More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1514 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_1514  Fe-S cluster assembly protein NifU  100 
 
 
298 aa  613  9.999999999999999e-175  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01620  Nitrogen fixation Fe-S cluster scaffold protein  64.05 
 
 
312 aa  402  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1508  nitrogen fixation protein nifU  60 
 
 
291 aa  379  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.63468  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1226  Fe-S cluster assembly protein NifU  60 
 
 
291 aa  379  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000342519 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3582  Fe-S cluster assembly protein NifU  52.89 
 
 
329 aa  341  8e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.370448  normal  0.0119473 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1559  Fe-S cluster assembly protein NifU  53.95 
 
 
309 aa  339  2.9999999999999998e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.746235  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0503  Fe-S cluster assembly protein NifU  57.39 
 
 
277 aa  336  3.9999999999999995e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3621  Fe-S cluster assembly protein NifU  45.26 
 
 
344 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.237955 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2363  Fe-S cluster assembly protein NifU  53.42 
 
 
296 aa  289  4e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4246  Fe-S cluster assembly protein NifU  51 
 
 
309 aa  287  2e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451507  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2648  Fe-S cluster assembly protein NifU  50 
 
 
284 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000357887 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1568  Fe-S cluster assembly protein NifU  50 
 
 
284 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000157708  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1355  Fe-S cluster assembly protein NifU  53.66 
 
 
306 aa  283  3.0000000000000004e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1832  Fe-S cluster assembly protein NifU  48.31 
 
 
286 aa  280  2e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000450727  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3915  Fe-S cluster assembly protein NifU  52.84 
 
 
300 aa  278  9e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0689  Fe-S cluster assembly protein NifU  50 
 
 
277 aa  277  2e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0701297  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3078  Fe-S cluster assembly protein NifU  50.36 
 
 
280 aa  273  3e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1784  Fe-S cluster assembly protein NifU  52.25 
 
 
294 aa  266  4e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1812  Fe-S cluster assembly protein NifU  52.25 
 
 
294 aa  266  4e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2121  Fe-S cluster assembly protein NifU  50.86 
 
 
293 aa  261  8.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.141137 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0051  Fe-S cluster assembly protein NifU  52.75 
 
 
281 aa  258  9e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2295  Fe-S cluster assembly protein NifU  51.47 
 
 
281 aa  257  2e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0101  Fe-S cluster assembly protein NifU  45.55 
 
 
283 aa  256  2e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2016  Fe-S cluster assembly protein NifU  48 
 
 
290 aa  255  5e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000826142  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2660  Fe-S cluster assembly protein NifU  51.43 
 
 
281 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.729914 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1606  Fe-S cluster assembly protein NifU  48.33 
 
 
288 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.149672  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1076  Fe-S cluster assembly protein NifU  46.43 
 
 
278 aa  252  7e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.650115  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0436  Fe-S cluster assembly protein NifU  49.45 
 
 
284 aa  249  3e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2012  NifU family protein  46.1 
 
 
285 aa  248  8e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000109359  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0991  Fe-S cluster assembly protein NifU  45.27 
 
 
286 aa  248  9e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000244062  normal  0.0771529 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2684  Fe-S cluster assembly protein NifU  50 
 
 
276 aa  246  3e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0380338 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4135  Fe-S cluster assembly protein NifU  49.15 
 
 
291 aa  236  3e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.0000225432  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1084  nitrogen-fixing NifU-like  41.69 
 
 
331 aa  235  8e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4452  nitrogen-fixing NifU-like  40.06 
 
 
338 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0980  nitrogen-fixing NifU-like protein  38.55 
 
 
333 aa  203  4e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.191022 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5090  Fe-S cluster assembly protein NifU  39.51 
 
 
328 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1697  nitrogen fixation protein NifU  36.22 
 
 
333 aa  186  3e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0518954  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0043  nitrogen fixation protein NifU  35.8 
 
 
330 aa  181  2e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1487  NifU-like protein  35.02 
 
 
323 aa  180  2e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2007  nitrogen-fixing NifU-like-like  33.54 
 
 
324 aa  178  1e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0290  NifU family protein  33.12 
 
 
323 aa  176  3e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0264  NifU family protein  33.12 
 
 
323 aa  176  3e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0237  NifU family protein  33.12 
 
 
323 aa  177  3e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1771  NifU family protein  33.33 
 
 
330 aa  174  9.999999999999999e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.630256  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1162  acetolactate synthase small subunit  32.4 
 
 
330 aa  173  1.9999999999999998e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2153  nitrogen-fixing NifU domain protein  33.64 
 
