More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1528 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1528  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 298 aa  585  1e-166  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1811  transcriptional regulator, LysR family  83.84 
 
 		 297 aa  487  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.193528  hitchhiker  0.00243987 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2005  transcriptional regulator, LysR family  83.05 
 
 		 298 aa  485  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.140319 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1659  LysR family transcriptional regulator  84.07 
 
 		 314 aa  477  1e-134  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.337839  normal  0.66809 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0978  LysR family transcriptional regulator  83.56 
 
 		 298 aa  476  1e-133  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024266 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3422  LysR family transcriptional regulator  76.59 
 
 		 304 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3382  LysR family transcriptional regulator  72.54 
 
 		 295 aa  418  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1317  transcriptional regulator, LysR family  68.71 
 
 		 304 aa  393  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.631225  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2417  LysR family transcriptional regulator  58.72 
 
 		 306 aa  319  3.9999999999999996e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000194873  normal  0.0826267 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0543  LysR family transcriptional regulator  58.04 
 
 		 309 aa  300  2e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.791494  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6199  transcriptional regulator, LysR family  57.09 
 
 		 308 aa  296  2e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.2151  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4829  LysR family transcriptional regulator  48.97 
 
 		 301 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.732539 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5422  LysR family transcriptional regulator  48.97 
 
 		 295 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906945  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5440  LysR family transcriptional regulator  48.97 
 
 		 301 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.792139 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0017  LysR family transcriptional regulator  49.66 
 
 		 301 aa  270  2e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3501  LysR family transcriptional regulator  49.13 
 
 		 301 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.356591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1717  transcriptional regulator, LysR family  51.44 
 
 		 323 aa  262  4.999999999999999e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1887  transcriptional regulator, LysR family  49.83 
 
 		 321 aa  262  6e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.337699  normal  0.210949 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3409  LysR family transcriptional regulator  49.83 
 
 		 325 aa  259  3e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155989  normal  0.11434 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3916  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 		 323 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.993386  normal  0.61928 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2085  LysR family transcriptional regulator  50.5 
 
 		 325 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0073681  normal  0.210389 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2321  putative transcriptional regulator  44.52 
 
 		 319 aa  248  8e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.304743  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0399  LysR family transcriptional regulator  48.16 
 
 		 319 aa  248  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3528  LysR family transcriptional regulator  50.49 
 
 		 353 aa  246  3e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0141  LysR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 305 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3520  LysR family transcriptional regulator  49.17 
 
 		 319 aa  242  5e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.677616 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6632  LysR family transcriptional regulator  47.26 
 
 		 310 aa  241  1e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.946509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4363  LysR family transcriptional regulator  48.51 
 
 		 339 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4003  LysR family transcriptional regulator  48.51 
 
 		 339 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4455  LysR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 301 aa  229  4e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.345446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6857  LysR family transcriptional regulator  44.75 
 
 		 307 aa  228  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.561705  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2247  LysR family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 307 aa  227  2e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4578  LysR family transcriptional regulator  45.42 
 
 		 301 aa  225  9e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.166046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27440  putative transcriptional regulator  43.85 
 
 		 321 aa  224  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.016223  normal  0.601013 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1270  LysR family transcriptional regulator  44.75 
 
 		 301 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0871  LysR family transcriptional regulator  44.63 
 
 		 302 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2839  LysR family transcriptional regulator  44.22 
 
 		 300 aa  219  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3381  transcriptional regulator, LysR family  41.99 
 
 		 305 aa  216  4e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.750017  normal  0.450038 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4870  LysR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 313 aa  215  8e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  0.01712 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46370  Transcriptional regulator, LysR-family  44.67 
 
 		 307 aa  206  3e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.992428  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4909  transcriptional regulator, LysR family  44.36 
 
 		 313 aa  202  5e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.622222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1706  transcriptional regulator, LysR family  41.32 
 
 		 317 aa  201  9.999999999999999e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3329  LysR family transcriptional regulator  42.07 
 
