More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1458 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1458  rhodanese-like protein  100 
 
 		 108 aa  224  3e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48690  Rhodanese-like protein with Ankyrin repeat  59.41 
 
 		 261 aa  134  4e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0470  rhodanese domain-containing protein  47.42 
 
 		 656 aa  101  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.468272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0147  rhodanese domain-containing protein  50.51 
 
 		 263 aa  95.5  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2170  putative thiosulfate sulfurtransferase  50 
 
 		 245 aa  86.3  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3834  thiosulfate sulfurtransferase  43.16 
 
 		 110 aa  80.9  0.000000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0925193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0469  rhodanese domain-containing protein  43.37 
 
 		 272 aa  80.1  0.000000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.596122 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4733  thiosulfate sulfurtransferase  41.05 
 
 		 108 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3705  thiosulfate sulfurtransferase  41.05 
 
 		 108 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.155763 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03276  thiosulfate sulfurtransferase  41.05 
 
 		 108 aa  78.2  0.00000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.757846  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0289  Rhodanese domain protein  41.05 
 
 		 108 aa  78.2  0.00000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03228  hypothetical protein  41.05 
 
 		 108 aa  78.2  0.00000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.801313  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1502  ankyrin repeat protein/rhodanese-like domain protein  42.27 
 
 		 260 aa  77.8  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1220  Rhodanese domain protein  42.27 
 
 		 260 aa  77.8  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000562605 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3622  thiosulfate sulfurtransferase  41.05 
 
 		 108 aa  78.2  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3901  thiosulfate sulfurtransferase  41.05 
 
 		 108 aa  78.2  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3807  thiosulfate sulfurtransferase  41.05 
 
 		 108 aa  77  0.00000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0289  thiosulfate sulfurtransferase  40.86 
 
 		 108 aa  77  0.00000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2117  rhodanese-like domain/ankyrin repeat-containing protein  43.53 
 
 		 254 aa  76.6  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2899  thiosulfate sulfurtransferase  36 
 
 		 107 aa  76.6  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.105523  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3726  thiosulfate sulfurtransferase  41.05 
 
 		 108 aa  76.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0099  rhodanese domain-containing protein  34.04 
 
 		 102 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.973774  normal  0.0985137 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3995  thiosulfate sulfurtransferase  40 
 
 		 109 aa  74.7  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3755  thiosulfate sulfurtransferase  40 
 
 		 109 aa  74.7  0.0000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0159  thiosulfate sulfurtransferase  40 
 
 		 109 aa  74.7  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3833  thiosulfate sulfurtransferase  40 
 
 		 108 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.851697 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3717  thiosulfate sulfurtransferase  40 
 
 		 108 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3895  thiosulfate sulfurtransferase  40 
 
 		 108 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3792  thiosulfate sulfurtransferase  40 
 
 		 108 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.332585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002142  thiosulfate sulfurtransferase GlpE  34.74 
 
 		 106 aa  72.8  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000271125  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0063  thiosulfate sulfurtransferase  38.46 
 
 		 106 aa  72  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00276  thiosulfate sulfurtransferase  34.34 
 
 		 106 aa  72.4  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0096  glpE protein  39.56 
 
 		 103 aa  72  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00139877  normal  0.0140048 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4638  thiosulfate sulfurtransferase  37.89 
 
 		 108 aa  71.2  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0923  rhodanese-like protein  28.87 
 
 		 110 aa  71.6  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0562249  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3940  rhodanese domain-containing protein  35.56 
 
 		 102 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00983264  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0429  thiosulfate sulfurtransferase  36.26 
 
 		 110 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0835156  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0398  thiosulfate sulfurtransferase  36.26 
 
 		 110 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0432  thiosulfate sulfurtransferase  36.26 
 
 		 110 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.822865  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46860  thiosulfate sulfurtransferase  36.26 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0701  thiosulfate sulfurtransferase GlpE  35.16 
 
 		 107 aa  68.2  0.00000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  3.6297700000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00068  glpE protein  37.8 
 
 		 103 aa  67.8  0.00000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0733  thiosulfate sulfurtransferase  32.98 
 
 		 110 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0289  Thiosulfate sulfurtransferase  36.84 
 
 		 106 aa  67  0.00000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4804  thiosulfate sulfurtransferase  36.26 
 
 		 109 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.598839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1461  ankyrin repeat-containing protein  44.74 
 
 		 258 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626856 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3902  rhodanese domain-containing protein  30.85 
 
