13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1557 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1557  hypothetical protein  100 
 
 		 429 aa  880    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  3.4261e-20  normal  0.109896 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3156  hypothetical protein  29.35 
 
 		 442 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.469309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3752  TPR repeat-containing protein  27.83 
 
 		 473 aa  73.2  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0928  calcium-binding EF-hand  23.16 
 
 		 431 aa  66.2  0.0000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0688898  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2532  tetratricopeptide TPR_2  27.48 
 
 		 442 aa  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.101624  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2344  hypothetical protein  30.57 
 
 		 444 aa  64.3  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.95942  normal  0.269529 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1382  hypothetical protein  22.96 
 
 		 442 aa  61.6  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0975704 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2170  tetratricopeptide TPR_2  29.27 
 
 		 446 aa  60.1  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0425666  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1742  hypothetical protein  27.98 
 
 		 451 aa  58.2  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.199498 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1059  hypothetical protein  31.16 
 
 		 434 aa  51.6  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1324  hypothetical protein  27 
 
 		 457 aa  45.4  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0130583 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2347  hypothetical protein  27.85 
 
 		 458 aa  43.5  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.258493  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1114  hypothetical protein  22.14 
 
 		 442 aa  43.1  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0933696  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>