More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1581 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1581  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  100 
 
 		 223 aa  450  1.0000000000000001e-126  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.304003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1180  two component transcriptional regulator  52.51 
 
 		 221 aa  236  2e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3981  two component transcriptional regulator  52.97 
 
 		 230 aa  223  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4138  two component transcriptional regulator  50.43 
 
 		 239 aa  211  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.794435  hitchhiker  0.00000189778 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.25 
 
 		 220 aa  206  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1322  two component transcriptional regulator  48.93 
 
 		 239 aa  204  8e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.596062 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3523  two component transcriptional regulator  48.87 
 
 		 235 aa  202  4e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  46.33 
 
 		 220 aa  201  5e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0498  two component transcriptional regulator  46.76 
 
 		 223 aa  199  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0469  two component transcriptional regulator  47.25 
 
 		 220 aa  198  6e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601273  normal  0.0513669 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0076  two component transcriptional regulator  46.3 
 
 		 223 aa  197  9e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.225452 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0465  two component transcriptional regulator  45.95 
 
 		 229 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0429  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  47.69 
 
 		 223 aa  195  4.0000000000000005e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.199286  decreased coverage  0.000258733 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1312  transcriptional regulatory protein  43.89 
 
 		 232 aa  194  6e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0158381  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5497  DNA-binding response regulator  47.49 
 
 		 221 aa  194  8.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1372  transcriptional regulatory protein  43.89 
 
 		 223 aa  193  1e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000461157  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6288  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.27 
 
 		 224 aa  193  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0171319  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4687  two component transcriptional regulator  46.08 
 
 		 223 aa  193  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000526997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63150  two-component response regulator  47.49 
 
 		 221 aa  193  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.388672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0526  two component transcriptional regulator  45.05 
 
 		 229 aa  192  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0788787  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0136  two component transcriptional regulator  47.69 
 
 		 220 aa  192  3e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.235991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0809  DNA-binding response regulator  45.7 
 
 		 247 aa  191  5e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3354  two component transcriptional regulator  43.38 
 
 		 220 aa  192  5e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.44436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1307  two component transcriptional regulator  45.21 
 
 		 223 aa  191  7e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0973239 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3741  DNA-binding transcriptional regulator BasR  43.64 
 
 		 220 aa  191  9e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3980  DNA-binding transcriptional regulator BasR  43.64 
 
 		 220 aa  191  9e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000564215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3607  DNA-binding transcriptional regulator BasR  43.64 
 
 		 220 aa  191  9e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000202279  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2713  DNA-binding response regulator  45 
 
 		 220 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.20215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3349  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.08 
 
 		 224 aa  190  1e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.142225  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0813  DNA-binding response regulator  45.25 
 
 		 247 aa  190  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0618873  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3999  two component transcriptional regulator  46.08 
 
 		 224 aa  190  1e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.901243 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4638  two component transcriptional regulator  45.16 
 
 		 224 aa  190  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0649  two component transcriptional regulator  46.3 
 
 		 252 aa  190  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0680  two component transcriptional regulator  47.25 
 
 		 225 aa  189  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.982653 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1183  two component transcriptional regulator  45.21 
 
 		 228 aa  189  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2700  two component transcriptional regulator  45.83 
 
 		 282 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.469389  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0271  DNA-binding response regulator  45.25 
 
 		 247 aa  189  4e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2671  DNA-binding response regulator  45.25 
 
 		 247 aa  189  4e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.84234  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3958  two component transcriptional regulator  44.7 
 
 		 224 aa  189  4e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0314218 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0018  DNA-binding response regulator  45.25 
 
 		 247 aa  189  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0876  two component transcriptional regulator  45.16 
 
 		 224 aa  189  4e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478428 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3105  two component transcriptional regulator  44.95 
 
 		 219 aa  189  4e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.136173  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18630  Response regulator, two-component  44.34 
 
 		 219 aa  189  4e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0357  two component transcriptional regulator  45.62 
 
 		 226 aa  189  4e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2574  two component transcriptional regulator  45.83 
 
 		 242 aa  189  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3296  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.37 
 
 		 260 aa  189  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0174877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2042  two component transcriptional regulator  45.83 
 
