20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1576 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_1576  hypothetical protein  100 
 
 
156 aa  318  1.9999999999999998e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.678852  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1816  hypothetical protein  35.54 
 
 
172 aa  88.2  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.103062  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0043  hypothetical protein  36.29 
 
 
164 aa  86.7  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.761972  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0369  hypothetical protein  29.05 
 
 
158 aa  77.8  0.00000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1271  hypothetical protein  27.52 
 
 
158 aa  64.7  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0490949  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3249  hypothetical protein  27.52 
 
 
158 aa  64.7  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00452739  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1922  hypothetical protein  28.57 
 
 
164 aa  60.1  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1390  hypothetical protein  28.08 
 
 
158 aa  60.1  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3142  hypothetical protein  31.4 
 
 
163 aa  57.8  0.00000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00589306  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0026  hypothetical protein  32.26 
 
 
137 aa  56.2  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.110544 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0782  hypothetical protein  29.91 
 
 
157 aa  53.9  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0323619  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1223  hypothetical protein  31 
 
 
283 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.147487  normal  0.808212 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0541  hypothetical protein  34.04 
 
 
163 aa  51.6  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0871  hypothetical protein  30.56 
 
 
154 aa  49.3  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1577  hypothetical protein  28.57 
 
 
130 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2229  hypothetical protein  36.67 
 
 
141 aa  47.4  0.00008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0739162  normal  0.381064 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1984  hypothetical protein  24.53 
 
 
165 aa  45.4  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000029351  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1812  hypothetical protein  28 
 
 
142 aa  41.6  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.639784  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0924  hypothetical protein  24.51 
 
 
155 aa  40.8  0.007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000155714  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0095  hypothetical protein  40.54 
 
 
140 aa  40.4  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100941  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>