More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1472 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1472  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 		 192 aa  389  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  51.89 
 
 		 198 aa  197  7.999999999999999e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  53.07 
 
 		 201 aa  193  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  49.15 
 
 		 203 aa  193  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  49.15 
 
 		 187 aa  193  2e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1930  electron transport protein SCO1/SenC  49.46 
 
 		 196 aa  193  2e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1635  electron transport protein SCO1/SenC  48.95 
 
 		 194 aa  191  7e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132888  normal  0.682458 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  52.54 
 
 		 203 aa  190  9e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  51.98 
 
 		 203 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0337  putative SCO1/SenC family protein  50.28 
 
 		 197 aa  188  4e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.769347  normal  0.0226866 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0192  electron transport protein SCO1/SenC  54.17 
 
 		 205 aa  187  1e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0373  lipoprotein  51.7 
 
 		 200 aa  185  3e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1255  electron transport protein SCO1/SenC  46.56 
 
 		 209 aa  185  3e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0324  electron transport protein SCO1/SenC  48.02 
 
 		 231 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1995  electron transport protein SCO1/SenC  48.45 
 
 		 197 aa  181  5.0000000000000004e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000392946 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  44.28 
 
 		 207 aa  181  8.000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  44.09 
 
 		 210 aa  180  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0436  SCO1/SenC family protein  49.44 
 
 		 181 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  46.49 
 
 		 206 aa  179  2.9999999999999997e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2860  SCO1/SenC family protein  50 
 
 		 205 aa  178  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3187  SCO1/SenC family protein  50 
 
 		 181 aa  178  4e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0500  SCO1/SenC family protein  50 
 
 		 205 aa  178  4e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0683  SCO1/SenC family protein  50 
 
 		 181 aa  178  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.744521  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1433  SCO1/SenC family protein  50 
 
 		 205 aa  178  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2753  electron transport protein SCO1/SenC  51.83 
 
 		 205 aa  178  4e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0518  SCO1/SenC family protein  50 
 
 		 205 aa  178  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.83409  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0159  SCO1/SenC family protein  50 
 
 		 205 aa  178  4e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.477348  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  47.8 
 
 		 205 aa  176  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0555  electron transport protein SCO1/SenC  48.62 
 
 		 205 aa  176  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945335  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2836  electron transport protein SCO1/SenC  50.79 
 
 		 205 aa  175  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0467  electron transport protein SCO1/SenC  51.69 
 
 		 205 aa  175  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4161  electron transport protein SCO1/SenC  48.07 
 
 		 205 aa  175  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.992536 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2223  electron transport protein SCO1/SenC  50.79 
 
 		 205 aa  175  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1998  electron transport protein SCO1/SenC  49.42 
 
 		 221 aa  175  4e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2847  electron transport protein SCO1/SenC  50.26 
 
 		 191 aa  174  6e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2893  electron transport protein SCO1/SenC  50.79 
 
 		 205 aa  174  6e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6166  electron transport protein SCO1/SenC  51.38 
 
 		 205 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.527334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0271  electron transport protein SCO1/SenC  46.86 
 
 		 204 aa  171  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  45.31 
 
 		 191 aa  171  6.999999999999999e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4381  electron transport protein SCO1/SenC  44.63 
 
 		 209 aa  170  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1683  electron transport protein SCO1/SenC  44.81 
 
 		 204 aa  167  7e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1690  electron transport protein SCO1/SenC  39.8 
 
 		 201 aa  164  9e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3829  electron transport protein SCO1/SenC  41.71 
 
 		 211 aa  152  2.9999999999999998e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.707437 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2400  electron transport protein SCO1/SenC  40.1 
 
 		 211 aa  149  2e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2982  electron transport protein SCO1/SenC  42.55 
 
 		 197 aa  149  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0335697  hitchhiker  0.000767579 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2912  electron transport protein SCO1/SenC  46.75 
 
 		 197 aa  145  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2625  electron transport protein SCO1/SenC  44.87 
 
 		 204 aa  143  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00219906  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2851  SCO1/SenC family protein  38.04 
 
 		 188 aa  137  7.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000861503  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2208  electron transport protein SCO1/SenC  39.76 
 
 		 201 aa  135  4e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0857  electron transport protein SCO1/SenC  39.31 
 
 		 208 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2149  electron transport protein SCO1/SenC  40 
 
