9999999999999995e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2068  integration host factor, beta subunit  58.89 
 
 		 94 aa  113  6.9999999999999995e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00010112  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0851  integration host factor subunit beta  60.87 
 
 		 142 aa  113  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.254364  normal  0.669771 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0723  integration host factor subunit beta  60.87 
 
 		 135 aa  113  7.999999999999999e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0626289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2568  integration host factor subunit beta  60.87 
 
 		 137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1648  histone-like DNA-binding protein  72.22 
 
 		 73 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.529031 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0957  integration host factor, beta subunit  55.91 
 
 		 94 aa  110  8.000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00640345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00892  integration host factor subunit beta  57.78 
 
 		 103 aa  110  8.000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0417223  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0983  integration host factor subunit beta  57.61 
 
 		 107 aa  108  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.131421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1596  integration host factor subunit beta  55.56 
 
 		 111 aa  107  4.0000000000000004e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.878202  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3000  integration host factor subunit beta  57.61 
 
 		 107 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125834  hitchhiker  0.00514155 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4161  integration host factor subunit beta  58.89 
 
 		 107 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1007  integration host factor subunit beta  58.89 
 
 		 107 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.864933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0569  integration host factor subunit beta  58.89 
 
 		 107 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1048  integration host factor subunit beta  58.89 
 
 		 107 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2256  integration host factor subunit beta  57.78 
 
 		 107 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1647  integration host factor subunit beta  56.67 
 
 		 101 aa  106  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0979657  normal  0.0681876 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0747  integration host factor subunit beta  57.61 
 
 		 107 aa  105  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1539  integration host factor subunit beta  55.56 
 
 		 104 aa  106  1e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.874704  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1213  integration host factor, beta subunit  55.91 
 
 		 98 aa  105  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0453781  normal  0.184792 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0946  integration host factor subunit beta  57.78 
 
 		 107 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.666677  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2881  integration host factor subunit beta  57.78 
 
 		 107 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0601006  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0427  integration host factor subunit beta  57.78 
 
 		 107 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.496954  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0202  integration host factor subunit beta  57.78 
 
 		 107 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2992  integration host factor subunit beta  57.78 
 
 		 107 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2944  integration host factor subunit beta  57.78 
 
 		 107 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.846703  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1639  integration host factor subunit beta  57.78 
 
 		 107 aa  105  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.79916  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0928  integration host factor subunit beta  57.78 
 
 		 107 aa  105  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.950077 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0924  integration host factor subunit beta  57.78 
 
 		 107 aa  105  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.324388  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2571  integration host factor subunit beta  57.78 
 
 		 107 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.444385  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2245  putative integration host factor beta-subunit (ihf-beta) protein  54.44 
 
 		 111 aa  104  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1788  integration host factor, beta subunit  54.44 
 
 		 104 aa  104  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000860483 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3286  histone family protein DNA-binding protein  55.43 
 
 		 109 aa  104  5e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00577956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3125  histone family protein DNA-binding protein  53.33 
 
 		 112 aa  103  6e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0598577  decreased coverage  0.00823154 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1565  histone-like DNA-binding protein  56.67 
 
 		 103 aa  103  6e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0965  integration host factor, beta subunit  54.44 
 
 		 112 aa  103  7e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0181  integration host factor, beta subunit  53.76 
 
 		 113 aa  103  8e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000858176  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2797  integration host factor, beta subunit  53.33 
 
 		 104 aa  102  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.903901  hitchhiker  0.000129709 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1411  integration host factor, beta subunit  51.11 
 
 		 95 aa  102  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00234399  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4725  integration host factor, beta subunit  53.19 
 
 		 113 aa  103  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.929388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0562  integration host factor subunit beta  52.22 
 
 		 102 aa  103  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.399271  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2336  integration host factor, beta subunit  50 
 
 		 95 aa  102  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00131749  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0501  integration host factor, beta subunit  54.44 
 
 		 114 aa  101  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.525141  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2135  hypothetical protein  51.11 
 
 		 98 aa  101  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00481013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1544  integration host factor, beta subunit  51.11 
 
 		 96 aa  100  5e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.106384  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1329  integration host factor, beta subunit  52.22 
 
 		 101 aa  100  5e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0690057  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2470  integration host factor, beta subunit  53.33 
 
 		 103 aa  100  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.391555  normal  0.36333 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1390  integration host factor, beta subunit  53.33 
 
 		 103 aa  100  5e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0244556  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1613  integration host factor, beta subunit  52.22 
 
 		 104 aa  99.4  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3223  integration host factor, beta subunit  50.54 
 
