More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1627 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1347  fumarate hydratase class I  64.89 
 
 		 514 aa  683    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2375  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, alpha subunit  66.8 
 
 		 514 aa  713    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0191721  normal  0.43725 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6119  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, alpha subunit  67.4 
 
 		 503 aa  691    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.244405 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4902  fumarate hydratase, class I  71.68 
 
 		 507 aa  754    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0348  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  66.8 
 
 		 502 aa  708    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4454  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  71.68 
 
 		 507 aa  755    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115261 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0897  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, alpha subunit  71.68 
 
 		 507 aa  753    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728674  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38440  fumarate hydratase, class I  73.36 
 
 		 503 aa  764    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1109  fumarate hydratase  71.26 
 
 		 530 aa  766    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00489868  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1955  fumarate hydratase protein  75.29 
 
 		 507 aa  809    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.728356  normal  0.488035 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3613  putative fumarate hydratase, class I  66.27 
 
 		 507 aa  707    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.985356  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01949  fumarate hydratase, class I  66.93 
 
 		 509 aa  716    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0117439  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2222  fumarate hydratase, class I, anaerobic, putative  66.93 
 
 		 516 aa  716    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4339  fumarate hydratase, class I, putative  71.77 
 
 		 507 aa  753    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4672  fumarase  72.11 
 
 		 507 aa  754    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0151007  normal  0.629032 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2112  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  75.59 
 
 		 507 aa  793    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0775918  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1797  tartrate/fumarate family Fe-S type hydro-lyase  74.61 
 
 		 511 aa  786    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4031  Fe-S type hydro-lyase tartrate/fumarate alpha region:Fe-S type hydro-lyase tartrate/fumarate beta region  71.77 
 
 		 507 aa  753    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00228691 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1627  fumarase  100 
 
 		 510 aa  1048    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.940644  normal  0.375003 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2232  fumarase  75.1 
 
 		 507 aa  792    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.476859  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1936  tartrate/fumarate family Fe-S type hydro-lyase  74.61 
 
 		 511 aa  786    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4452  fumarase  71.68 
 
 		 507 aa  751    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.160872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5523  fumarase  75.88 
 
 		 507 aa  799    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.209704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2219  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  75.59 
 
 		 507 aa  794    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00489886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2655  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, alpha subunit  74.8 
 
 		 505 aa  798    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.226929  normal  0.206098 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2518  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, alpha subunit  71.65 
 
 		 517 aa  749    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.369793  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0974  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, alpha subunit  73.41 
 
 		 519 aa  766    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0854287  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01915  fumarate hydratase, class I  67.33 
 
 		 509 aa  705    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2227  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  68.33 
 
 		 504 aa  723    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00238187  hitchhiker  0.00748664 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1413  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, alpha subunit  75 
 
 		 507 aa  791    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0515679  normal  0.0934254 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1944  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  66.6 
 
 		 514 aa  712    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000179497  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1778  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, alpha subunit  75.88 
 
 		 511 aa  813    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.525314 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2020  tartrate/fumarate family Fe-S type hydro-lyase  74.41 
 
 		 511 aa  787    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.244289  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2102  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, alpha subunit  76.47 
 
 		 507 aa  818    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.228521  normal  0.564936 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0188  fumarase  67.92 
 
 		 507 aa  710    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2334  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  70.18 
 
 		 505 aa  734    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000449013  normal  0.0431842 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2583  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha protein  73.08 
 
 		 516 aa  776    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.604027  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0888  fumarase  68.33 
 
 		 506 aa  713    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100222  decreased coverage  0.000000142387 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2653  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, alpha subunit  83.27 
 
 		 510 aa  868    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1918  fumarase  63.35 
 
 		 542 aa  689    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2046  fumarase  73.71 
 
 		 544 aa  760    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.519105  normal  0.0269276 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3136  fumarase  74.8 
 
 		 520 aa  792    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119324  normal  0.0284437 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1912  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  68.53 
 
 		 520 aa  725    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00626493  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0922  putative fumarate hydratase, class I  66.27 
 
 		 505 aa  708    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.673761  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1834  fumarase  70.8 
 
 		 501 aa  739    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2273  fumarase  76.38 
 
 		 521 aa  811    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0060992  hitchhiker  0.00178376 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2742  fumarase  73.32 
 
