51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1394 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1394  NifZ  100 
 
 		 151 aa  305  2.0000000000000002e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0463497  normal  0.159008 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01680  nitrogen fixation protein NifZ  58.62 
 
 		 159 aa  174  5e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0277  NifZ family protein  56.83 
 
 		 321 aa  160  4.0000000000000004e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0714464  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0507  NifZ family protein  43.75 
 
 		 146 aa  123  8.000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1189  NifZ family protein  43.36 
 
 		 181 aa  122  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000688158 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3957  NifZ  54.79 
 
 		 95 aa  89.4  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000304465  hitchhiker  0.00212617 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4243  NifZ  54.41 
 
 		 88 aa  85.5  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1775  NifZ family protein  48.65 
 
 		 104 aa  85.1  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1803  NifZ family protein  48.65 
 
 		 104 aa  85.1  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.250711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0964  NifZ  50 
 
 		 99 aa  83.6  9e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.338549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1068  NifZ  50.63 
 
 		 99 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1371  NifZ family protein  47.5 
 
 		 95 aa  80.1  0.000000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2368  NifZ family protein  53.62 
 
 		 88 aa  80.1  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.464814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4009  NifZ family protein  53.52 
 
 		 101 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0947  NifZ family protein  43.75 
 
 		 82 aa  79  0.00000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0285448  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3599  NifZ family protein  53.52 
 
 		 107 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.416345  normal  0.0277572 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5106  NifZ family protein  52.17 
 
 		 99 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4468  NifZ  50.72 
 
 		 101 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0997  NifZ  47.06 
 
 		 97 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.334499  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4129  NifZ  40.79 
 
 		 90 aa  73.2  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5899  nitrogen fixation protein NifZ  50 
 
 		 107 aa  73.2  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0192741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1579  NifZ family protein  48.65 
 
 		 120 aa  72  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.654864 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2128  NifZ family protein  47.06 
 
 		 88 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.560071 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1573  NifZ family protein  55.38 
 
 		 92 aa  71.6  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0116  NifZ family protein  47.89 
 
 		 108 aa  69.7  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.780369 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0209  nifZ protein  45 
 
 		 106 aa  69.7  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00067923  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0401  NifZ family protein  47.83 
 
 		 111 aa  69.3  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1450  hypothetical protein  48.65 
 
 		 126 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487856 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1251  NifZ family protein  42.03 
 
 		 100 aa  68.2  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.275395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1535  NifZ domain protein  42.03 
 
 		 97 aa  68.2  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0544  nitrogen fixation protein NifZ  46.84 
 
 		 94 aa  67.4  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.563723  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2195  NifZ family protein  46.84 
 
 		 94 aa  67.4  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.458852  normal  0.730387 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3641  NifZ family protein  47.06 
 
 		 101 aa  66.2  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.175493 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1409  NifZ family protein  46.58 
 
 		 111 aa  64.3  0.0000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4479  NifZ  45.45 
 
 		 119 aa  62.8  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.248929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1243  NifZ family protein  44.3 
 
 		 94 aa  61.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.753327 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6872  NifZ family protein  38.1 
 
 		 116 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7776  NifZ family protein  41.1 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.357027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7745  NifZ family protein  41.1 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3640  NifZ family protein  40 
 
 		 79 aa  51.2  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.231555 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1536  NifZ domain protein  40.85 
 
 		 83 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1252  NifZ family protein  40.85 
 
 		 84 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0402  NifZ family protein  37.14 
 
 		 82 aa  48.5  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1580  NifZ family protein  35.37 
 
 		 103 aa  47  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.854887 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0117  NifZ family protein  37.5 
 
 		 81 aa  46.6  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.788219 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0210  nifZ protein, putative  37.68 
 
 		 89 aa  45.8  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.000650031  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5898  hypothetical protein  36.62 
 
 		 82 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00590287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4467  NifZ  32.86 
 
 		 76 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0965  NifZ  33.75 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.201713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5105  NifZ family protein  30.56 
 
 		 77 aa  41.2  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1069  hypothetical protein  31.43 
 
 		 85 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>