 		 102 aa  97.8  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00795206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1968  integration host factor subunit beta  49.46 
 
 		 94 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.943011  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23340  integration host factor subunit beta  49.46 
 
 		 94 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116436  hitchhiker  0.00519002 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0975  integration host factor subunit beta  51.11 
 
 		 94 aa  97.8  5e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000516669  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2222  integration host factor subunit beta  50 
 
 		 93 aa  97.4  6e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000109165  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2152  integration host factor, beta subunit  52.22 
 
 		 98 aa  97.4  6e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0462696  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0932  integration host factor subunit beta  50 
 
 		 100 aa  97.4  6e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.802461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2465  integration host factor subunit beta  51.11 
 
 		 96 aa  97.1  7e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000804162  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1028  integration host factor subunit beta  50 
 
 		 98 aa  97.1  7e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.100562  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3012  integration host factor, beta subunit  50 
 
 		 95 aa  96.3  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000121818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2074  integration host factor subunit beta  48.89 
 
 		 95 aa  96.3  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000549511  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2041  integration host factor subunit beta  48.89 
 
 		 95 aa  95.9  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000705182  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1855  integration host factor subunit beta  48.89 
 
 		 95 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.756472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1737  integration host factor subunit beta  50 
 
 		 95 aa  95.9  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122677  hitchhiker  0.00231326 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15880  integration host factor subunit beta  48.89 
 
 		 92 aa  95.5  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003021  integration host factor beta subunit  48.89 
 
 		 93 aa  95.1  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000932268  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2312  integration host factor subunit beta  48.89 
 
 		 95 aa  94.7  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000159711  hitchhiker  0.000000300932 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02859  integration host factor subunit beta  48.89 
 
 		 94 aa  95.1  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2122  integration host factor subunit beta  48.89 
 
 		 95 aa  95.1  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000593472  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2071  integration host factor subunit beta  48.89 
 
 		 95 aa  94.4  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000034854  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0905  integration host factor, beta subunit  48.39 
 
 		 101 aa  94.7  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.809702  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2401  integration host factor subunit beta  48.89 
 
 		 95 aa  94.7  4e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2278  integration host factor subunit beta  48.89 
 
 		 95 aa  94.4  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000000837765  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2395  integration host factor subunit beta  48.89 
 
 		 95 aa  94.4  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000343473  unclonable  0.00000762549 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2067  integration host factor subunit beta  48.89 
 
 		 95 aa  94.4  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000478736  unclonable  0.0000000000012991 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1978  integration host factor subunit beta  48.89 
 
 		 95 aa  94.7  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000261968  unclonable  0.000000000047672 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1754  integration host factor subunit beta  48.89 
 
 		 95 aa  94.7  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000014676  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1955  integration host factor subunit beta  48.89 
 
 		 95 aa  94.7  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000468135  unclonable  0.00000320833 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1925  integration host factor subunit beta  48.89 
 
 		 95 aa  94.7  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000515528  unclonable  0.0000000000266845 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2053  integration host factor subunit beta  48.89 
 
 		 95 aa  94.7  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000159286  unclonable  0.0000244011 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1026  integration host factor, beta subunit  48.39 
 
 		 101 aa  94.7  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00129538  unclonable  0.0000000000260989 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1307  histone family protein DNA-binding protein  51.11 
 
 		 114 aa  94.4  5e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.226884  hitchhiker  0.000000648768 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1773  integration host factor subunit beta  47.78 
 
 		 100 aa  94  6e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.976325  normal  0.0185498 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1504  integration host factor subunit beta  50 
 
 		 92 aa  94  6e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000278051  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2297  integration host factor subunit beta  47.78 
 
 		 95 aa  94  6e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000102507  unclonable  0.0000000000697895 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3941  integration host factor subunit beta  47.78 
 
 		 98 aa  94  7e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.21925 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1751  integration host factor, beta subunit  47.78 
 
 		 98 aa  93.6  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0162553  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3641  integration host factor subunit beta  47.78 
 
 		 98 aa  93.6  7e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.222556  normal  0.634422 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1365  integration host factor subunit beta  47.78 
 
 		 98 aa  94  7e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.361598  normal  0.0158973 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4060  integration host factor subunit beta  47.78 
 
 		 98 aa  93.6  7e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343947 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0262  integration host factor beta-subunit  48.89 
 
 		 112 aa  94  7e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1931  integration host factor, beta subunit  48.89 
 
 		 112 aa  92.8  1e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3026  hypothetical protein  46.67 
 
 		 103 aa  92.8  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2884  hypothetical protein  46.67 
 
 		 103 aa  92.8  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>