 		 101 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000421055  normal  0.492067 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0337  thiosulfate:cyanide sulfurtransferase (rhodanese)  32.93 
 
 		 100 aa  66.2  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4287  Rhodanese domain protein  34.67 
 
 		 101 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.137948  hitchhiker  0.000000372785 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4342  rhodanese domain-containing protein  34.67 
 
 		 101 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00306912  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2416  thiosulfate sulfurtransferase  31.76 
 
 		 106 aa  65.5  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000293751  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3931  Thiosulfate sulfurtransferase  34.74 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4482  rhodanese domain-containing protein  34.67 
 
 		 101 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0767225  normal  0.0196392 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0056  rhodanese domain-containing protein  34.67 
 
 		 101 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000464911  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07690  thiosulfate sulfurtransferase  31.91 
 
 		 110 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0582831 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3903  rhodanese domain-containing protein  34.67 
 
 		 123 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00219695  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0105  rhodanese domain-containing protein  35.37 
 
 		 102 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.294035  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1048  rhodanese domain-containing protein  30.43 
 
 		 106 aa  64.7  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00818929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0063  rhodanese domain-containing protein  26.6 
 
 		 102 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00465337  unclonable  0.0000000104645 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4106  rhodanese domain-containing protein  29.79 
 
 		 101 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000617215  normal  0.479241 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4672  glpE protein  29.79 
 
 		 101 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4630  thiosulfate sulfurtransferase  32.97 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.432848 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2044  Rhodanese domain protein  35.37 
 
 		 114 aa  62.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3617  rhodanese-like protein  30.34 
 
 		 102 aa  62.8  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000690475  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3711  rhodanese domain-containing protein  26.6 
 
 		 101 aa  62.8  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3994  rhodanese domain-containing protein  29.79 
 
 		 101 aa  63.5  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000232889  normal  0.0196861 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4128  Thiosulfate sulfurtransferase  32.63 
 
 		 107 aa  62.8  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.801099  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0548  rhodanese-like domain protein  32.97 
 
 		 106 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5138  thiosulfate sulfurtransferase  34.07 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.945855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2350  ankyrin  43.42 
 
 		 255 aa  62  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0229  Thiosulfate sulfurtransferase  35 
 
 		 106 aa  61.2  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.369653  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0122  thiosulfate sulfurtransferase  31.18 
 
 		 108 aa  60.1  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4016  thiosulfate sulfurtransferase  32.97 
 
 		 109 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  30.53 
 
 		 480 aa  58.2  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2654  hypothetical protein  35.87 
 
 		 116 aa  58.2  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.173279  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1199  rhodanese domain-containing protein  31.33 
 
 		 282 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0177216  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3449  hypothetical protein  36 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0310387  normal  0.0600537 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2516  rhodanese-like domain-containing protein  33.33 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.890802  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0160  thiosulfate sulfurtransferase  28.42 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.460236  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51050  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  34.18 
 
 		 120 aa  55.5  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.018542  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  28.42 
 
 		 480 aa  54.7  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04370  Rhodanese-related sulfurtransferase  28.26 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155672 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1817  hypothetical protein  32.94 
 
 		 99 aa  52  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0047  rhodanese-like protein  31.91 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2561  rhodanese-like protein  32.94 
 
 		 288 aa  51.6  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1056  putative rhodanese-related sulfurtransferase  34.12 
 
 		 116 aa  52  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.218606  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3176  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 461 aa  52  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00491395  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1694  Rhodanese domain protein  31.33 
 
 		 123 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000107386 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3463  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.77 
 
 		 379 aa  51.2  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.838901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1981  rhodanese-like protein  33.33 
 
 		 140 aa  50.8  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3018  rhodanese-like protein  31.18 
 
 		 172 aa  50.8  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00360973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  29.76 
 
 		 142 aa  50.8  0.000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1676  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  28.4 
 
 		 555 aa  50.4  0.000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2117  Rhodanese domain protein  32.53 
 
 		 116 aa  50.4  0.000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  35.16 
 
 		 121 aa  50.1  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2042  rhodanese-like domain-containing protein  32.93 
 
 		 100 aa  50.1  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000168009  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2349  Rhodanese domain protein  31.46 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000398103  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  30.56 
 
 		 173 aa  49.7  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0267  beta-lactamase domain protein  38.18 
 
 		 484 aa  50.1  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.30409  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1619  beta-lactamase-like protein  29.79 
 
 		 479 aa  50.1  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000199695  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>