More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1358 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_1358  Rieske (2Fe-2S) region  100 
 
 
451 aa  941    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  1.7533999999999998e-22  hitchhiker  0.0000112258 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2454  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  65.78 
 
 
421 aa  604  9.999999999999999e-173  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000486629  normal  0.341461 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3225  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  46.7 
 
 
412 aa  360  2e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0731874  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3224  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  43.42 
 
 
411 aa  358  1.9999999999999998e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.841797  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5962  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.54 
 
 
373 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.314282  normal  0.602397 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5718  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.54 
 
 
373 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.592667 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1812  Rieske (2Fe-2S) region  31.18 
 
 
383 aa  83.6  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0372125 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6662  dioxygenase, iron-sulfur subunit  39.64 
 
 
371 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0364205  normal  0.0470201 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1589  Rieske (2Fe-2S) region  39.64 
 
 
371 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.577114  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6718  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.64 
 
 
371 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6242  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.64 
 
 
371 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.718979  normal  0.984052 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3984  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.77 
 
 
356 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.643695  normal  0.0193847 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5354  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.89 
 
 
370 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.111829  normal  0.289416 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1676  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.92 
 
 
349 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.945696  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1649  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.92 
 
 
370 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0203  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.65 
 
 
406 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3570  Rieske (2Fe-2S) region  33.33 
 
 
355 aa  75.5  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0161982  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4510  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.64 
 
 
355 aa  73.9  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4642  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.64 
 
 
355 aa  73.9  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.44027  normal  0.0329483 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7085  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.57 
 
 
406 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4103  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.22 
 
 
374 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1235  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.08 
 
 
349 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3658  Rieske (2Fe-2S) region  32 
 
 
356 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4709  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32 
 
 
356 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700082  normal  0.155037 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1336  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  34.71 
 
 
355 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4835  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2494  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  34.71 
 
 
355 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1501  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  34.71 
 
 
355 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0319  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  34.71 
 
 
355 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.456896  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1307  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  34.71 
 
 
355 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.992701  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1234  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  34.71 
 
 
355 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0595  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  34.71 
 
 
355 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0958903  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0972  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  34.71 
 
 
355 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0175  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  38.52 
 
 
363 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4992  Rieske (2Fe-2S) region  36.04 
 
 
366 aa  70.9  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1105  Rieske (2Fe-2S) protein  32.85 
 
 
358 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.080608  normal  0.368914 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7059  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.36 
 
 
364 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.2387  normal  0.465604 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5591  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.33 
 
 
356 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00790855 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3967  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.14 
 
 
347 aa  68.6  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2035  hypothetical protein  34.92 
 
 
345 aa  68.9  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4103  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.12 
 
 
356 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.119091 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4233  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.06 
 
 
362 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4568  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.12 
 
 
356 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.380862  hitchhiker  0.000303241 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2137  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.87 
 
 
450 aa  67.8  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1130  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.43 
 
 
362 aa  67  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0812255  normal  0.937672 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0741  Rieske (2Fe-2S) protein  33.87 
 
 
382 aa  67  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0606248 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0787  Rieske (2Fe-2S) protein  32.79 
 
 
351 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.466147 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2482  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.59 
 
 
362 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3671  oxidoreductase alpha subunit  29.32 
 
 
407 aa  66.2  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0725789  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0132  Rieske (2Fe-2S) protein  34.59 
 
 
343 aa  65.9  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3574  Rieske (2Fe-2S) region  38.74 
 
 
349 aa  66.2  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1103  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.22 
 
 
362 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1687  vanillate monooxygenase  37.5 
 
 
338 aa  65.1  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3626  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.14 
 
 
362 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.54925  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1064  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.6 
 
 
387 aa  64.7  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6610  vanillate demethylase oxygenase subunit  32.28 
 
 
380 aa  64.3  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581564  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4257  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.62 
 
 
349 aa  63.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4895  Vanillate monooxygenase  35.16 
 
 
336 aa  63.5  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.802026  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1352  vanillate monooxygenase  34.15 
 
 
363 aa  63.5  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3246  vanillate monooxygenase  38.1 
 
 
347 aa  62.8  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.546586  normal  0.604076 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0396  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.78 
 
 
360 aa  62.8  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.547393 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43309  predicted protein  27.18 
 
 
492 aa  62.8  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.231154  hitchhiker  0.00124797 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2725  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.43 
 
 
354 aa  62.4  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0149406 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1335  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.04 
 
 
351 aa  62  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.819447 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2036  hypothetical protein  29.57 
 
 
334 aa  62.4  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.502892  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2825  iron-sulfur cluster-binding protein, Rieske family  26.4 
 
 
358 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000971916  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2074  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.85 
 
 
217 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.12491  normal  0.0463704 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1459  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.23 
 
 
357 aa  60.8  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0280358  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2087  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.65 
 
 
118 aa  60.5  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.72518 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4461  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.31 
 
 
216 aa  60.5  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.408386  normal  0.0170957 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5422  oxidoreductase protein  32.31 
 
 
230 aa  60.5  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1535  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.58 
 
 
331 aa  60.1  0.00000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1485  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.94 
 
 
343 aa  59.7  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3160  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.65 
 
 
347 aa  59.7  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1662  Rieske (2Fe-2S) protein  41.33 
 
 
125 aa  59.7  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.282248  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4516  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.1 
 
 
373 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1530  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.94 
 
 
450 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1557  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.94 
 
 
450 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0276963  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1185  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.8 
 
 
364 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1827  Rieske (2Fe-2S) region  33.04 
 
 
347 aa  58.9  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3681  Rieske (2Fe-2S) region  32.21 
 
 
346 aa  58.9  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.2267  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1184  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.91 
 
 
358 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5800  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.2 
 
 
354 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00198597 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3714  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.85 
 
 
434 aa  58.9  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.162257  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1550  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
353 aa  58.2  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276626  normal  0.0604744 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3416  vanillate monooxygenase  25.6 
 
 
342 aa  57.8  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0799476 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1985  putative dioxygenase  40.3 
 
 
110 aa  57.8  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.51691  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4769  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  32.23 
 
 
367 aa  57.8  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.289545  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0344  Rieske (2Fe-2S) protein  34.65 
 
 
353 aa  57.8  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5693  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.22 
 
 
352 aa  57.4  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3413  vanillate monooxygenase  32.26 
 
 
345 aa  57.4  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6324  phthalate 4,5-dioxygenase  22.12 
 
 
437 aa  57  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1389  putative oxygenase  27.78 
 
 
359 aa  57  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6469  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.77 
 
 
217 aa  56.6  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1549  vanillate monooxygenase  27.17 
 
 
359 aa  56.6  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.619122  normal  0.0130812 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0630  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.93 
 
 
353 aa  56.6  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.494266  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4861  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.53 
 
 
365 aa  56.6  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.641783  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2355  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.28 
 
 
349 aa  56.6  0.0000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.725754  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3689  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.75 
 
 
434 aa  56.2  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3024  vanillate monooxygenase  29.15 
 
 
361 aa  55.8  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3119  vanillate monooxygenase  27.91 
 
 
358 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>