More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1518 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1518  oxidoreductase, molybdopterin binding  100 
 
 		 263 aa  551  1e-156  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0541  oxidoreductase, molybdopterin binding  77.27 
 
 		 263 aa  445  1.0000000000000001e-124  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2592  oxidoreductase, molybdopterin binding  85.88 
 
 		 262 aa  443  1e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.938521  normal  0.743537 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding  76.89 
 
 		 263 aa  442  1e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2990  oxidoreductase molybdopterin binding  75.29 
 
 		 263 aa  412  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0297  oxidoreductase molybdopterin binding  73 
 
 		 263 aa  402  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0309  oxidoreductase molybdopterin binding  72.62 
 
 		 263 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.261244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3134  oxidoreductase molybdopterin binding  73 
 
 		 263 aa  392  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1198  oxidoreductase molybdopterin binding  71.25 
 
 		 262 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0452128  normal  0.688101 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0744  oxidoreductase, molybdopterin binding  71.25 
 
 		 262 aa  374  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1225  oxidoreductase, molybdopterin binding  71.25 
 
 		 262 aa  374  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1510  oxidoreductase molybdopterin binding  63.85 
 
 		 262 aa  373  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.832441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6422  oxidoreductase molybdopterin binding  64.79 
 
 		 263 aa  372  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.603539  normal  0.600006 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2177  putative oxidoreductase, molybdopterin binding  68.75 
 
 		 258 aa  373  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.60597 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1201  oxidoreductase molybdopterin binding protein  64.75 
 
 		 259 aa  371  1e-102  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0620  hypothetical protein  72.24 
 
 		 257 aa  368  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1108  oxidoreductase molybdopterin binding  70.42 
 
 		 262 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2666  oxidoreductase molybdopterin binding  67.76 
 
 		 263 aa  368  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2840  oxidoreductase, molybdopterin-binding  69.42 
 
 		 263 aa  362  3e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1108  oxidoreductase, molybdopterin binding  68.33 
 
 		 262 aa  358  4e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906624  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1533  oxidoreductase, molybdopterin-binding  67.77 
 
 		 263 aa  358  7e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1405  oxidoreductase, molybdopterin-binding  67.77 
 
 		 263 aa  358  7e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4334  oxidoreductase, molybdopterin binding  68.33 
 
 		 262 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.868418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0666  oxidoreductase, molybdopterin-binding  67.36 
 
 		 263 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.540729  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0486  oxidoreductase, molybdopterin-binding  67.36 
 
 		 263 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6764  oxidoreductase molybdopterin binding  67.77 
 
 		 257 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1201  oxidoreductase, molybdopterin-binding  67.36 
 
 		 263 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.463291  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1400  oxidoreductase, molybdopterin-binding  67.36 
 
 		 263 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3085  oxidoreductase, molybdopterin-binding  66.94 
 
 		 263 aa  355  2.9999999999999997e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5020  oxidoreductase molybdopterin binding  71.49 
 
 		 258 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.159564 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4930  oxidoreductase molybdopterin binding  64.05 
 
 		 258 aa  343  2e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.73484  normal  0.226199 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1752  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  62.55 
 
 		 258 aa  342  4e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175218  normal  0.213675 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1697  oxidoreductase molybdopterin binding  61.94 
 
 		 249 aa  322  3e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0333  twin-arginine translocation pathway signal  62.24 
 
 		 259 aa  320  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2751  oxidoreductase molybdopterin binding  63.76 
 
 		 249 aa  317  2e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0587289 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0487  twin-arginine translocation pathway signal  60.33 
 
 		 259 aa  316  2e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.254321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0338  putative oxidoreductase molybdopterin binding  56.82 
 
 		 260 aa  311  7.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0092485  normal  0.0273242 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3371  oxidoreductase, molybdopterin binding  58.05 
 
 		 256 aa  310  1e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0860075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0242  twin-arginine translocation pathway signal  57.44 
 
 		 259 aa  310  1e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.297118  normal  0.0333661 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3725  oxidoreductase molybdopterin binding  56.9 
 
 		 255 aa  302  4.0000000000000003e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1495  oxidoreductase molybdopterin binding  59.83 
 
 		 255 aa  300  1e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0223  oxidoreductase molybdopterin binding  56.15 
 
 		 259 aa  296  3e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.613741  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3600  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  60.28 
 
 		 215 aa  293  2e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3598  oxidoreductase, molybdopterin binding  54.88 
 
 		 261 aa  293  3e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3286  oxidoreductase molybdopterin binding  56.77 
 
 		 241 aa  291  6e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18954  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64540  hypothetical protein  60.47 
 
 		 255 aa  289  4e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5604  hypothetical protein  60.47 
 
 		 255 aa  288  7e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2994  oxidoreductase, molybdopterin binding  55.98 
 
 		 239 aa  276  2e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0961  oxidoreductase molybdopterin binding  49.59 
 