 
329 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2231  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.71 
 
 
203 aa  159  6e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2174  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.19 
 
 
203 aa  152  4e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0236  IscU protein  43.23 
 
 
203 aa  151  1e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0366  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.71 
 
 
203 aa  151  1e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.041625  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0721  nitrogen-fixing NifU-like protein  53.78 
 
 
149 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0316213  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0207  IscU protein  41.67 
 
 
203 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0533  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.93 
 
 
200 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2038  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  56.3 
 
 
142 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1754  nifU protein  56.3 
 
 
144 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00241183  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2001  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.05 
 
 
203 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.488301 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3580  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  54.62 
 
 
124 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0406  nitrogen-fixing NifU domain protein  50 
 
 
154 aa  146  5e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.54432  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1713  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  50.79 
 
 
127 aa  145  9e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000127457  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2362  NifU domain-containing protein  40.1 
 
 
203 aa  144  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.201706  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1651  nitrogen-fixing NifU-like  56.3 
 
 
125 aa  142  7e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.86354  normal  0.0135811 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0265  hypothetical protein  53.85 
 
 
143 aa  142  7e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.164856 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2214  nitrogen-fixing NifU-like  54.62 
 
 
143 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.728312 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2273  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  54.84 
 
 
124 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.913167  hitchhiker  0.00000451937 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2425  NifU protein  54.62 
 
 
129 aa  140  3e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.191396 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1298  nitrogen-fixing NifU domain protein  48.98 
 
 
153 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.114268  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1836  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  53.78 
 
 
145 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0842476 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2126  NifU domain-containing protein  48.57 
 
 
144 aa  138  1e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08890  nitrogen-fixing NifU domain protein  50 
 
 
138 aa  138  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453527  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0720  nitrogen-fixing NifU domain protein  49.6 
 
 
207 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.985893  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0531  nitrogen fixation protein  34.46 
 
 
246 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.035039  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0765  NifU domain-containing protein  52.54 
 
 
123 aa  136  4e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00307292  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1673  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  51.26 
 
 
131 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.439756  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2183  NifU domain-containing protein  34.12 
 
 
246 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.260417 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3998  FeS cluster assembly scaffold IscU  52 
 
 
132 aa  134  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0455021  hitchhiker  0.00958668 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1859  NifU-like protein  53.78 
 
 
122 aa  133  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319001  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1361  FeS cluster assembly scaffold IscU  54.92 
 
 
142 aa  133  3.9999999999999996e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0303  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  50 
 
 
137 aa  133  3.9999999999999996e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.11332  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1931  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  49.62 
 
 
153 aa  133  3.9999999999999996e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000270101  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2261  (Fe-S) cluster formation/repair protein  50.81 
 
 
138 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.516044 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2444  FeS cluster assembly scaffold IscU  50.81 
 
 
132 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.463921  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2906  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  48.31 
 
 
146 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274717  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2178  scaffold protein  53.28 
 
 
132 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00857387  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0483  scaffold protein  52.46 
 
 
128 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.360702  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2143  FeS cluster assembly scaffold IscU  50.81 
 
 
139 aa  131  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.26628  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1046  FeS cluster assembly scaffold IscU  51.61 
 
 
128 aa  131  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2143  FeS cluster assembly scaffold IscU  50 
 
 
133 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00760622 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0807  scaffold protein  48.85 
 
 
133 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00121678  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41017  Iron sulfur cluster assembly protein 1, mitochondrial precursor (Iron sulfur cluster scaffold protein 1)  51.59 
 
 
182 aa  130  2.0000000000000002e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.27253  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1488  FeS cluster assembly scaffold IscU  50.76 
 
 
134 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000147326  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1639  FeS cluster assembly scaffold IscU  50 
 
 
133 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0741  NifU domain-containing protein  50.85 
 
 
129 aa  130  3e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0206  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  48.8 
 
 
150 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00147996  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2289  scaffold protein  51.64 
 
 
133 aa  130  4.0000000000000003e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0320081  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2146  NifU domain-containing protein  50.42 
 
 
129 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.480493  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2374  FeS cluster assembly scaffold IscU  50.82 
 
 
133 aa  129  5.0000000000000004e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.161574  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1020  scaffold protein  53.28 
 
 
133 aa  129  6e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.154036  normal  0.455207 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2179  scaffold protein  50.82 
 
 
128 aa  129  7.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000106692  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2058  FeS cluster assembly scaffold IscU  53.28 
 
 
135 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.110723  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1568  scaffold protein  50.81 
 
 
150 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.497766 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>