 		 503 aa  785    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.993892 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0374  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  68 
 
 		 507 aa  698    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.695152 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5883  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  75.59 
 
 		 507 aa  794    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3065  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  73.57 
 
 		 508 aa  773    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.998246 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1941  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  75.2 
 
 		 507 aa  790    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.757012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1628  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  65.04 
 
 		 509 aa  703    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00231354  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1253  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, alpha subunit  68 
 
 		 503 aa  697    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00657617 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2124  fumarase  66.87 
 
 		 514 aa  712    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00166655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2200  fumarase  67.06 
 
 		 514 aa  713    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000257918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2412  fumarase  68.04 
 
 		 505 aa  696    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.2772  hitchhiker  0.00265911 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2156  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  67.33 
 
 		 525 aa  714    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00566715  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2233  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  75.79 
 
 		 507 aa  796    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.102224  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56300  putative fumarase  72.08 
 
 		 507 aa  755    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2194  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  75.59 
 
 		 507 aa  794    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1807  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  67.06 
 
 		 514 aa  710    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000176314  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1000  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  71.68 
 
 		 507 aa  754    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000213492 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00655  fumarate hydratase  75.2 
 
 		 505 aa  804    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0444664  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2302  fumarase  67.06 
 
 		 514 aa  714    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00101336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1082  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  76.18 
 
 		 507 aa  803    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0755  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, alpha subunit  75.64 
 
 		 507 aa  792    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2038  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  67.93 
 
 		 506 aa  720    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00475801  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1688  fumarate hydratase, class I, anaerobic, putative  68.33 
 
 		 511 aa  721    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.890171  normal  0.152595 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1977  fumarate hydratase  65.42 
 
 		 512 aa  694    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.146696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2035  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  68.53 
 
 		 504 aa  717    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.19234  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1139  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  77.76 
 
 		 507 aa  811    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003161  fumarate hydratase class I aerobic  67.33 
 
 		 505 aa  708    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1489  fumarase  70.84 
 
 		 519 aa  754    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0914296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2883  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  73.36 
 
 		 516 aa  759    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.234305 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1056  fumarase  73.41 
 
 		 546 aa  765    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0793  tartrate/fumarate family Fe-S type hydro-lyase  74.61 
 
 		 511 aa  786    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3214  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  71.17 
 
 		 516 aa  739    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.942506  normal  0.799174 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1382  fumarase  72.83 
 
 		 507 aa  768    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1085  tartrate/fumarate family Fe-S type hydro-lyase  74.61 
 
 		 511 aa  786    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0936  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  71.68 
 
 		 507 aa  753    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2654  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  72.05 
 
 		 517 aa  766    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0657589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3265  fumarase  71.88 
 
 		 507 aa  749    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1951  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  66.6 
 
 		 514 aa  712    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00384337  normal  0.587051 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1918  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  66.6 
 
 		 514 aa  713    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000105288  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0624  fumarate hydratase, class I  74.61 
 
 		 511 aa  786    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0527  fumarate hydratase, class I  74.61 
 
 		 511 aa  786    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2058  tartrate/fumarate family Fe-S type hydro-lyase  74.61 
 
 		 511 aa  786    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1904  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  69.12 
 
 		 507 aa  731    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000338526 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1000  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  71.65 
 
 		 530 aa  767    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.362033  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2358  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  69.32 
 
 		 512 aa  731    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00973196  hitchhiker  0.00100585 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1360  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  60.32 
 
 		 522 aa  616  1e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4119  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  60.04 
 
 		 501 aa  611  9.999999999999999e-175  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.240662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1426  hydro-lyase  55.11 
 
 		 504 aa  546  1e-154  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.74194 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0056  fumarase  52.6 
 
 		 502 aa  534  1e-150  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1708  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  32.54 
 
 		 551 aa  205  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4397  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  32.81 
 
 		 551 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.617771  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2398  fumarase alpha subunit  38.49 
 
 		 280 aa  204  3e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000179798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10050  fumarate hydratase  43.1 
 
 		 279 aa  203  6e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.146733  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1417  fumarate hydratase class I, anaerobic  31.57 
 
 		 548 aa  202  9.999999999999999e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.70407 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5483  fumarase  32.14 
 
 		 551 aa  202  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>