 		 323 aa  196  3e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195009 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0459  transcriptional regulator, LysR family  39.52 
 
 		 308 aa  187  1e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00764777  normal  0.120091 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4218  transcriptional regulator, LysR family  43.91 
 
 		 300 aa  186  4e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2499  LysR family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 278 aa  183  3e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.178908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5091  transcriptional regulator, LysR family  40.28 
 
 		 328 aa  183  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.518904  normal  0.269776 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2067  transcriptional regulator, LysR family  43.64 
 
 		 307 aa  167  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2136  transcriptional regulator, LysR family  40.34 
 
 		 303 aa  165  8e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3336  transcriptional regulator, LysR family  40 
 
 		 306 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.347566 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3495  regulatory protein, LysR  34.5 
 
 		 322 aa  160  3e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.268712  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1852  transcriptional regulator, LysR family  36.52 
 
 		 314 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0106414 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1626  LysR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 329 aa  157  2e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.11884 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0979  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 301 aa  157  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00025121 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1859  LysR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 329 aa  157  2e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0738691 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0095  transcriptional regulator, LysR family  38.33 
 
 		 323 aa  157  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.329429  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0076  LysR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 323 aa  157  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2175  transcriptional regulator, LysR family  36.52 
 
 		 314 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.415931  normal  0.0244247 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0136  LysR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 333 aa  156  5.0000000000000005e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0532671 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0801  LysR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 309 aa  155  6e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3138  transcriptional regulator, LysR family protein  32.46 
 
 		 316 aa  155  9e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.27318  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4718  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  33.78 
 
 		 300 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3262  LysR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 304 aa  154  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2352  transcriptional regulator, LysR family protein  33.11 
 
 		 314 aa  154  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000117377  decreased coverage  0.00000015924 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2081  LysR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 308 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3064  LysR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 308 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.935651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3652  LysR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 314 aa  153  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0641656 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3259  LysR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 307 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.48256  normal  0.503791 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2436  LysR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 308 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2042  LysR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 314 aa  150  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.557762  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3589  LysR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 330 aa  150  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1003  LysR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 315 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0324  LysR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 323 aa  150  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0296  transcriptional regulator, LysR family protein  33.77 
 
 		 327 aa  151  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.35272  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3449  regulatory protein, LysR  37.05 
 
 		 326 aa  150  3e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5101  LysR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 315 aa  148  9e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.428224  normal  0.402017 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31560  LysR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 310 aa  148  9e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.574653  hitchhiker  0.00349034 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2440  LysR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.554767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2685  putative transcriptional regulator  31.31 
 
 		 310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0437278  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2018  transcription regulator protein  36.18 
 
 		 321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.416664  normal  0.213867 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2446  LysR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 327 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0969  LysR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.233069  normal  0.0392284 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0674  LysR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 334 aa  147  2.0000000000000003e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0775947  normal  0.69232 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2696  LysR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 322 aa  147  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0163  LysR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 432 aa  146  3e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000224126 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3385  LysR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 316 aa  147  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.521059  normal  0.192926 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20790  transcriptional regulator, LysR family  35.62 
 
 		 298 aa  146  4.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.596943  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3796  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  36.33 
 
 		 299 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027848 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2241  LysR, substrate-binding  31.65 
 
 		 309 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2111  LysR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 297 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2473  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  31.06 
 
 		 309 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470422  normal  0.100008 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4139  LysR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 323 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2235  LysR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 314 aa  144  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.130762  decreased coverage  0.000140411 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0253  LysR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 320 aa  143  3e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001991  transcriptional regulator  34.44 
 
 		 314 aa  143  4e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0253  LysR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 318 aa  142  6e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.88055 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2490  LysR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 318 aa  142  7e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.234951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3957  LysR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 322 aa  142  8e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00455  transcriptional regulator  34.44 
 
 		 341 aa  141  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1214  LysR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 314 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.134847  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>