 		 263 aa  263  2e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4897  oxidoreductase molybdopterin binding  55.02 
 
 		 241 aa  261  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00490947  decreased coverage  0.000741335 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2349  hypothetical protein  39.11 
 
 		 256 aa  166  5e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.672728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3628  oxidoreductase molybdopterin binding  41.99 
 
 		 234 aa  164  9e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0640094 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2568  oxidoreductase molybdopterin binding  36.51 
 
 		 258 aa  161  9e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0385834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0015  oxidoreductase, molybdopterin-binding  37.6 
 
 		 262 aa  160  3e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.642429  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0018  oxidoreductase, molybdopterin-binding  37.6 
 
 		 262 aa  159  4e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0864  oxidoreductase molybdopterin binding  37.15 
 
 		 259 aa  158  8e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4816  oxidoreductase molybdopterin binding  35.83 
 
 		 258 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.553663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1638  oxidoreductase molybdopterin binding  39.66 
 
 		 234 aa  154  9e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.934019  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1812  oxidoreductase, molybdopterin binding  38.68 
 
 		 249 aa  154  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.218509  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0958  oxidoreductase, molybdopterin binding  37.6 
 
 		 240 aa  153  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2311  molybdopterin-binding oxidoreductase  39.66 
 
 		 234 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1625  oxidoreductase molybdopterin binding  37.5 
 
 		 256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.464814  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1560  oxidoreductase molybdopterin binding  38.36 
 
 		 234 aa  152  4e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4106  oxidoreductase molybdopterin binding  35.69 
 
 		 262 aa  150  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0563  oxidoreductase, molybdopterin binding  36 
 
 		 251 aa  149  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0491  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.96 
 
 		 256 aa  137  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.727181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4164  oxidoreductase molybdopterin binding  36.71 
 
 		 234 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.430302 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4346  oxidoreductase, molybdopterin binding  37.98 
 
 		 233 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.315393  normal  0.221875 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3845  oxidoreductase molybdopterin binding  33.74 
 
 		 247 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.624438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4154  oxidoreductase molybdopterin binding  33.33 
 
 		 247 aa  128  9.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4302  oxidoreductase molybdopterin binding  32.11 
 
 		 247 aa  123  4e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1008  oxidoreductase molybdopterin binding  29.3 
 
 		 319 aa  112  6e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.700197  normal  0.289957 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3509  oxidoreductase molybdopterin binding  30.74 
 
 		 318 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3309  oxidoreductase molybdopterin binding  40.36 
 
 		 315 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.62654 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3632  oxidoreductase molybdopterin binding  40.36 
 
 		 315 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.363586 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3943  oxidoreductase, molybdopterin binding  36.36 
 
 		 253 aa  109  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4244  oxidoreductase molybdopterin binding protein  27.73 
 
 		 266 aa  107  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.978688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0650  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.23 
 
 		 237 aa  97.4  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0972302  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  36.81 
 
 		 495 aa  95.1  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0908687  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2793  oxidoreductase molybdopterin binding  34.3 
 
 		 206 aa  92.8  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0316  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.55 
 
 		 517 aa  92.4  6e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0938  oxidoreductase molybdopterin binding protein  32.05 
 
 		 199 aa  90.1  3e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.378305  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0362  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.1 
 
 		 200 aa  89.7  4e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.659486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1086  oxidoreductase, molybdopterin binding  31.67 
 
 		 205 aa  88.2  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214927 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0428  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.8 
 
 		 230 aa  85.9  7e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0424  oxidoreductase molybdopterin binding  30.46 
 
 		 233 aa  84  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1564  putative sulfite oxidase subunit YedY  30.71 
 
 		 311 aa  83.2  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0532333  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5386  oxidoreductase molybdopterin binding protein  34.93 
 
 		 243 aa  82.8  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.406653  normal  0.237779 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0663  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.16 
 
 		 229 aa  82.4  0.000000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000387868  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2341  oxidoreductase, molybdopterin binding  28.24 
 
 		 221 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0559328  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3680  putative sulfite oxidase subunit YedY  28.84 
 
 		 331 aa  82  0.000000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0844677  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3769  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.82 
 
 		 328 aa  81.6  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6515  oxidoreductase molybdopterin binding  33.14 
 
 		 227 aa  82  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.576413  normal  0.0950137 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0775  putative sulfite oxidase subunit YedY  27.85 
 
 		 332 aa  80.9  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.746485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1013  putative sulfite oxidase subunit YedY  31.48 
 
 		 313 aa  80.5  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.300604 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3632  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.87 
 
 		 221 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7397  oxidoreductase molybdopterin binding  29.9 
 
 		 242 aa  79.7  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.71227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.61 
 
 		 501 aa  79.7  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0284  putative sulfite oxidase subunit YedY  31.68 
 
 		 331 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.212861  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3066  oxidoreductase molybdopterin binding protein  31.29 
 
 		 465 aa  79  0.00000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.419919  normal  0.473348 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>