 		 282 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0143055  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2405  DNA-binding response regulator  45.25 
 
 		 250 aa  189  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0552978  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2815  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  44.5 
 
 		 218 aa  188  5e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.877458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3039  two component transcriptional regulator  44.55 
 
 		 220 aa  188  5e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3950  two component transcriptional regulator  45.16 
 
 		 224 aa  188  5e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2682  two component transcriptional regulator  45.83 
 
 		 242 aa  188  5e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2653  two component transcriptional regulator  45.83 
 
 		 242 aa  188  5e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0850  DNA-binding response regulator  47.71 
 
 		 220 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0308  DNA-binding response regulator  47.71 
 
 		 220 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0845  DNA-binding response regulator  47.71 
 
 		 220 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2066  two component transcriptional regulator  45.21 
 
 		 225 aa  188  5.999999999999999e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2437  DNA-binding response regulator  47.71 
 
 		 220 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0051  DNA-binding response regulator  47.71 
 
 		 220 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3309  two component transcriptional regulator  44.09 
 
 		 220 aa  187  8e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0439  two component transcriptional regulator  45.37 
 
 		 253 aa  187  8e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3019  two component transcriptional regulator  44.09 
 
 		 220 aa  187  9e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0642  DNA-binding response regulator  45.83 
 
 		 291 aa  187  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.743353  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0670  two component transcriptional regulator  44.34 
 
 		 266 aa  187  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1255  hypothetical protein  43.56 
 
 		 225 aa  186  2e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1254  hypothetical protein  43.56 
 
 		 225 aa  186  2e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5980  two component transcriptional regulator  45.37 
 
 		 273 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0635726 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5197  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.32 
 
 		 223 aa  186  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.47869  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4177  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.27 
 
 		 223 aa  186  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.622163  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2647  two component transcriptional regulator  46.79 
 
 		 224 aa  186  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3252  two component transcriptional regulator  44.04 
 
 		 220 aa  186  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5949  two component transcriptional regulator  46.79 
 
 		 224 aa  186  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.274276 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3643  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.47 
 
 		 225 aa  186  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3792  two component transcriptional regulator  43.24 
 
 		 227 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.358087  normal  0.612342 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3341  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.01 
 
 		 225 aa  186  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.219699 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2618  two component transcriptional regulator  46.79 
 
 		 220 aa  186  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0675  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.52 
 
 		 219 aa  185  4e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1764  DNA-binding response regulator  46.3 
 
 		 224 aa  185  4e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1535  two component transcriptional regulator  43.52 
 
 		 222 aa  185  4e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2665  two component transcriptional regulator  46.33 
 
 		 220 aa  185  5e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0470  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.84 
 
 		 236 aa  184  6e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3674  two component transcriptional regulator  43.12 
 
 		 219 aa  185  6e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4334  DNA-binding transcriptional regulator QseB  43.06 
 
 		 219 aa  185  6e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0136  two component transcriptional regulator  44.09 
 
 		 220 aa  185  6e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.259962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1421  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.06 
 
 		 230 aa  184  7e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283266  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0454  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.84 
 
 		 235 aa  184  8e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1878  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  45.21 
 
 		 229 aa  183  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3459  DNA-binding transcriptional regulator QseB  43.06 
 
 		 219 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.469494  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6108  two component response regulator  41.1 
 
 		 226 aa  184  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.655098  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02897  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with QseC  43.06 
 
 		 219 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.203771  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3314  DNA-binding transcriptional regulator QseB  43.06 
 
 		 219 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.11461 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0124  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.55 
 
 		 220 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.804654  normal  0.0356027 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02847  hypothetical protein  43.06 
 
 		 219 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.196232  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0672  DNA-binding transcriptional regulator QseB  43.06 
 
 		 219 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.033173 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2384  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.53 
 
 		 219 aa  182  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23421  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3550  two component transcriptional regulator  43.24 
 
 		 227 aa  182  3e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0188344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4259  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 225 aa  182  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0673  DNA-binding response regulator  47.22 
 
 		 241 aa  182  3e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3169  two component transcriptional regulator  41.55 
 
 		 266 aa  182  3e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.121131 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0603  DNA-binding response regulator  47.22 
 
 		 283 aa  182  3e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>