 		 275 aa  134  9e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2285  twin-arginine translocation pathway signal  39.16 
 
 		 201 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.14309  hitchhiker  0.000889852 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3423  electron transport protein SCO1/SenC  39.47 
 
 		 198 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118762 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1986  electron transport protein SCO1/SenC  41.24 
 
 		 202 aa  132  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.963654 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3791  electron transport protein SCO1/SenC  35.93 
 
 		 264 aa  132  3e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1034  electron transport protein SCO1/SenC  38.29 
 
 		 217 aa  132  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.240451  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1038  electron transport protein SCO1/SenC  38.29 
 
 		 217 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.303988 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1240  electron transport protein SCO1/SenC  38.46 
 
 		 219 aa  131  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.637304 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2379  electron transport protein SCO1/SenC  41.24 
 
 		 223 aa  131  6e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.229264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3316  electron transport protein SCO1/SenC  41.24 
 
 		 223 aa  131  6e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.189227 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2608  Sco1/SenC family protein  38.55 
 
 		 201 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00462141  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2882  electron transport protein SCO1/SenC  37.36 
 
 		 204 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.288207 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1132  electron transport protein SCO1/SenC  38.29 
 
 		 211 aa  129  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1892  electron transport protein SCO1/SenC  40.11 
 
 		 202 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1156  electron transport protein SCO1/SenC  38.29 
 
 		 211 aa  129  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0677  electron transport protein SCO1/SenC  38.29 
 
 		 211 aa  129  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.606062  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  36.99 
 
 		 204 aa  128  7.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0144  electron transport protein SCO1/SenC  41.36 
 
 		 197 aa  127  9.000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.962644  normal  0.838775 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1751  SCO1/SenC family protein  38.2 
 
 		 218 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132366  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  38.86 
 
 		 213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3622  electron transport protein SCO1/SenC  42.76 
 
 		 200 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.847452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3960  electron transport protein SCO1/SenC  42.76 
 
 		 200 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.105512  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4268  electron transport protein SCO1/SenC  37.14 
 
 		 226 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  43.67 
 
 		 203 aa  125  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2758  SCO1/SenC family protein  37.64 
 
 		 219 aa  124  7e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2817  SCO1/SenC family protein  37.64 
 
 		 219 aa  124  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172118  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2836  SCO1/SenC family protein  37.64 
 
 		 232 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.683043  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0564  SCO1/SenC family protein  37.64 
 
 		 232 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2445  SCO1/SenC family protein  37.64 
 
 		 232 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1768  SCO1/SenC family protein  37.64 
 
 		 232 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5935  electron transport protein SCO1/SenC  39.1 
 
 		 215 aa  122  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1063  electron transport protein SCO1/SenC  41.67 
 
 		 198 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0524387 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0865  electron transport protein SCO1/SenC  36.76 
 
 		 207 aa  120  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0210  electron transport protein SCO1/SenC  38.75 
 
 		 197 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2820  electron transport protein SCO1/SenC  37.99 
 
 		 206 aa  118  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.439098  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1992  electron transport protein SCO1/SenC  32.34 
 
 		 220 aa  118  4.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  36.25 
 
 		 199 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0378  SCO1/SenC family protein  33.85 
 
 		 197 aa  117  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3935  electron transport protein SCO1/SenC  38.85 
 
 		 206 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.7944  normal  0.089928 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4303  electron transport protein SCO1/SenC  39.49 
 
 		 206 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.82674  normal  0.0643257 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  36.54 
 
 		 219 aa  115  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2853  electron transport protein SCO1/SenC  41.14 
 
 		 204 aa  115  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.500235  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  34.59 
 
 		 199 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2683  electron transport protein SCO1/SenC  33.53 
 
 		 219 aa  115  5e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1844  electron transport protein SCO1/SenC  36.94 
 
 		 185 aa  115  5e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000125528  decreased coverage  0.00834843 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0555  SCO1/SenC family protein  33.33 
 
 		 202 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.624066  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5169  electron transport protein SCO1/SenC  34.38 
 
 		 199 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0721  electron transport protein SCO1/SenC  35.62 
 
 		 196 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3618  electron transport protein SCO1/SenC  37.42 
 
 		 208 aa  114  8.999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0565663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0787  putative electron transport protein  36.25 
 
 		 197 aa  114  8.999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00305145 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>